基因页：塞克
概括？
| 基因 | 64781 |
| 象征 | 塞克 |
| 同义词 | lk4 | da59h18.2 | da59h18.3 | hcerk |
| 描述 | 神经酰胺激酶 |
| 参考 | MIM：610307|HGNC：HGNC：19256|ENSEMBL：ENSG00000100422|HPRD：09878|Vega：Otthumg00000150395 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 22q13.31 |
| Pascal P值 | 0.46 |
| Sherlock P值 | 0.002 |
| TADA P值 | 0.012 |
| 胎儿β | 0.804 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| 表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值：1.762 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 塞克 | CHR22 | 47106986 | t | C | NM_022766 NM_022766 |
。 p.189d> g |
拼接 错过 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG03335810 | 22 | 47084511 | 塞克 | 7.46e-5 | 0.583 | 0.025 | DMG：Wockner_2014 |
| CG24041977 | 22 | 47133771 | 塞克 | 4.153E-4 | -0.234 | 0.044 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7370564 | 0 | 塞克 | 64781 | 0.13 | 反式 | |||
| RS695809 | CHR22 | 26278127 | 塞克 | 64781 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000287 | 镁离子结合 | 艾达 | 10947957 | |
| 去：0001729 | 神经酰胺激酶活性 | 艾达 | 11956206 | |
| 去：0004143 | 二酰基甘油激酶活性 | IEA | - | |
| 去：0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
| GO：0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
| 去：0016301 | 激酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007205 | 蛋白激酶C活性的激活 | IEA | - | |
| 去：0006672 | 神经酰胺代谢过程 | 塔斯 | 11956206 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000299 | 膜分数的膜不可或缺 | 艾达 | 11956206 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg鞘脂代谢 | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ST颗粒细胞存活途径 | 27 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome糖磷脂代谢 | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组磷脂代谢 | 198 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组鞘脂代谢 | 69 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wamunyokoli卵巢癌LMP DN | 199 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 | 153 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori小型Bii淋巴细胞UP | 86 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Greenbaum E2A靶向DN | 21 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McClung Creb1靶向 | 100 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伯顿成生成4 | 48 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 被胰岛素抵抗钝化的sartipy | 19 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存率不佳 | 31 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bhati G2M被2methoxyestradiol逮捕 | 125 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪形成PPARG RXRA与H4K20me1标记结合 | 145 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Huang Gata2靶向 | 149 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 雌激素压抑的malik | 12 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向 | 279 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |