SZGR2 - Beplay体育中心

Summary？

基因	6446
象征	SGK1
同义词	SGK
Description	血清/糖皮质激素调节激酶1
Reference	MIM：602958\|HGNC:HGNC:10810\|ENSEMBL：ENSG00000118515\|HPRD：04264\|Vega：Otthumg0000000015613
基因类型	蛋白质编码
地图位置	6Q23
Pascal P值	0.404
Sherlock p-value	0.026
DEG P值	DEG：SANDERS_2014：DS1_P = -0.138：DS1_BETA = 0.049700：DS2_P = 3.00E-03：DS2_BETA = 0.135：DS2_FDR = 3.38e-02
胎儿β	-0.724
主持人	Myers' cis & trans

基因in Data Sources

基因集名称	基因组方法	Description	信息
简历：Gwascat	Genome-wide Association Studies	该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DEG:Sanders_2013	微阵列	使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列（LCLS）上的微阵列进行全基因组基因表达谱。
PMID：cooccur	High-throughput literature-search	PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature	High-throughput literature-search	Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias	点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation

EQTL注释

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	PVALUE	QVALUE	TSS距离	EQTL类型
RS6632306	Chrx	35590460	SGK1	6446		0.14		反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
TP53I11	0.91	0.87
ATXN7L1	0.90	0.92
SEZ6	0.90	0.88
SRGAP2	0.89	0.92
EML1	0.89	0.90
ADD2	0.89	0.91
BCL7A	0.89	0.91
PIK3C2B	0.88	0.91
DACT1	0.88	0.89
ankrd44	0.88	0.88

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
serpinb6	-0.68	-0.76
HSD17B14	-0.63	-0.77
C5orf53	-0.62	-0.73
TSC22D4	-0.62	-0.77
HEPN1	-0.62	-0.71
RAMP1	-0.62	-0.78
AIFM3	-0.62	-0.73
BDH2	-0.62	-0.76
S100B	-0.61	-0.80
AF347015.31	-0.61	-0.84

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0000166	nucleotide binding	IEA		-
去：0005515	蛋白质结合	IEA		-
去：0005515	蛋白质结合	IPI		17353931
去：0005524	ATP结合	IEA		-
去：0004674	protein serine/threonine kinase activity	IEA		-
去：0004674	protein serine/threonine kinase activity	TAS		9114008
GO：0016740	转移酶活性	IEA		-
生物过程	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0006468	蛋白氨基酸磷酸化	IEA		-
去：0006468	蛋白氨基酸磷酸化	TAS		9114008
去：0006950	对压力的反应	TAS		9114008
去：0006814	钠离子运输	TAS		10884438
去：0006974	对DNA损伤刺激的反应	IEA		-
GO:0006915	凋亡	IEA		-
细胞分量	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005634	nucleus	IEA		-
去：0005737	cytoplasm	IEA		-
去：0005783	内质网	IEA		-

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
CAMKK2	camkk \|camkkb \|KIAA0787 \|MGC15254	钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶激酶2，β	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12628440
carhsp1	CRHSP-24 \|CSDC1 \|MGC111446	calcium regulated heat stable protein 1, 24kDa	重构的复合物	Biogrid	15910284
CD40	BP50 \|CDW40 \|MGC9013 \|tnfrsf5 \|P50	CD40分子，TNF受体超家族成员5	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
CDC37	P50CDC37	细胞分裂周期37同源物（S. cerevisiae）	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
CTNNB1	ctnnb \|DKFZP686D02253 \|FLJ25606 \|FLJ37923	Catenin（cadherin相关蛋白），β1，88KDA	CTNNB1（β-catenin）与SGK启动子相互作用。	绑定	15735679
Fanca	fa \|FA-H \|FA1 \|FAA \|FACA \|法\|Fanch \|MGC75158	Fanconi贫血，互补小组A	Two-hybrid	Biogrid	14499622
IARS	FLJ20736 \|IARS1 \|ILRS \|Pro0785	异戊酸-TRNA合成酶	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
IGHA1	FLJ14473 \|FLJ35065 \|FLJ35500 \|FLJ36402 \|FLJ39698 \|FLJ40001 \|FLJ41548 \|FLJ41552 \|FLJ41789 \|FLJ43248 \| FLJ43594 \| FLJ44293 \| FLJ46028 \| FLJ46621 \| FLJ46724 \| FLJ46811 \| FLJ46824 \| IgA1 \| MGC102857	免疫球蛋白重量常数α1	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
KPNA2	IPOA1 \| QIP2 \| RCH1 \| SRP1alpha	核桃蛋白α2（抹布队1，importin alpha 1）	-	HPRD，Biogrid	12631736
LTF	Gig12 \|HLF2 \|如果	乳糖素	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
MAPK7	BMK1 \|ERK4 \|ERK5 \|PRKM7	有丝分裂原激活的蛋白激酶7	-	HPRD，Biogrid	11254654
NEDD4	KIAA0093 \|MGC176705 \|nedd4-1 \|RPF1	神经前体细胞表达，发育下调4	-	HPRD，Biogrid	11696533
NEDD4L	FLJ33870 \|KIAA0439 \|Nedd4-2 \|RSP5 \|Hnedd4-2	神经前体细胞表达，发育下调4-like	-	HPRD	12729930
PA2G4	EBP1 \|HG4-1 \|P38-2G4	增殖相关2G4，38KDA	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
PDPK1	MGC20087 \|MGC35290 \|PDK1 \|Pro0461	3-phosphoinositide dependent protein kinase-1	-	HPRD，Biogrid	10357815
pigr	FLJ22667 \|MGC125361 \|MGC125362	polymeric immunoglobulin receptor	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
SLC9A3R2	e3karp \|MGC104639 \|NHE3RF2 \|nherf-2 \|nherf2 \|OCTS2 \|SIP-1 \|SIP1 \|TKA-1	solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 3 regulator 2	-	HPRD，Biogrid	11751930
TUFM	coxpd4 \|ef-tumt \|eftu \|P43	TU翻译伸长因子，线粒体	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
VCP	IBMPFD \|MGC131997 \|MGC148092 \|MGC8560 \|tera \|P97	含瓣膜蛋白	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	# SZGR 2.0 genes in pathway	信息
KEGG醛固酮调节的钠重吸收	42	29	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID INSULIN PATHWAY	45	32	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID REG GR PATHWAY	82	60	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID MTOR 4 Pathway	69	55	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID FOXO途径	49	43	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID PI3KCI途径	49	40	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onken Uveal黑色素瘤	783	507	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schuetz乳腺癌导管侵入性	351	230	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Davicioni pax foxo1手臂签名	59	38	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DAVICIONI TARGETS OF PAX FOXO1 FUSIONS UP	255	177	All SZGR 2.0 genes in this pathway
WILCOX RESPONSE TO PROGESTERONE UP	152	90	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN	463	290	All SZGR 2.0 genes in this pathway
周炎性反应活DN	384	220	All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与基础DN	455	304	All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与间充质DN	460	312	All SZGR 2.0 genes in this pathway
奥斯曼膀胱癌DN	406	230	All SZGR 2.0 genes in this pathway
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞	233	161	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿松石	79	50	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标	205	127	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 10D DN的Takeda目标	142	90	All SZGR 2.0 genes in this pathway
帕帕斯帕斯帕贝多诺斯不稳定的动脉粥样硬化斑块	52	36	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Odonnell TFRC靶向	456	228	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Tien肠益生菌6小时DN	167	100	All SZGR 2.0 genes in this pathway
tien肠益生菌24小时	557	331	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nagashima NRG1信号向上发出	176	123	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim WT1靶向	214	155	All SZGR 2.0 genes in this pathway
斋丁嫩造血干细胞DN	226	132	All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN	805	505	All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌变性DN	537	339	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN	781	465	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE UP	530	342	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindgren膀胱癌簇2A DN	141	84	All SZGR 2.0 genes in this pathway
GRAESSMANN血清剥夺了细胞凋亡	552	347	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAX3 FOXO1融合的Begum目标	60	45	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rashi对电离辐射1的响应1	45	27	All SZGR 2.0 genes in this pathway
HERNANDEZ ABERRANT MITOSIS BY DOCETACEL 4NM UP	23	15	All SZGR 2.0 genes in this pathway
埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 1 Up	36	18	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hernandez异常有丝分裂由DOCETACEL 2NM上升	81	57	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Naishiro CTNNB1具有LEF1主题的目标	8	7	All SZGR 2.0 genes in this pathway
沙诺田顺铂耐药性DN	51	38	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wood EBV EBNA1目标DN	47	33	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mohankumar TLX1靶向DN	193	112	All SZGR 2.0 genes in this pathway
王HCP前列腺癌	111	69	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gruetzmann胰腺癌DN	203	134	All SZGR 2.0 genes in this pathway
TSAI RESPONSE TO IONIZING RADIATION	149	101	All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧	110	78	All SZGR 2.0 genes in this pathway
总值HYPOXIA VIA ELK3 AND HIF1A UP	142	104	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten Nipp1靶向	769	437	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向	1037	673	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nakayama FRA2目标	43	27	All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹MBD目标	957	597	All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 48HR UP	487	286	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BENPORATH NANOG TARGETS	988	594	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath循环基因	648	385	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Amit EGF响应40 HELA	42	29	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿米特血清反应60 mcf10a	57	42	All SZGR 2.0 genes in this pathway
张对IKK抑制剂和TNF的反应	223	140	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gottwein的KSHV Mir K12 11	63	45	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shepard粉碎和燃烧突变体	197	110	All SZGR 2.0 genes in this pathway
UEDA中央时钟	88	62	All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEE LIVER CANCER ACOX1 UP	64	40	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NELSON RESPONSE TO ANDROGEN UP	86	61	All SZGR 2.0 genes in this pathway
brocke凋亡由IL6逆转	144	98	All SZGR 2.0 genes in this pathway
tarte浆细胞与Plasmablast DN	309	206	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jechlinger上皮到间充质转变DN	66	47	All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜蜜的克拉斯靶向	84	51	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Iizuka肝癌早期复发	11	10	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MATSUDA NATURAL KILLER DIFFERENTIATION	475	313	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病初期	390	242	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang Smarce1靶向DN	371	218	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CUI TCF21目标2 DN	830	547	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病	1691	1088	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DAZARD RESPONSE TO UV NHEK UP	244	151	All SZGR 2.0 genes in this pathway
汉·詹克（Han Jnk）唱歌	35	21	All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成1	33	24	All SZGR 2.0 genes in this pathway
XU GH1外源目标DN	120	69	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染6小时DN	160	101	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DASU IL6 SIGNALING SCAR DN	16	8	All SZGR 2.0 genes in this pathway
dazard UV响应集群G2	30	18	All SZGR 2.0 genes in this pathway
道格拉斯BMI1靶向DN	314	188	All SZGR 2.0 genes in this pathway
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN	373	196	All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEIN OLIGODENDROCYTE MARKERS	74	53	All SZGR 2.0 genes in this pathway
由FOXP3绑定的Marson刺激	1022	619	All SZGR 2.0 genes in this pathway
斯坦因·埃斯拉（Stein Esrra）的靶向对雌激素的反应	31	20	All SZGR 2.0 genes in this pathway
促进耐受巨噬细胞	156	92	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kondo EZH2目标	245	148	All SZGR 2.0 genes in this pathway
伽玛辐射8G后的生存率不佳	95	62	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rizki肿瘤侵入性3D DN	270	181	All SZGR 2.0 genes in this pathway
恩格曼癌祖细胞dn	70	44	All SZGR 2.0 genes in this pathway
级结肠癌DN	33	22	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Labbe Wnt3a靶向	112	71	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Labbe TGFB1靶向	102	64	All SZGR 2.0 genes in this pathway
TGFB1和WNT3A的LABBE目标	111	70	All SZGR 2.0 genes in this pathway
LIN NPAS4靶向	163	100	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CADWELL ATG16L1 TARGETS DN	70	43	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Piontek PKD1靶向	38	24	All SZGR 2.0 genes in this pathway
马歇尔病毒感染反应dn	29	21	All SZGR 2.0 genes in this pathway
RUTELLA RESPONSE TO CSF2RB AND IL4 DN	315	201	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对HGF的反应	418	282	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应	408	276	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Coulouarn暂时TGFB1签名	109	68	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stein ESR1目标	85	55	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kyng Werner综合征和正常老化DN	225	124	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DORN腺病毒感染12小时DN	33	25	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DORN腺病毒感染24小时DN	43	32	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DORN腺病毒感染32小时DN	39	28	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DORN腺病毒感染48小时DN	40	29	All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇8的时间反应8	49	36	All SZGR 2.0 genes in this pathway
萨森对促性腺营养蛋白的反应	91	59	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sasson对Forskolin的反应	90	58	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染2小时DN	49	33	All SZGR 2.0 genes in this pathway
li诱导了自然杀手	307	182	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kamikubo Myeloid MN1网络	19	14	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Demagalhaes老化	55	39	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dutertre雌二醇反应6小时	229	149	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Katsanou Elavl1靶向DN	148	88	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Delacroix Rarg Bound MEF	367	231	All SZGR 2.0 genes in this pathway
phong tnf响应不是通过p38	337	236	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BMP7的Zhang脂肪形成	14	12	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smirnov对IR 2小时的回应	53	33	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang 1类由EGF瞬时诱导	516	308	All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族	目标位置			miRNA ID	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	miRNA ID	mirna seq
mir-124/506	353	359	M8	HSA-MIR-506	uaaggcacccuucugugaguaga
mir-124/506	353	359	M8	HSA-MIR-124^brain	UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
miR-133	699	705	1a	HSA-MIR-133A	uugguccccuucaaccagcugu
miR-133	699	705	1a	HSA-MIR-133B	uguguccccuucaaccagcua
mir-142-3p	515	522	1A，M8	HSA-MIR-142-3P	UGUAGUGUUUCCUACUUUAUGGA
miR-15/16/195/424/497	659	666	1A，M8	HSA-MIR-15A^brain	uagcagcacauaugguugug
				hsa-miR-16^brain	UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG
				HSA-MIR-15B^brain	uagcagcacaucaugguuaca
				HSA-MIR-195^SZ	uagcagaaaaauauuggc
				hsa-miR-424	Cagcagcaauucauguuuugaa
				HSA-MIR-497	cagcagcacacuguguuugu
mir-19	103	110	1A，M8	HSA-MIR-19A	ugugcaaauaugauaugaaaacuga
mir-19	103	110	1A，M8	HSA-MIR-19B	UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
mir-23	498	504	M8	HSA-MIR-23A^brain	AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
mir-23	498	504	M8	HSA-MIR-23B^brain	aucacauugccagggauuacc
mir-25/32/92/363/367	991	997	1a	hsa-miR-25^brain	Cauugcacuugucucggucuga
				HSA-MIR-32	uauugcacauacuaaguugc
				HSA-MIR-92	uauugcacuugucccgcgcug
				HSA-MIR-367	Aauugcacuuuagcaaugga
				HSA-MIR-92B^SZ	uauugcacucgucccgcgcuc
mir-29	221	228	1A，M8	HSA-MIR-29A^SZ	uagcaccaucugaaaucgguu
				HSA-MIR-29B^SZ	UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
				HSA-MIR-29C^SZ	uagcaccauuugaaaucggu
mir-299-5p	884	891	1A，M8	hsa-miR-299-5p	ugguuuaccgucccacauacau
mir-323	498	504	1a	HSA-MIR-323^brain	gcacauuacggucgaccucu
miR-365	768	775	1A，M8	HSA-MIR-365	UAAUGCCCCUAAAAAUCCUUAU
miR-382	955	961	M8	HSA-MIR-382^brain	Gaaguuucgugguggauucg
miR-495	535	541	M8	HSA-MIR-495^brain	Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-503	660	666	1a	HSA-MIR-503	UAGCAGCGGGAACAGUUCUGCAG
mir-7	542	548	1a	HSA-MIR-7^SZ	UGGAAGACUAGUGAUUUUGUUG

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击hereto see the list of SZ related miRNAs.
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击here查看与大脑相关的miRNA列表。

基因页：SGK1