概括
基因 64771
象征 C6orf106
同义词 FP852 | DJ391O22.4
描述 染色体6开放阅读框106
参考 MIM:612217|HGNC:HGNC:21215|ENSEMBL:ENSG00000196821|HPRD:12837|Vega:Otthumg0000000014553
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.31
Pascal P值 0.188
Sherlock P值 0.555
胎儿β -1.889
主持人 尾状基底神经节
皮质
额叶皮质BA9
伏隔核基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.04433
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
通过CD40 UP的Hollmann凋亡 201 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钟对偶氮替丁的反应和tsa 183 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge缺氧DN 146 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu衰老的脑dn 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江VHL目标 138 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过VHL的江南缺氧 34 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-132/212 1706年 1712年 M8 HSA-MIR-212SZ uaacagucuccagucacgccc
HSA-MIR-132 uaacagucuacccaugggg
mir-135 323 329 M8 HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
mir-153 1424 1430 1a HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-182 1407 1413 1a HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-192/215 279 285 M8 HSA-MIR-192 cugaccuaugaauugacagcc
HSA-MIR-215 Augaccuaugaauugacagac
mir-370 3005 3012 1A,M8 HSA-MIR-370 gccugggggguggaaccugg
mir-377 180 187 1A,M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-448 1423 1430 1A,M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-485-3p 3245 3251 M8 HSA-MIR-485-3P gucauacgggcucucucucucucu
mir-504 1507 1514年 1A,M8 HSA-MIR-504 agacccugucugcacucuau
mir-9 1409 1415 1a HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga
mir-96 1407 1413 1a HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc