基因页:一个KTIP
Summary?
基因ID | 64400 |
Symbol | 一个KTIP |
同义词 | FT1|FTS |
描述 | Akt相互作用的蛋白质 |
参考 | MIM:608483|HGNC:HGNC:16710|ENSEMBL:ENSG00000166971|HPRD:07467|Vega:Otthumg00000133199 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16Q12.2 |
Pascal P值 | 0.005 |
Sherlock P值 | 0.342 |
TADA P值 | 0.008 |
胎儿β | 0.72 |
主持人 | 元 |
支持 | CompositeSet |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
网络 | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献:0.0078 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | Sift | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
一个KTIP | CHR16 | 53528433 | 一个 | G | NM_001012398 NM_001012398 NM_022476 NM_022476 |
。 p.167w> r 。 p.167w> r |
拼接 missense 拼接 missense |
Schizophrenia | DNM:Fromer_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/AKTIP_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 14749367 | |
GO:0019787 | 小结合蛋白连接酶活性 | IEA | - | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001934 | 蛋白氨基酸磷酸化的阳性调节 | 艾达 | 14749367 | |
去:0032092 | 蛋白结合的阳性调节 | 艾达 | 14749367 | |
GO:0051246 | 蛋白质代谢过程的调节 | IEA | - | |
GO:0043687 | post-translational protein modification | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005886 | 质膜 | 艾达 | 14749367 |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
AKT1 | akt |MGC99656 |PKB |pkb-alpha |Prkba |RAC |Rac-Alpha | V-Akt鼠胸腺瘤病毒癌基因同源1 | - | HPRD,Biogrid | 14749367 |
一个SS1 | 屁股|CTLN1 | argininosuccinate synthetase 1 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
C10orf2 | atxn8 |FLJ21832 |iosca |PEO |PEO1 |PEOA3 |桑多|sca8 |双胞胎 | 染色体10开放阅读框2 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
CTBP2 | - | C末端结合蛋白2 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
DCTN1 | DAP-150 |DP-150 |HMN7B |P135 | Dynactin 1(P150,胶合同源物,果蝇) | 一个ffinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
Exoc7 | 2-5-3p | DKFZp686J04253 | EX070 | EXO70 | EXOC1 | Exo70p | FLJ40965 | FLJ46415 | YJL085W | 外囊复合物组件7 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
GTF3C1 | DKFZP686A111 |tfiiic |tfiiic220 |tfiiicalpha | 一般转录因子IIIC,多肽1,α220KDA | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
HDLBP | FLJ16432 | HBP | PRO2900 | VGL | 高密度脂蛋白结合蛋白 | 一个ffinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
钩1 | HK1 |MGC10642 | 钩同源1(果蝇) | 一个ffinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
钩2 | FLJ26218 |HK2 | 钩同源2(果蝇) | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
IARS | FLJ20736 |IARS1 |ILRS |Pro0785 | 异戊酸-TRNA合成酶 | 一个ffinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
IMMT | DKFZP779P1653 |HMP |MGC111146 |P87 |P87/89 |P89 |Pig4 |PIG52 | 内膜蛋白,线粒体(线粒体) | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
KIAA1377 | - | KIAA1377 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
PDPK1 | MGC20087 |MGC35290 |PDK1 |Pro0461 | 3-磷酸肌醇依赖蛋白激酶-1 | - | HPRD | 14749367 |
PDS5A | DKFZP686B19246 |FLJ41012 |KIAA0648 |MGC131948 |MGC161503 |Pig54 |SCC-112 | PDS5,凝聚力维护的调节剂,同源物A(S. cerevisiae) | 一个ffinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
pola2 | FLJ21662 |FLJ37250 | 聚合酶(定向DNA),α2(70KD亚基) | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
RPA1 | HSSB |repa1 |RF-A |RP-A |RPA70 | 复制蛋白A1,70KDA | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
TIMM50 | MGC102733 | TIM50 | TIM50L | translocase of inner mitochondrial membrane 50 homolog (S. cerevisiae) | 一个ffinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
UTP14A | KIAA0266 |NY-CO-16 |SDCCAG16 |DJ537K23.3 | UTP14,U3小核仁核糖核蛋白,同源物A(酵母) | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
miRNA family | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-101 | 589 | 595 | 1a | hsa-miR-101 | uacaguacugauaacugaag |
mir-144 | 589 | 595 | 1a | HSA-MIR-144 | uacaguauagauguauguaguag |
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 25 | 31 | M8 | HSA-MIR-17-5P | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
hsa-miR-519d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
mir-451 | 627 | 633 | M8 | HSA-MIR-451脑 | aaaccguuaccauuacugugaguuu |