概括
基因 64403
象征 CDH24
同义词 CDH11L
描述 钙粘蛋白24
参考 HGNC:HGNC:14265|ENSEMBL:ENSG00000139880|HPRD:13019|Vega:Otthumg0000000028715
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q11.2
Pascal P值 0.024
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.047

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 CDH24 64403 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005509 钙离子结合 艾达 12734196
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007156 同粒细胞粘附 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005911 细胞电池连接 艾达 12734196
去:0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome细胞通信 120 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Adherens连接相互作用 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞连接组织 56 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞连接组织 78 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期S 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向 279 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-128 278 285 1A,M8 HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-27 279 285 M8 HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc