Summary
基因 6423
象征 SFRP2
同义词 FRP-2 | SARP1 | SDF-5
描述 分泌的卷曲相关蛋白2
参考 MIM:604157|HGNC:HGNC:10777|ENSEMBL:ENSG00000145423|HPRD:16041|Vega:Otthumg00000161559
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4q31.3
Pascal P值 0.006
主持人 米yers' cis & trans

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS954368 CHR4 154771775 SFRP2 6423 0.07 顺式
RS6820559 CHR4 154813698 SFRP2 6423 0.03 顺式
RS17131472 CHR1 91962966 SFRP2 6423 3.305E-4 反式
RS546975 CHR1 91963738 SFRP2 6423 0.13 反式
RS10218671 CHR1 158362552 SFRP2 6423 0.18 反式
rs1835319 CHR2 16586056 SFRP2 6423 0.05 反式
RS6710894 CHR2 66876700 SFRP2 6423 0.16 反式
RS17821815 CHR2 119018522 SFRP2 6423 0.01 反式
RS2115055 CHR2 119478688 SFRP2 6423 0.14 反式
RS11679772 CHR2 158292302 SFRP2 6423 0.19 反式
RS1691463 CHR3 84914366 SFRP2 6423 0.07 反式
RS2922180 CHR3 125280472 SFRP2 6423 5.172E-8 反式
rs2971271 CHR3 125450402 SFRP2 6423 0.08 反式
RS2976809 CHR3 125451738 SFRP2 6423 1.059E-5 反式
RS16889842 CHR4 9872012 SFRP2 6423 0.05 反式
RS17776097 CHR4 90247162 SFRP2 6423 0.19 反式
RS4033102 CHR4 111784204 SFRP2 6423 0.03 反式
RS509952 CHR4 111788169 SFRP2 6423 0.02 反式
rs313946 CHR4 113975904 SFRP2 6423 0.01 反式
RS10050805 CHR5 30805352 SFRP2 6423 0.01 反式
RS16894149 CHR5 61013724 SFRP2 6423 0.15 反式
RS17143695 CHR5 117520843 SFRP2 6423 0.14 反式
RS6874540 CHR5 149911669 SFRP2 6423 0.15 反式
RS2273232 CHR5 149912526 SFRP2 6423 0.15 反式
RS11954814 CHR5 155088338 SFRP2 6423 0.12 反式
rs17056435 CHR5 158453782 SFRP2 6423 2.686E-4 反式
RS12663807 CHR6 40571873 SFRP2 6423 0.02 反式
RS6920042 CHR6 67907570 SFRP2 6423 0.16 反式
RS6455226 CHR6 67930295 SFRP2 6423 0 反式
RS16868852 CHR6 70980333 SFRP2 6423 0.18 反式
RS283058 CHR6 118625224 SFRP2 6423 0 反式
RS12216440 CHR6 118856821 SFRP2 6423 0.11 反式
RS2056744 CHR6 144952933 SFRP2 6423 0.12 反式
RS2430483 CHR7 104548631 SFRP2 6423 0.01 反式
rs10273901 CHR7 131828566 SFRP2 6423 0.13 反式
RS2199402 CHR8 9201002 SFRP2 6423 0.06 反式
RS7841407 CHR8 9243427 SFRP2 6423 0 反式
RS2739708 CHR8 17992280 SFRP2 6423 0.03 反式
RS714131 CHR8 17992832 SFRP2 6423 0.09 反式
RS2739726 CHR8 17998576 SFRP2 6423 0.02 反式
RS2919377 CHR8 32573740 SFRP2 6423 0.01 反式
RS680372 CHR8 36999626 SFRP2 6423 0.19 反式
RS7850851 Chr9 37928770 SFRP2 6423 0.12 反式
rs2253777 Chr9 93467893 SFRP2 6423 0.04 反式
RS998410 Chr9 117622673 SFRP2 6423 0.09 反式
RS9423711 Chr10 2574802 SFRP2 6423 2.521E-6 反式
rs2388266 Chr10 2595037 SFRP2 6423 0.1 反式
RS651134 Chr10 27549960 SFRP2 6423 0.09 反式
RS748375 Chr10 33440178 SFRP2 6423 0.08 反式
RS4514358 Chr10 43861923 SFRP2 6423 0.02 反式
RS7081666 Chr10 47673800 SFRP2 6423 0.01 反式
RS10488758 Chr11 103493095 SFRP2 6423 0.09 反式
RS1905067 Chr11 103493989 SFRP2 6423 0.15 反式
rs11225990 Chr11 103608380 SFRP2 6423 0.1 反式
RS2305164 CHR12 365649 SFRP2 6423 0.03 反式
RS10747972 0 SFRP2 6423 0.18 反式
RS995817 CHR12 67557935 SFRP2 6423 0.15 反式
RS10879027 CHR12 70237156 SFRP2 6423 2.408E-4 反式
RS11112163 CHR12 105072508 SFRP2 6423 0.16 反式
rs17080889 CHR13 20939135 SFRP2 6423 0.17 反式
rs9551590 CHR13 29589464 SFRP2 6423 0.04 反式
RS9532792 CHR13 41912654 SFRP2 6423 0.15 反式
RS9590586 CHR13 41913130 SFRP2 6423 0.17 反式
RS7358853 CHR13 41931685 SFRP2 6423 0.19 反式
RS8002343 CHR13 41952090 SFRP2 6423 0.17 反式
RS9315839 CHR13 41952872 SFRP2 6423 0.19 反式
RS7982172 CHR13 41969697 SFRP2 6423 0.16 反式
RS4942043 CHR13 41978218 SFRP2 6423 0.03 反式
RS4402447 CHR13 41984741 SFRP2 6423 0.16 反式
RS7982922 CHR13 43873335 SFRP2 6423 0.18 反式
RS9529974 CHR13 72821935 SFRP2 6423 3.814e-4 反式
RS17073665 CHR13 81541961 SFRP2 6423 0 反式
RS11840833 CHR13 94378306 SFRP2 6423 0.01 反式
RS16975617 CHR13 110867407 SFRP2 6423 0.06 反式
RS10142086 CHR14 35135892 SFRP2 6423 0.15 反式
RS1956517 CHR14 37738426 SFRP2 6423 0.12 反式
RS1457420 CHR14 66958675 SFRP2 6423 0.12 反式
RS2093759 CHR14 97171024 SFRP2 6423 0 反式
rs17244419 CHR14 97171074 SFRP2 6423 4.182E-5 反式
RS7177212 CHR15 34425413 SFRP2 6423 0.19 反式
RS16976022 CHR15 55454260 SFRP2 6423 0.07 反式
RS16976029 CHR15 55455268 SFRP2 6423 0.03 反式
RS16976036 CHR15 55456921 SFRP2 6423 0.04 反式
RS8034402 CHR15 55480932 SFRP2 6423 0.1 反式
rs11073814 CHR15 89378883 SFRP2 6423 0.18 反式
RS7165622 CHR15 93979910 SFRP2 6423 0.1 反式
RS13380712 CHR16 25601181 SFRP2 6423 0.04 反式
RS17841422 CHR17 20969134 SFRP2 6423 0 反式
RS16977927 CHR17 72154232 SFRP2 6423 0.05 反式
RS16940550 CHR18 13442256 SFRP2 6423 0.19 反式
RS7236104 CHR18 14032818 SFRP2 6423 0.14 反式
RS9949772 CHR18 31042632 SFRP2 6423 0.1 反式
RS7236407 CHR18 47827597 SFRP2 6423 0.1 反式
RS4987765 CHR18 60905021 SFRP2 6423 0.06 反式
RS11873703 CHR18 61448702 SFRP2 6423 6.602E-6 反式
RS6095741 CHR20 48666589 SFRP2 6423 1.186E-10 反式
RS6004906 CHR22 26434554 SFRP2 6423 0.04 反式
RS6000401 CHR22 37149335 SFRP2 6423 0.13 反式
RS5991662 Chrx 43335796 SFRP2 6423 5.443e-5 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

没有大脑中的基因区域


Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg wnt信号通路 151 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SENGUPTA NASOPHARYNGEAL CARCINOMA WITH LMP1 UP 408 247 All SZGR 2.0 genes in this pathway
turashvili乳房导管癌与导管正常 44 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
turashvili乳房小叶癌与导管正常 69 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TURASHVILI BREAST LOBULAR CARCINOMA VS LOBULAR NORMAL DN 74 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NOJIMA SFRP2靶向 31 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
vecchi胃癌先进与早期 175 120 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Markey RB1慢性洛夫 115 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaussmann MLL AF4融合靶向E 97 60 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 All SZGR 2.0 genes in this pathway
留置权乳腺癌变质 35 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
结肠癌中的施莱辛格甲基化 10 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
成人癌中甲基化的欧姆 27 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
欧姆胚胎癌 6 5 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ingram SHH靶向DN 64 41 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发12小时 116 79 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath ES 1 379 235 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BENPORATH NANOG TARGETS 988 594 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Oct4目标 290 172 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath SOX2目标 734 436 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath NOS目标 179 105 All SZGR 2.0 genes in this pathway
UEDA中央时钟 88 62 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bhattacharya胚胎干细胞 89 60 All SZGR 2.0 genes in this pathway
郭十六进制目标 81 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
米ATSUDA NATURAL KILLER DIFFERENTIATION 475 313 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhan多发性骨髓瘤MF 47 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang Smarce1靶向DN 371 218 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAL PRMT5靶向 203 135 All SZGR 2.0 genes in this pathway
tseng irs1靶向DN 135 88 All SZGR 2.0 genes in this pathway
敏锐的回应罗格列酮DN 106 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Burton脂肪形成峰在0hr 63 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Tseng脂肪势DN 46 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成9 92 59 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1靶向DN 543 317 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53目标DN 593 372 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Izadpanah干细胞脂肪与骨DN 108 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mishra癌相关的成纤维细胞DN 24 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VART KSHV感染血管生成标记 165 118 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McMurray TP53 HRAS合作响应DN 67 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Karlsson TGFB1靶向DN 207 139 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Katsanou Elavl1靶向DN 148 88 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang MLL目标 289 188 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Durand Stroma S向上 297 194 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA分泌因素 344 197 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA女性相关 753 411 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA矩阵 1028 559 All SZGR 2.0 genes in this pathway