基因页：CXCR5
概括？
| 基因 | 643 |
| 象征 | CXCR5 |
| 同义词 | Blr1 | CD185 | MDR15 |
| 描述 | C-X-C基序趋化因子受体5 |
| 参考 | MIM：601613|HGNC：HGNC：1060|HPRD：03367| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11q23.3 |
| Pascal P值 | 1.551E-4 |
| 胎儿β | 0.162 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG16280667 | 11 | 118754593 | CXCR5 | 2.6e-11 | -11.891 | DMG：Vaneijk_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C1QTNF3 | 0.77 | 0.29 |
| HMCN1 | 0.68 | 0.32 |
| IL13RA2 | 0.67 | 0.17 |
| chodl | 0.64 | 0.27 |
| S100A10 | 0.64 | 0.03 |
| NTS | 0.59 | 0.18 |
| C1orf168 | 0.59 | 0.17 |
| itga4 | 0.56 | 0.34 |
| AGBL2 | 0.56 | 0.26 |
| TSHR | 0.55 | 0.20 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| gnly | -0.13 | -0.16 |
| MT-CO2 | -0.13 | -0.23 |
| CA4 | -0.13 | -0.16 |
| AF347015.33 | -0.13 | -0.21 |
| AF347015.31 | -0.13 | -0.24 |
| 电缆1 | -0.13 | -0.09 |
| rras | -0.13 | -0.19 |
| AF347015.27 | -0.13 | -0.20 |
| AC131097.1 | -0.13 | -0.23 |
| FXYD1 | -0.13 | -0.20 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 去：0004945 | 血管紧张素II型受体活性 | IEA | - | |
| GO：0016494 | C-X-C趋化因子受体活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007186 | G蛋白偶联受体蛋白信号通路 | 塔斯 | 1425907 | |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 去：0006928 | 细胞运动 | 塔斯 | 1425907 | |
| GO：0042113 | B细胞激活 | IEA | - | |
| GO：0048535 | 淋巴结发展 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 1425907 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG趋化因子信号传导途径 | 190 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组肽配体结合受体 | 188 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组趋化因子受体结合趋化因子 | 57 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G alpha I信号事件 | 195 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和血清剥夺的反应 | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shin B细胞淋巴瘤簇9 | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori大型BII淋巴细胞DN | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori成熟B淋巴细胞向上 | 90 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 克莱因原发性积液淋巴瘤DN | 58 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与B淋巴细胞DN | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Basso CD40信号向上 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gavin Foxp3目标集群P2 | 79 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 巴索毛毛细胞白血病 | 6 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoffmann小型前BII至未成熟的B淋巴细胞向上 | 70 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan早期分化基因dn | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黑元对癌细胞病毒的反应 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |