基因页：CSMD1

概括？
基因 64478
象征 CSMD1
同义词 PPP1R24
描述 幼崽和寿司多个域1
参考 MIM：608397|HGNC：HGNC：14026|ENSEMBL：ENSG00000183117|HPRD：10523|Vega：Otthumg00000163605
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p23.2
Sherlock P值 0.929
胎儿β -0.184
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
元

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历：PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS10503253 CHR8 4180844 交流 2.694E-8 内含子 CSMD1

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17029291 CHR3 32402138 CSMD1 64478 0 反式
RS7078127 Chr10 74847633 CSMD1 64478 0.08 反式
RS12569493 Chr10 74886042 CSMD1 64478 0.06 反式
RS16930362 Chr10 74890320 CSMD1 64478 0 反式
RS7092445 Chr10 74921991 CSMD1 64478 0.02 反式
RS12256576 Chr10 74934313 CSMD1 64478 0.1 反式
RS1867565 Chr10 74977780 CSMD1 64478 0.02 反式
RS11000557 Chr10 74987393 CSMD1 64478 0.03 反式
RS12569470 Chr10 74995826 CSMD1 64478 0.1 反式
RS16915029 Chr10 75001994 CSMD1 64478 0.03 反式
RS14488 Chr10 75007274 CSMD1 64478 0.06 反式
RS16930466 Chr10 75007587 CSMD1 64478 0.04 反式
RS11000579 Chr10 75027961 CSMD1 64478 0.01 反式
RS11000594 Chr10 75064566 CSMD1 64478 0.14 反式
RS11000607 Chr10 75089777 CSMD1 64478 0 反式
RS6480700 Chr10 75101689 CSMD1 64478 0.07 反式
RS16930573 Chr10 75167645 CSMD1 64478 0.14 反式
RS12571454 Chr10 75208954 CSMD1 64478 0.03 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 142 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向 221 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因