基因页:纳尔夫
概括?
基因 | 64428 |
象征 | 纳尔夫 |
同义词 | hprn | iop1 | let1l | prn |
描述 | 核预胺类似于识别因子 |
参考 | MIM:611118|HGNC:HGNC:14179|ENSEMBL:ENSG00000103245|HPRD:14810|Vega:Otthumg00000122093 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16p13.3 |
Pascal P值 | 0.072 |
Sherlock P值 | 0.72 |
胎儿β | -0.124 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG27209265 | 16 | 790912 | 纳尔夫 | 2.117E-4 | -0.193 | 0.036 | DMG:Wockner_2014 |
CG14711016 | 16 | 790766 | 纳尔夫 | -0.02 | 0.44 | DMG:Nishioka_2013 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2108091 | CHR7 | 16975023 | 纳尔夫 | 64428 | 0.12 | 反式 | ||
RS791607 | CHR7 | 127872834 | 纳尔夫 | 64428 | 0.19 | 反式 | ||
RS2122627 | CHR7 | 127883322 | 纳尔夫 | 64428 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NARFL_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Nikolsky乳腺癌16p13 Amplicon | 120 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗斯急性髓样白血病CBF | 82 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ROSS AML与AML1 ETO融合 | 76 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1突变DN的Verhaak AML | 246 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集13 | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |