基因页:C6orf106
概括?
基因 | 64771 |
象征 | C6orf106 |
同义词 | FP852 | DJ391O22.4 |
描述 | 染色体6开放阅读框106 |
参考 | MIM:612217|HGNC:HGNC:21215|ENSEMBL:ENSG00000196821|HPRD:12837|Vega:Otthumg0000000014553 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p21.31 |
Pascal P值 | 0.188 |
Sherlock P值 | 0.555 |
胎儿β | -1.889 |
主持人 | 尾状基底神经节 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.04433 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/C6orf106_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
通过CD40 UP的Hollmann凋亡 | 201 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钟对偶氮替丁的反应和tsa | 183 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Elvidge缺氧DN | 146 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu衰老的脑dn | 153 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江VHL目标 | 138 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过VHL的江南缺氧 | 34 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-132/212 | 1706年 | 1712年 | M8 | HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacgccc |
HSA-MIR-132脑 | uaacagucuacccaugggg | ||||
mir-135 | 323 | 329 | M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
mir-153 | 1424 | 1430 | 1a | HSA-MIR-153 | Uugcauagucacaaaaguga |
mir-182 | 1407 | 1413 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
mir-192/215 | 279 | 285 | M8 | HSA-MIR-192 | cugaccuaugaauugacagcc |
HSA-MIR-215 | Augaccuaugaauugacagac | ||||
mir-370 | 3005 | 3012 | 1A,M8 | HSA-MIR-370脑 | gccugggggguggaaccugg |
mir-377 | 180 | 187 | 1A,M8 | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |
mir-448 | 1423 | 1430 | 1A,M8 | HSA-MIR-448 | uugcauauguaggauguccccau |
mir-485-3p | 3245 | 3251 | M8 | HSA-MIR-485-3P | gucauacgggcucucucucucucu |
mir-504 | 1507 | 1514年 | 1A,M8 | HSA-MIR-504 | agacccugucugcacucuau |
mir-9 | 1409 | 1415 | 1a | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |
mir-96 | 1407 | 1413 | 1a | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |