基因页面:IKZF4
总结吗?
| GeneID | 64375年 |
| 象征 | IKZF4 |
| 同义词 | EOS | ZNFN1A4 |
| 描述 | 伊卡洛斯家族锌指4 |
| 参考 | MIM: 606239|HGNC: HGNC: 13179|运用:ENSG00000123411|HPRD: 05874|织女:OTTHUMG00000170132 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 12个问题 |
| 帕斯卡假定值 | 0.288 |
| 胎儿β | 1.077 |
| DMG | 2(#研究) |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Montano_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括172复制与精神分裂症之间的联系论文认定。 | 3 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 3 |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.0576 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg20359445 | 12 | 56415591 | IKZF4 | 9.06 e-6 | -0.006 | 0.042 | DMG: Montano_2016 |
| cg20054248 | 12 | 56414508 | IKZF4 | 2.89的军医 | -0.004 | 0.177 | DMG: Montano_2016 |
| cg20359445 | 12 | 56415591 | IKZF4 | 4.197的军医 | 0.245 | 0.045 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003700 | 转录因子的活动 | 助教 | 10978333 | |
| 去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016564 | 转录抑制因子活性 | 助教 | 10978333 | |
| 去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005634 | 核 | 助教 | 10978333 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CHD4 | DKFZp686E06161 | Mi-2b | Mi2-BETA | chromodomain解旋酶DNA结合蛋白4 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12015313 |
| CTBP1 | 酒吧| MGC104684 | c端结合蛋白1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12444977 |
| HDAC2 | RPD3 | YAF1 | 组蛋白脱乙酰酶2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12015313 |
| HDAC4 | HA6116 | HD4 | HDAC-A | HDACA | KIAA0288 | 组蛋白脱乙酰酶4 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12015313 |
| HDAC5 | FLJ90614 | HD5 | NY-CO-9 | 组蛋白脱乙酰酶5 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12015313 |
| HDAC7 | DKFZp586J0917 | FLJ99588 | HD7A | HDAC7A | 组蛋白脱乙酰酶7 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12015313 |
| IKZF1 | Hs.54452 | IK1 | IKAROS | LYF1 | PRO0758 | ZNFN1A1 | hIk-1 | 伊卡洛斯家族锌指1(伊卡洛斯飞船) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10218586|10978333 |
| IKZF2 | HELIOS | MGC34330 | ZNF1A2 | ZNFN1A2 | 伊卡洛斯家族锌指2(太阳神) | - - - - - - | HPRD | 10978333 |
| IKZF3 | AIO |艾俄洛斯| ZNFN1A3 | 伊卡洛斯家族锌指3(艾俄洛斯) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10978333 |
| IKZF4 | EOS | KIAA1782 | ZNFN1A4 | 伊卡洛斯家族锌指4 (Eos) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10218586|10978333 |
| IKZF5 | DKFZp781B0249 | FLJ22973 |飞马| ZNFN1A5 | 伊卡洛斯家族锌指5 (Pegasus) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10978333 |
| NRG1 | 咏叹调| GGF | GGF2 | HGL | HRG | HRG1 | HRGA | NDF | SMDF | neuregulin 1 | Nrg-1与Eos交互。之间的交互是仿照了交互Nrg-1从物种和Eos不详不详的物种。 | 绑定 | 15494726 |
| SIN3A | DKFZp434K2235 | FLJ90319 | KIAA0700 | SIN3同族体,转录监管机构(酵母) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12015313 |
| SIN3B | KIAA0700 | SIN3同族体B,转录监管机构(酵母) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12015313 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 廖转移 | 539年 | 324年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗骨髓细胞发展DN | 129年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOREAUX TACI了多发性骨髓瘤 | 412年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病早期布莱洛克的了 | 390年 | 242年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAVIN集群P7 FOXP3目标 | 90年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PEDRIOLI MIR31目标了 | 221年 | 120年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RATTENBACHER受CELF1 | 467年 | 251年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 黄宗泽过敏原诱导TH2相关模块 | 151年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 101 | 3053年 | 3060年 | 1、m8 | hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG |
| hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG | ||||
| miR-125/351 | 871年 | 877年 | m8 | hsa - mir - 125 b大脑 | UCCCUGAGACCCUAACUUGUGA |
| hsa - mir - 125 a大脑 | UCCCUGAGACCCUUUAACCUGUG | ||||
| mir - 128 | 660年 | 666年 | m8 | hsa - mir - 128 a | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU |
| hsa - mir - 128 b | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC | ||||
| miR-130/301 | 585年 | 592年 | 1、m8 | hsa - mir - 130 a大脑 | CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU |
| hsa - mir - 301 | CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC | ||||
| hsa - mir - 130 b大脑 | CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU | ||||
| hsa - mir - 454 - 3 - p | UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU | ||||
| mir - 137 | 1962年 | 1968年 | 1 | hsa - mir - 137 | UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG |
| mir - 144 | 3040年 | 3046年 | 1 | hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG |
| hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG | ||||
| miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d | 2406年 | 2413年 | 1、m8 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
| hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
| hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
| hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
| mir - 185 | 2388年 | 2395年 | 1、m8 | hsa - mir - 185大脑 | UGGAGAGAAAGGCAGUUC |
| hsa - mir - 185大脑 | UGGAGAGAAAGGCAGUUC | ||||
| hsa - mir - 185大脑 | UGGAGAGAAAGGCAGUUC | ||||
| mir - 216 | 1540年 | 1546年 | m8 | hsa - mir - 216 | UAAUCUCAGCUGGCAACUGUG |
| miR-22 | 579年 | 585年 | m8 | hsa-miR-22大脑 | AAGCUGCCAGUUGAAGAACUGU |
| miR-25/32/92/363/367 | 2802年 | 2809年 | 1、m8 | hsa-miR-25大脑 | CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA |
| hsa-miR-32 | UAUUGCACAUUACUAAGUUGC | ||||
| hsa - mir - 92 | UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG | ||||
| hsa - mir - 367 | AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 92 b深圳 | UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC | ||||
| miR-28 | 396年 | 402年 | m8 | hsa-miR-28大脑 | AAGGAGCUCACAGUCUAUUGAG |
| miR-29 | 2356年 | 2362年 | 1 | hsa-miR-29a深圳 | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
| hsa-miR-29b深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
| hsa-miR-29c深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU | ||||
| mir - 365 | 512年 | 518年 | 1 | hsa - mir - 365 | UAAUGCCCCUAAAAAUCCUUAU |
| mir - 381 | 2991年 | 2997年 | 1 | hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |
| mir - 504 | 2416年 | 2422年 | m8 | hsa - mir - 504 | AGACCCUGGUCUGCACUCUAU |
| mir - 539 | 2943年 | 2949年 | 1 | hsa - mir - 539 | GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU |
| miR-9 | 1550年 | 1556年 | m8 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |