基因页：CDH22

概括？
基因 64405
象征 CDH22
同义词 C20ORF25 | DJ998H6.1
描述 钙粘蛋白22
参考 MIM：609920|HGNC：HGNC：13251|ENSEMBL：ENSG00000149654|HPRD：13018|Vega：Otthumg00000033073
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20q13.1
Pascal P值 0.052
胎儿β -0.382
DMG 2（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 细胞粘附和透射信号传导

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 2
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG17964981 20 44803633 CDH22 6.5e-5 -0.566 0.024 DMG：Wockner_2014
CG05929136 20 44941267 CDH22 1.99E-8 -0.01 6.92E-6 DMG：JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6090483 CHR20 44999957 CDH22 64405 0.19 顺式
RS279734 CHR20 45068296 CDH22 64405 0.09 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
里克曼肿瘤分化了井与中度DN 110 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu衰老的脑dn 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 142 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kasler HDAC7目标2 DN 32 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因