基因页：PDLIM2
概括？
| 基因 | 64236 |
| 象征 | PDLIM2 |
| 同义词 | 神秘| Slim |
| 描述 | PDZ和LIM域2 |
| 参考 | MIM：609722|HGNC：HGNC：13992|Ensembl：ENSG00000120913|HPRD：17831|Vega：Otthumg00000164270 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8p21.3 |
| Pascal P值 | 0.133 |
| Sherlock P值 | 0.004 |
| 胎儿β | -0.856 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.031 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.03086 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.00057 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS881771 | CHR8 | 22431587 | PDLIM2 | 64236 | 0.01 | 顺式 | ||
| RS3064 | CHR8 | 22451687 | PDLIM2 | 64236 | 3.233e-12 | 顺式 | ||
| RS3735893 | CHR8 | 22452703 | PDLIM2 | 64236 | 3.952e-12 | 顺式 | ||
| RS2291232 | CHR8 | 22464063 | PDLIM2 | 64236 | 7.363e-11 | 顺式 | ||
| RS1871900 | CHR8 | 22481448 | PDLIM2 | 64236 | 7.45e-7 | 顺式 | ||
| RS10099266 | CHR8 | 22484267 | PDLIM2 | 64236 | 5.98e-7 | 顺式 | ||
| RS6558172 | CHR8 | 22492051 | PDLIM2 | 64236 | 0.2 | 顺式 | ||
| RS6558173 | CHR8 | 22492102 | PDLIM2 | 64236 | 4.967E-10 | 顺式 | ||
| RS11776549 | CHR8 | 22493123 | PDLIM2 | 64236 | 1.71E-9 | 顺式 | ||
| RS7005025 | CHR8 | 22519814 | PDLIM2 | 64236 | 3.226e-9 | 顺式 | ||
| RS10104039 | CHR8 | 22538383 | PDLIM2 | 64236 | 2.537E-7 | 顺式 | ||
| RS1040053 | CHR8 | 22699218 | PDLIM2 | 64236 | 0.17 | 顺式 | ||
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | PDLIM2 | 64236 | 0 | 反式 | ||
| RS3064 | CHR8 | 22451687 | PDLIM2 | 64236 | 8.123E-10 | 反式 | ||
| RS3735893 | CHR8 | 22452703 | PDLIM2 | 64236 | 9.952e-10 | 反式 | ||
| RS2291232 | CHR8 | 22464063 | PDLIM2 | 64236 | 1.897E-8 | 反式 | ||
| RS1871900 | CHR8 | 22481448 | PDLIM2 | 64236 | 1.42E-4 | 反式 | ||
| RS10099266 | CHR8 | 22484267 | PDLIM2 | 64236 | 1.169E-4 | 反式 | ||
| RS6558173 | CHR8 | 22492102 | PDLIM2 | 64236 | 1.209E-7 | 反式 | ||
| RS11776549 | CHR8 | 22493123 | PDLIM2 | 64236 | 4.157E-7 | 反式 | ||
| RS7005025 | CHR8 | 22519814 | PDLIM2 | 64236 | 7.706E-7 | 反式 | ||
| RS10104039 | CHR8 | 22538383 | PDLIM2 | 64236 | 5.284e-5 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | PDLIM2 | 64236 | 0 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0009986 | 细胞表面 | 艾达 | 12493773 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 通过CD40 UP的Hollmann凋亡 | 201 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Furukawa Dusp6靶向PCI35 DN | 74 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 植洛小儿所有疗法反应dn | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SEKI炎症反应LPS DN | 23 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARSON FOXP3目标 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Steger脂肪形成DN | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-299-3p | 2971 | 2977 | M8 | HSA-MIR-299-3P | uauggggaugguaaaaCcgcuu |
| mir-491 | 2970 | 2976 | 1a | HSA-MIR-491脑 | aguggggaacccuuccaugga |