基因页:ABCG8
概括?
基因 | 64241 |
象征 | ABCG8 |
同义词 | GBD4 | STSL |
描述 | ATP绑定盒子亚家族g成员8 |
参考 | MIM:605460|HGNC:HGNC:13887|ENSEMBL:ENSG00000143921|HPRD:05679|Vega:Otthumg00000128756 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2P21 |
Pascal P值 | 0.948 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG25029903 | 2 | 44105057 | ABCG8 | 3.87E-4 | -0.409 | 0.043 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ABCG8_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG ABC转运蛋白 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome ABCA转运蛋白在脂质稳态中 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome ABC家族蛋白介导的运输 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome脂质消化和运输 | 46 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖DN | 179 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF LCP带有H3K27ME3 | 70 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SUMI HNF4A目标 | 34 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IRS1和IRS2的GUO目标 | 98 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |