概括
基因 6434
象征 tra2b
同义词 htra2-beta | ppp1r156 | sfrs10 | srfs10 | tra2-beta | tran2b
描述 变压器2β同源物(果蝇)
参考 MIM:602719|HGNC:HGNC:10781|HPRD:04097|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q26.2-Q27
Pascal P值 0.003
Sherlock P值 0.574
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4321562 CHR3 185633350 tra2b 6434 0.17 顺式
RS6772011 CHR3 185670448 tra2b 6434 0.17 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PHF19 0.78 0.74
MCM3 0.78 0.60
pola2 0.78 0.65
sall1 0.76 0.67
REEP4 0.76 0.65
palld 0.76 0.62
NCAPD2 0.76 0.63
PTBP1 0.76 0.54
CHST14 0.76 0.55
TGIF1 0.75 0.56
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.40 -0.37
MT-CO2 -0.37 -0.31
AF347015.8 -0.36 -0.30
AF347015.31 -0.35 -0.29
IL32 -0.35 -0.34
卡16 -0.34 -0.35
mt-cyb -0.34 -0.28
AF347015.18 -0.34 -0.31
AF347015.27 -0.34 -0.28
AF347015.2 -0.33 -0.27

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
NGFR CD271 |GP80-LNGFR |TNFRSF16 |P75(NTR)|p75ntr 神经生长因子受体(TNFR超家族,成员16) - HPRD 12604596
RBMX hnrpg |RBMXP1 |RBMXRT |RNMX |hnrnp-g RNA结合基序蛋白,X连锁 - HPRD,Biogrid 10749975
RBMXL2 hnrnpg-t |hnrnpgt |hnrpgt RNA结合基序蛋白,X连接样2 - HPRD,Biogrid 10749975
rbmy1a1 MGC181956 |RBM1 |RBM2 |rbmy |yrm1 |yrm2 RNA结合基序蛋白,Y连锁,族1,成员A1 - HPRD,Biogrid 10749975
RNPS1 E5.1 |MGC117332 RNA结合蛋白S1,富含丝氨酸的结构域 RNPS1与Htra2-beta相互作用。 绑定 14729963
RNPS1 E5.1 |MGC117332 RNA结合蛋白S1,富含丝氨酸的结构域 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
SFRS12 DKFZP564B176 |MGC133045 |SRRP508 |SRRP86 剪接因子,精氨酸/丝氨酸富集12 - HPRD 14559993
SFRS9 SRP30C 剪接因子,精氨酸/丝氨酸富含9 - HPRD,Biogrid 11875052
TNPO3 IPO12 |mtr10a |trn-sr |TRN-SR2 |trnsr 运输3 - HPRD 10713112
ythdc1 KIAA1966 |YT521 |YT521-B 包含1的Yth域 - HPRD 9473574
ywhaz KCIP-1 |MGC111427 |MGC126532 |MGC138156 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,Zeta多肽 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
Zranb2 DKFZP686J1831 |DKFZP686N09117 |FLJ41119 |zis |zis1 |zis2 |ZNF265 锌指,持续2个包含2个 蛋白-RNA Biogrid 11448987


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg剪接体 128 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤DN 136 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nagashima NRG1信号向上发出 176 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标12小时DN 209 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML静止与CML分裂 23 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML静止与正常分裂 57 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 236 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江龄大脑皮层 36 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3目标胸腺 196 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应 212 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李最近的胸腺移民 227 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因