概括
基因 64411
象征 ARAP3
同义词 centd3 | drag1
描述 带有rhogap结构域的ARFGAP,Ankyrin重复和pH结构域3
参考 MIM:606647|HGNC:HGNC:24097|ENSEMBL:ENSG00000120318|HPRD:09441|Vega:Otthumg00000129610
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q31.3
Pascal P值 0.687
Sherlock P值 0.689
胎儿β 0.228
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG15043642 5 141061863 ARAP3 6.07e-5 -0.437 0.023 DMG:Wockner_2014
CG04477203 5 141061883 ARAP3 1.285E-4 -0.53 0.03 DMG:Wockner_2014
CG11893951 5 141061521 ARAP3 3.271E-4 -0.575 0.04 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12564436 CHR1 55057662 ARAP3 64411 0.02 反式
RS2289015 CHR1 55075061 ARAP3 64411 0.1 反式
RS892932 CHR3 11624210 ARAP3 64411 0.19 反式
RS6793958 CHR3 17853055 ARAP3 64411 0.01 反式
RS7635430 CHR3 180152035 ARAP3 64411 0.02 反式
RS16933426 Chr10 78113005 ARAP3 64411 0.01 反式
RS17115591 CHR14 45262026 ARAP3 64411 0.15 反式
RS689654 CHR15 54029474 ARAP3 64411 0.11 反式
RS2279706 CHR19 31799790 ARAP3 64411 0.14 反式
RS4812218 CHR20 59422845 ARAP3 64411 0.12 反式
RS17201877 CHR20 59435605 ARAP3 64411 0.03 反式
RS2822799 CHR21 15958167 ARAP3 64411 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005547 磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸的结合 艾达 11804589
去:0008270 锌离子结合 IEA -
去:0008060 ARF GTPase激活剂活性 ISS -
GO:0043325 磷脂酰肌醇-3,4-双磷酸的结合 艾达 11804589
去:0030675 RAC GTPase激活剂活性 ISS -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007010 细胞骨架组织 塔斯 15569923
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0008360 细胞形状调节 ISS -
GO:0016192 囊泡介导的运输 塔斯 15569923
GO:0035024 RHO蛋白信号转导的负调控 ISS -
GO:0032312 ARF GTPase活性的调节 IEA -
去:0030336 细胞迁移的负调节 ISS -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001726 荷叶边 ISS -
去:0005856 细胞骨架 IEA -
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005737 细胞质 我知道了 11804589
去:0005737 细胞质 ISS -
GO:0030027 薄片 ISS -
去:0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG内吞作用 183 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid rhoa reg途径 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PI3KCI途径 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rho GTPases的Reactome信号传导 113 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2的反应 146 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合单核细胞的TONKS目标 204 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 157 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应FIMA DN 284 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过小径dn 186 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈神经母细胞瘤副本编号收益 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞DN 216 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McMurray TP53 HRAS合作响应 26 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤经典 162 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5a靶向DN 213 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roessler肝癌转移DN 53 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-150 482 488 M8 HSA-MIR-150 ucucccaacccuuguaccagug