基因页:tra2b
概括?
基因 | 6434 |
象征 | tra2b |
同义词 | htra2-beta | ppp1r156 | sfrs10 | srfs10 | tra2-beta | tran2b |
描述 | 变压器2β同源物(果蝇) |
参考 | MIM:602719|HGNC:HGNC:10781|HPRD:04097| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q26.2-Q27 |
Pascal P值 | 0.003 |
Sherlock P值 | 0.574 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4321562 | CHR3 | 185633350 | tra2b | 6434 | 0.17 | 顺式 | ||
RS6772011 | CHR3 | 185670448 | tra2b | 6434 | 0.17 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TRA2B_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PHF19 | 0.78 | 0.74 |
MCM3 | 0.78 | 0.60 |
pola2 | 0.78 | 0.65 |
sall1 | 0.76 | 0.67 |
REEP4 | 0.76 | 0.65 |
palld | 0.76 | 0.62 |
NCAPD2 | 0.76 | 0.63 |
PTBP1 | 0.76 | 0.54 |
CHST14 | 0.76 | 0.55 |
TGIF1 | 0.75 | 0.56 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.40 | -0.37 |
MT-CO2 | -0.37 | -0.31 |
AF347015.8 | -0.36 | -0.30 |
AF347015.31 | -0.35 | -0.29 |
IL32 | -0.35 | -0.34 |
卡16 | -0.34 | -0.35 |
mt-cyb | -0.34 | -0.28 |
AF347015.18 | -0.34 | -0.31 |
AF347015.27 | -0.34 | -0.28 |
AF347015.2 | -0.33 | -0.27 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
NGFR | CD271 |GP80-LNGFR |TNFRSF16 |P75(NTR)|p75ntr | 神经生长因子受体(TNFR超家族,成员16) | - | HPRD | 12604596 |
RBMX | hnrpg |RBMXP1 |RBMXRT |RNMX |hnrnp-g | RNA结合基序蛋白,X连锁 | - | HPRD,Biogrid | 10749975 |
RBMXL2 | hnrnpg-t |hnrnpgt |hnrpgt | RNA结合基序蛋白,X连接样2 | - | HPRD,Biogrid | 10749975 |
rbmy1a1 | MGC181956 |RBM1 |RBM2 |rbmy |yrm1 |yrm2 | RNA结合基序蛋白,Y连锁,族1,成员A1 | - | HPRD,Biogrid | 10749975 |
RNPS1 | E5.1 |MGC117332 | RNA结合蛋白S1,富含丝氨酸的结构域 | RNPS1与Htra2-beta相互作用。 | 绑定 | 14729963 |
RNPS1 | E5.1 |MGC117332 | RNA结合蛋白S1,富含丝氨酸的结构域 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
SFRS12 | DKFZP564B176 |MGC133045 |SRRP508 |SRRP86 | 剪接因子,精氨酸/丝氨酸富集12 | - | HPRD | 14559993 |
SFRS9 | SRP30C | 剪接因子,精氨酸/丝氨酸富含9 | - | HPRD,Biogrid | 11875052 |
TNPO3 | IPO12 |mtr10a |trn-sr |TRN-SR2 |trnsr | 运输3 | - | HPRD | 10713112 |
ythdc1 | KIAA1966 |YT521 |YT521-B | 包含1的Yth域 | - | HPRD | 9473574 |
ywhaz | KCIP-1 |MGC111427 |MGC126532 |MGC138156 | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,Zeta多肽 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
Zranb2 | DKFZP686J1831 |DKFZP686N09117 |FLJ41119 |zis |zis1 |zis2 |ZNF265 | 锌指,持续2个包含2个 | 蛋白-RNA | Biogrid | 11448987 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg剪接体 | 128 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤DN | 136 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nagashima NRG1信号向上发出 | 176 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML静止与CML分裂 | 23 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML静止与正常分裂 | 57 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移 | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal TGFB1靶向 | 169 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 | 236 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病 | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江龄大脑皮层 | 36 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P3 | 160 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应 | 212 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李最近的胸腺移民 | 227 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |