概括
基因 64641
象征 EBF2
同义词 COE2 | EBF-2 | O/E-3 | OE-3
描述 早期B细胞因子2
参考 MIM:609934|HGNC:HGNC:19090|ENSEMBL:ENSG00000221818|HPRD:16848|Vega:Otthumg00000163838
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p21.2
Pascal P值 0.041

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.03086
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.00057

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0030528 转录调节器活性 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Morosetti facioscapulohumeral肌肉分散 20 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN 185 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低DN 165 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高DN 180 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌DN 181 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir133靶向 43 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-10 450 457 1A,M8 HSA-MIR-10A uacccuguagauccgaauuugug
HSA-MIR-10B uacccuguagaaccgaauuugu
mir-133 43 49 1a HSA-MIR-133A uugguccccuucaaccagcugu
HSA-MIR-133B uguguccccuucaaccagcua
mir-186 255 261 M8 HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-218 20 26 1a HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-223 188 194 M8 HSA-MIR-223 ugucuuugucaauacccc
mir-375 443 449 1a HSA-MIR-375 uuuguucguucggcucgcguga
mir-376 396 403 1A,M8 HSA-MIR-376A aucauagaaaaauccacgu
HSA-MIR-376B aucauagaaaaauccauguu
mir-384 367 373 1a HSA-MIR-384 auuccuagaaauuguucaua
mir-452 320 326 1a HSA-MIR-452 UguuugcaggaaacugagaC
mir-495 259 265 1a HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-544 429 436 1A,M8 HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu