基因页:SFRP2
Summary?
基因 | 6423 |
象征 | SFRP2 |
同义词 | FRP-2 | SARP1 | SDF-5 |
描述 | 分泌的卷曲相关蛋白2 |
参考 | MIM:604157|HGNC:HGNC:10777|ENSEMBL:ENSG00000145423|HPRD:16041|Vega:Otthumg00000161559 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4q31.3 |
Pascal P值 | 0.006 |
主持人 | 米yers' cis & trans |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS954368 | CHR4 | 154771775 | SFRP2 | 6423 | 0.07 | 顺式 | ||
RS6820559 | CHR4 | 154813698 | SFRP2 | 6423 | 0.03 | 顺式 | ||
RS17131472 | CHR1 | 91962966 | SFRP2 | 6423 | 3.305E-4 | 反式 | ||
RS546975 | CHR1 | 91963738 | SFRP2 | 6423 | 0.13 | 反式 | ||
RS10218671 | CHR1 | 158362552 | SFRP2 | 6423 | 0.18 | 反式 | ||
rs1835319 | CHR2 | 16586056 | SFRP2 | 6423 | 0.05 | 反式 | ||
RS6710894 | CHR2 | 66876700 | SFRP2 | 6423 | 0.16 | 反式 | ||
RS17821815 | CHR2 | 119018522 | SFRP2 | 6423 | 0.01 | 反式 | ||
RS2115055 | CHR2 | 119478688 | SFRP2 | 6423 | 0.14 | 反式 | ||
RS11679772 | CHR2 | 158292302 | SFRP2 | 6423 | 0.19 | 反式 | ||
RS1691463 | CHR3 | 84914366 | SFRP2 | 6423 | 0.07 | 反式 | ||
RS2922180 | CHR3 | 125280472 | SFRP2 | 6423 | 5.172E-8 | 反式 | ||
rs2971271 | CHR3 | 125450402 | SFRP2 | 6423 | 0.08 | 反式 | ||
RS2976809 | CHR3 | 125451738 | SFRP2 | 6423 | 1.059E-5 | 反式 | ||
RS16889842 | CHR4 | 9872012 | SFRP2 | 6423 | 0.05 | 反式 | ||
RS17776097 | CHR4 | 90247162 | SFRP2 | 6423 | 0.19 | 反式 | ||
RS4033102 | CHR4 | 111784204 | SFRP2 | 6423 | 0.03 | 反式 | ||
RS509952 | CHR4 | 111788169 | SFRP2 | 6423 | 0.02 | 反式 | ||
rs313946 | CHR4 | 113975904 | SFRP2 | 6423 | 0.01 | 反式 | ||
RS10050805 | CHR5 | 30805352 | SFRP2 | 6423 | 0.01 | 反式 | ||
RS16894149 | CHR5 | 61013724 | SFRP2 | 6423 | 0.15 | 反式 | ||
RS17143695 | CHR5 | 117520843 | SFRP2 | 6423 | 0.14 | 反式 | ||
RS6874540 | CHR5 | 149911669 | SFRP2 | 6423 | 0.15 | 反式 | ||
RS2273232 | CHR5 | 149912526 | SFRP2 | 6423 | 0.15 | 反式 | ||
RS11954814 | CHR5 | 155088338 | SFRP2 | 6423 | 0.12 | 反式 | ||
rs17056435 | CHR5 | 158453782 | SFRP2 | 6423 | 2.686E-4 | 反式 | ||
RS12663807 | CHR6 | 40571873 | SFRP2 | 6423 | 0.02 | 反式 | ||
RS6920042 | CHR6 | 67907570 | SFRP2 | 6423 | 0.16 | 反式 | ||
RS6455226 | CHR6 | 67930295 | SFRP2 | 6423 | 0 | 反式 | ||
RS16868852 | CHR6 | 70980333 | SFRP2 | 6423 | 0.18 | 反式 | ||
RS283058 | CHR6 | 118625224 | SFRP2 | 6423 | 0 | 反式 | ||
RS12216440 | CHR6 | 118856821 | SFRP2 | 6423 | 0.11 | 反式 | ||
RS2056744 | CHR6 | 144952933 | SFRP2 | 6423 | 0.12 | 反式 | ||
RS2430483 | CHR7 | 104548631 | SFRP2 | 6423 | 0.01 | 反式 | ||
rs10273901 | CHR7 | 131828566 | SFRP2 | 6423 | 0.13 | 反式 | ||
RS2199402 | CHR8 | 9201002 | SFRP2 | 6423 | 0.06 | 反式 | ||
RS7841407 | CHR8 | 9243427 | SFRP2 | 6423 | 0 | 反式 | ||
RS2739708 | CHR8 | 17992280 | SFRP2 | 6423 | 0.03 | 反式 | ||
RS714131 | CHR8 | 17992832 | SFRP2 | 6423 | 0.09 | 反式 | ||
RS2739726 | CHR8 | 17998576 | SFRP2 | 6423 | 0.02 | 反式 | ||
RS2919377 | CHR8 | 32573740 | SFRP2 | 6423 | 0.01 | 反式 | ||
RS680372 | CHR8 | 36999626 | SFRP2 | 6423 | 0.19 | 反式 | ||
RS7850851 | Chr9 | 37928770 | SFRP2 | 6423 | 0.12 | 反式 | ||
rs2253777 | Chr9 | 93467893 | SFRP2 | 6423 | 0.04 | 反式 | ||
RS998410 | Chr9 | 117622673 | SFRP2 | 6423 | 0.09 | 反式 | ||
RS9423711 | Chr10 | 2574802 | SFRP2 | 6423 | 2.521E-6 | 反式 | ||
rs2388266 | Chr10 | 2595037 | SFRP2 | 6423 | 0.1 | 反式 | ||
RS651134 | Chr10 | 27549960 | SFRP2 | 6423 | 0.09 | 反式 | ||
RS748375 | Chr10 | 33440178 | SFRP2 | 6423 | 0.08 | 反式 | ||
RS4514358 | Chr10 | 43861923 | SFRP2 | 6423 | 0.02 | 反式 | ||
RS7081666 | Chr10 | 47673800 | SFRP2 | 6423 | 0.01 | 反式 | ||
RS10488758 | Chr11 | 103493095 | SFRP2 | 6423 | 0.09 | 反式 | ||
RS1905067 | Chr11 | 103493989 | SFRP2 | 6423 | 0.15 | 反式 | ||
rs11225990 | Chr11 | 103608380 | SFRP2 | 6423 | 0.1 | 反式 | ||
RS2305164 | CHR12 | 365649 | SFRP2 | 6423 | 0.03 | 反式 | ||
RS10747972 | 0 | SFRP2 | 6423 | 0.18 | 反式 | |||
RS995817 | CHR12 | 67557935 | SFRP2 | 6423 | 0.15 | 反式 | ||
RS10879027 | CHR12 | 70237156 | SFRP2 | 6423 | 2.408E-4 | 反式 | ||
RS11112163 | CHR12 | 105072508 | SFRP2 | 6423 | 0.16 | 反式 | ||
rs17080889 | CHR13 | 20939135 | SFRP2 | 6423 | 0.17 | 反式 | ||
rs9551590 | CHR13 | 29589464 | SFRP2 | 6423 | 0.04 | 反式 | ||
RS9532792 | CHR13 | 41912654 | SFRP2 | 6423 | 0.15 | 反式 | ||
RS9590586 | CHR13 | 41913130 | SFRP2 | 6423 | 0.17 | 反式 | ||
RS7358853 | CHR13 | 41931685 | SFRP2 | 6423 | 0.19 | 反式 | ||
RS8002343 | CHR13 | 41952090 | SFRP2 | 6423 | 0.17 | 反式 | ||
RS9315839 | CHR13 | 41952872 | SFRP2 | 6423 | 0.19 | 反式 | ||
RS7982172 | CHR13 | 41969697 | SFRP2 | 6423 | 0.16 | 反式 | ||
RS4942043 | CHR13 | 41978218 | SFRP2 | 6423 | 0.03 | 反式 | ||
RS4402447 | CHR13 | 41984741 | SFRP2 | 6423 | 0.16 | 反式 | ||
RS7982922 | CHR13 | 43873335 | SFRP2 | 6423 | 0.18 | 反式 | ||
RS9529974 | CHR13 | 72821935 | SFRP2 | 6423 | 3.814e-4 | 反式 | ||
RS17073665 | CHR13 | 81541961 | SFRP2 | 6423 | 0 | 反式 | ||
RS11840833 | CHR13 | 94378306 | SFRP2 | 6423 | 0.01 | 反式 | ||
RS16975617 | CHR13 | 110867407 | SFRP2 | 6423 | 0.06 | 反式 | ||
RS10142086 | CHR14 | 35135892 | SFRP2 | 6423 | 0.15 | 反式 | ||
RS1956517 | CHR14 | 37738426 | SFRP2 | 6423 | 0.12 | 反式 | ||
RS1457420 | CHR14 | 66958675 | SFRP2 | 6423 | 0.12 | 反式 | ||
RS2093759 | CHR14 | 97171024 | SFRP2 | 6423 | 0 | 反式 | ||
rs17244419 | CHR14 | 97171074 | SFRP2 | 6423 | 4.182E-5 | 反式 | ||
RS7177212 | CHR15 | 34425413 | SFRP2 | 6423 | 0.19 | 反式 | ||
RS16976022 | CHR15 | 55454260 | SFRP2 | 6423 | 0.07 | 反式 | ||
RS16976029 | CHR15 | 55455268 | SFRP2 | 6423 | 0.03 | 反式 | ||
RS16976036 | CHR15 | 55456921 | SFRP2 | 6423 | 0.04 | 反式 | ||
RS8034402 | CHR15 | 55480932 | SFRP2 | 6423 | 0.1 | 反式 | ||
rs11073814 | CHR15 | 89378883 | SFRP2 | 6423 | 0.18 | 反式 | ||
RS7165622 | CHR15 | 93979910 | SFRP2 | 6423 | 0.1 | 反式 | ||
RS13380712 | CHR16 | 25601181 | SFRP2 | 6423 | 0.04 | 反式 | ||
RS17841422 | CHR17 | 20969134 | SFRP2 | 6423 | 0 | 反式 | ||
RS16977927 | CHR17 | 72154232 | SFRP2 | 6423 | 0.05 | 反式 | ||
RS16940550 | CHR18 | 13442256 | SFRP2 | 6423 | 0.19 | 反式 | ||
RS7236104 | CHR18 | 14032818 | SFRP2 | 6423 | 0.14 | 反式 | ||
RS9949772 | CHR18 | 31042632 | SFRP2 | 6423 | 0.1 | 反式 | ||
RS7236407 | CHR18 | 47827597 | SFRP2 | 6423 | 0.1 | 反式 | ||
RS4987765 | CHR18 | 60905021 | SFRP2 | 6423 | 0.06 | 反式 | ||
RS11873703 | CHR18 | 61448702 | SFRP2 | 6423 | 6.602E-6 | 反式 | ||
RS6095741 | CHR20 | 48666589 | SFRP2 | 6423 | 1.186E-10 | 反式 | ||
RS6004906 | CHR22 | 26434554 | SFRP2 | 6423 | 0.04 | 反式 | ||
RS6000401 | CHR22 | 37149335 | SFRP2 | 6423 | 0.13 | 反式 | ||
RS5991662 | Chrx | 43335796 | SFRP2 | 6423 | 5.443e-5 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SFRP2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。