概括
基因 64428
象征 纳尔夫
同义词 hprn | iop1 | let1l | prn
描述 核预胺类似于识别因子
参考 MIM:611118|HGNC:HGNC:14179|ENSEMBL:ENSG00000103245|HPRD:14810|Vega:Otthumg00000122093
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p13.3
Pascal P值 0.072
Sherlock P值 0.72
胎儿β -0.124
DMG 2(#研究)
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
伏隔核基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG27209265 16 790912 纳尔夫 2.117E-4 -0.193 0.036 DMG:Wockner_2014
CG14711016 16 790766 纳尔夫 -0.02 0.44 DMG:Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2108091 CHR7 16975023 纳尔夫 64428 0.12 反式
RS791607 CHR7 127872834 纳尔夫 64428 0.19 反式
RS2122627 CHR7 127883322 纳尔夫 64428 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Nikolsky乳腺癌16p13 Amplicon 120 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗斯急性髓样白血病CBF 82 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROSS AML与AML1 ETO融合 76 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集13 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因