基因页:EBF2
概括?
基因 | 64641 |
象征 | EBF2 |
同义词 | COE2 | EBF-2 | O/E-3 | OE-3 |
描述 | 早期B细胞因子2 |
参考 | MIM:609934|HGNC:HGNC:19090|ENSEMBL:ENSG00000221818|HPRD:16848|Vega:Otthumg00000163838 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8p21.2 |
Pascal P值 | 0.041 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.03086 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.00057 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EBF2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0030528 | 转录调节器活性 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Morosetti facioscapulohumeral肌肉分散 | 20 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN | 185 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险低DN | 165 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Affar YY1目标 | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ikeda mir133靶向 | 43 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-10 | 450 | 457 | 1A,M8 | HSA-MIR-10A | uacccuguagauccgaauuugug |
HSA-MIR-10B | uacccuguagaaccgaauuugu | ||||
mir-133 | 43 | 49 | 1a | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||
mir-186 | 255 | 261 | M8 | HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu |
mir-218 | 20 | 26 | 1a | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
mir-223 | 188 | 194 | M8 | HSA-MIR-223 | ugucuuugucaauacccc |
mir-375 | 443 | 449 | 1a | HSA-MIR-375 | uuuguucguucggcucgcguga |
mir-376 | 396 | 403 | 1A,M8 | HSA-MIR-376A | aucauagaaaaauccacgu |
HSA-MIR-376B | aucauagaaaaauccauguu | ||||
mir-384 | 367 | 373 | 1a | HSA-MIR-384 | auuccuagaaauuguucaua |
mir-452 | 320 | 326 | 1a | HSA-MIR-452 | UguuugcaggaaacugagaC |
mir-495 | 259 | 265 | 1a | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
mir-544 | 429 | 436 | 1A,M8 | HSA-MIR-544 | auucugcauuuuuuagcaagu |