基因页：GZF1
概括？
| 基因 | 64412 |
| 象征 | GZF1 |
| 同义词 | ZBTB23 | ZNF336 |
| 描述 | GDNF诱导锌指蛋白1 |
| 参考 | MIM：613842|HGNC：HGNC：15808|ENSEMBL：ENSG00000125812|HPRD：15778|Vega：Otthumg00000032069 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 20P11.21 |
| Pascal P值 | 0.958 |
| 胎儿β | -0.149 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| 表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值：2.824 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG05533119 | 20 | 23343103 | GZF1 | 4.17E-8 | -0.007 | 1.16e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0000122 | RNA聚合酶II启动子的转录负调控 | IEA | - | |
| 去：0001658 | 输尿管芽分支 | IEA | - | |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 | 156 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 | 110 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过ELK3和HIF1A的总缺氧 | 142 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SUH与ID1和ID2共同表达 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 按拷贝数量的丁肺癌表达 | 100 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| URS脂肪细胞分化 | 74 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-101 | 1663年 | 1669年 | M8 | HSA-MIR-101 | uacaguacugauaacugaag |
| mir-124.1 | 390 | 396 | M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA | ||||
| mir-124/506 | 390 | 396 | 1a | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga | ||||
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-24* | 590 | 596 | M8 | HSA-MIR-189 | Gugccuacugagagauaucagu |
| mir-30-5p | 1598年 | 1605 | 1A，M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
| HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
| mir-495 | 1719年 | 1725年 | 1a | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
| mir-9 | 753 | 760 | 1A，M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |