基因页:SH3BP2
概括?
基因 | 6452 |
象征 | SH3BP2 |
同义词 | 3BP-2 | 3BP2 | CRBM | CRPM | RES4-23 |
描述 | SH3膜结合蛋白2 |
参考 | MIM:602104|HGNC:HGNC:10825|Ensembl:ENSG00000087266|HPRD:03657|Vega:Otthumg00000160801 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4P16.3 |
Pascal P值 | 0.641 |
胎儿β | 1.819 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 伏隔核基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG10869531 | 4 | 2808489 | SH3BP2 | 4.424e-4 | 0.457 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SH3BP2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ABL1 | ABL |JTK7 |BCR/ABL |c-abl |P150 |V-ABL | C-ABL癌基因1,受体酪氨酸激酶 | - | HPRD | 8438166 |
CBL | C-CBL |CBL2 |RNF55 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 | 重构的复合物 | Biogrid | 9846481 |
FGFR1 | BFGFR |CD331 |Cek |FGFBR |flg |FLJ99988 |flt2 |HBGFR |kal2 |n-sam | 成纤维细胞生长因子受体1 | FGFR1的未指定同工型与SH3BP2相互作用。这种相互作用是基于未指定物种和人类SH3BP2的FGFR1之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 15117958 |
Fyn | MGC45350 |SLK |syn | Fyn Oncogene与SRC,FGR,是的 | 两个杂交 | Biogrid | 9846481 |
GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | 生长因子受体结合蛋白2 | - | HPRD,Biogrid | 9846481 |
拉特 | lat1 |pp36 | 激活T细胞的接头 | - | HPRD,Biogrid | 11390470 |
PLCG1 | PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 | 磷脂酶C,伽马1 | - | HPRD,Biogrid | 11390470 |
PLCG2 | - | 磷脂酶C,伽马2(磷脂酰肌醇特异性) | - | HPRD | 11390470 |
Syk | dkfzp313n1010 |FLJ25043 |FLJ37489 | 脾酪氨酸激酶 | - | HPRD,Biogrid | 9846481|11390470 |
vav1 | VAV | VAV 1鸟嘌呤核苷酸交换因子 | - | HPRD,Biogrid | 11390470 |
vav2 | - | VAV 2鸟嘌呤核苷酸交换因子 | - | HPRD | 11390470 |
ZAP70 | FLJ17670 |FLJ17679 |SRK |std |tzk |ZAP-70 | Zeta链(TCR)相关蛋白激酶70KDA | - | HPRD | 11390470 |
ZAP70 | FLJ17670 |FLJ17679 |SRK |std |tzk |ZAP-70 | Zeta链(TCR)相关蛋白激酶70KDA | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 9846481 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg天然杀伤细胞介导的细胞毒性 | 137 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TCR途径 | 66 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jazag TGFB1通过SMAD4 DN发出信号 | 66 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori成熟B淋巴细胞向上 | 90 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病DN | 121 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HALMOS CEBPA目标DN | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoegerkorp CD44靶向直接 | 27 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bernard PPAPDC1B目标DN | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mueller AML融合DN的共同靶标 | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Coulouarn颞TGFB1签名DN | 138 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |