基因页面:GIGYF1
总结吗?
GeneID | 64599年 |
象征 | GIGYF1 |
同义词 | GYF1 | PERQ1 |
描述 | GRB10互动GYF蛋白质1 |
参考 | MIM: 612064|HGNC: HGNC: 9126|运用:ENSG00000146830|HPRD: 10145|织女:OTTHUMG00000157036 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 7的时候 |
帕斯卡假定值 | 1.965的军医 |
夏洛克假定值 | 0.869 |
eGene | 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs6576747 | chr1 | 85530213 | GIGYF1 | 64599年 | 0.18 | 反式 | ||
rs16829545 | chr2 | 151977407 | GIGYF1 | 64599年 | 4.086 e-5 | 反式 | ||
rs7630486 | chr3 | 189801990 | GIGYF1 | 64599年 | 0.17 | 反式 | ||
rs16955618 | chr15 | 29937543 | GIGYF1 | 64599年 | 2.878的军医 | 反式 | ||
rs1761450 | chr19 | 54818034 | GIGYF1 | 64599年 | 0.12 | 反式 | ||
rs16996420 | chr20 | 9780867 | GIGYF1 | 64599年 | 0.13 | 反式 | ||
rs221789 | 7 | 100271521 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 9.962 e - | 0 | 15550年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs221792 | 7 | 100278657 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 2.406 e - | 0 | 8414年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs221794 | 7 | 100281768 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 2.238 e - | 0 | 5303年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs221798 | 7 | 100287495 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 4.012 e - | 0 | -424年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs221784 | 7 | 100292830 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 2.184 e - | 0 | -5759年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs221781 | 7 | 100295908 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 1.123 e-6 | 0 | -8837年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs221780 | 7 | 100297035 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 2.184 e - | 0 | -9964年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs221778 | 7 | 100298024 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 2.302 e - | 0 | -10953年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs221774 | 7 | 100298984 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 4.012 e - | 0 | -11913年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2432929 | 7 | 100299028 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 1.076 e - | 0 | -11957年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs221770 | 7 | 100302094 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 1.076 e - | 0 | -15023年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs534043 | 7 | 100312724 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 2.533 e-6 | 0 | -25653年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs492430 | 7 | 100313099 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 2.691 e-6 | 0 | -26028年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs506597 | 7 | 100313420 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 4.012 e - | 0 | -26349年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1734907 | 7 | 100315517 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 2.691 e-6 | 0 | -28446年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs564449 | 7 | 100321138 | GIGYF1 | ENSG00000146830.9 | 1.8 e-6 | 0 | -34067年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GIGYF1_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
GINESTIER乳腺癌ZNF217放大DN | 335年 | 193年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森IPS HCP H3 UNMETHYLATED | 80年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森ES HCP H3 UNMETHYLATED | 63年 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MEF HCP H3 UNMETHYLATED | 228年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG EGF间隔DN | 214年 | 124年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |