概括
基因 648
象征 BMI1
同义词 FLVI2/BMI1 | PCGF4 | RNF51 | FLVI-2/BMI-1
描述 BMI1原始癌基因,Polycomb环手指
参考 MIM:164831|HGNC:HGNC:1066|ENSEMBL:ENSG00000168283|HPRD:01277|Vega:Otthumg0000000017807
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10p11.23
Pascal P值 0.941
Sherlock P值 0.042
胎儿β 1.311
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 染色质重塑基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7972594 CHR12 11724913 BMI1 648 0.19 反式
RS10491979 CHR12 11727969 BMI1 648 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PLA2R1 0.59 0.58
SLC22A6 0.57 0.48
FOXC2 0.56 0.54
islr 0.55 0.60
GJB2 0.55 0.57
C7 0.54 0.61
OGN 0.53 0.58
TMEM132C 0.53 0.66
BMP5 0.53 0.40
F13A1 0.53 0.64
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SNHG12 -0.26 -0.31
C6orf124 -0.24 -0.28
Neurod2 -0.23 -0.24
foxg1b -0.23 -0.22
RPL37 -0.23 -0.36
C14orf23 -0.23 -0.30
AC005921.3 -0.22 -0.32
AC132872.1 -0.22 -0.28
AC073657.2 -0.22 -0.25
CLK1 -0.22 -0.23

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
BMI1 MGC12685 |PCGF4 |RNF51 BMI1 Polycomb环形指癌基因 重构的复合物 Biogrid 9858531
BMI1 MGC12685 |PCGF4 |RNF51 BMI1 Polycomb环形指癌基因 BMI1形成同二聚体。 绑定 9858531
C1orf103 FLJ11269 |RIF1 |RP11-96K19.1 染色体1开放阅读框103 两个杂交 Biogrid 16169070
CBX4 NBP16 |PC2 |HPC2 Chromobox同源物4(PC类同源物,果蝇) 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 9199346|12829790
CBX8 HPC3 |PC3 |RC1 Chromobox同源物8(PC类同源物,果蝇) - HPRD 10825164
E2F6 E2F-6 |MGC111545 E2F转录因子6 - HPRD,Biogrid 11171983
immt DKFZP779P1653 |HMP |MGC111146 |P87 |P87/89 |P89 |Pig4 |PIG52 内膜蛋白,线粒体(线粒体) 两个杂交 Biogrid 16169070
Kat5 esa1 |htatip |htatip1 |plip |提示|TIP60 |CPLA2 K(赖氨酸)乙酰转移酶5 两个杂交 Biogrid 16169070
KIAA1377 - KIAA1377 两个杂交 Biogrid 16169070
MAPKAPK3 3pk |MAPKAP3 有丝分裂原激活的蛋白激酶激活的蛋白激酶3 3PK与BMI1相互作用并磷酸化。 绑定 15563468
mll all-1 |CXXC7 |FLJ11783 |HRX |htrx1 |KMT2A |MLL/GAS7 |mll1a |tet1-mll |TRX1 髓样/淋巴样或混合乳突白血病(Trithorax同源性,果蝇) - HPRD,Biogrid 12829790
PHC1 EDR1 |HPH1 |RAE28 多性瘤同源物1(果蝇) HPH1与BMI1相互作用。 绑定 15563468
PHC1 EDR1 |HPH1 |RAE28 多性瘤同源物1(果蝇) - HPRD,Biogrid 9121482
PHC1 EDR1 |HPH1 |RAE28 多性瘤同源物1(果蝇) - HPRD 9009205
PHC2 EDR2 |HPH2 |MGC163502 |PH2 多瘤同源物2(果蝇) - HPRD,Biogrid 9121482
PTN 竖琴|HBGF8 |hbnf |negf1 pleiotiotirophin 两个杂交 Biogrid 16169070
ring1 ring1a |RNF1 环手指蛋白1 RING1与BMI1相互作用。 绑定 9858531
ring1 ring1a |RNF1 环手指蛋白1 - HPRD,Biogrid 9199346|9858531
RNF2 BAP-1 |BAP1 |丁|HIPI3 |ring1b |ring2 环手指蛋白2 RNF2与BMI1相互作用。 绑定 15563468
ZBTB16 PLZF |ZNF145 锌指和包含16的BTB结构域 - HPRD,Biogrid 12408802


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID MYC活动途径 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riz红细胞分化 77 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化CCNE1 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM MYCN扩增靶向DN 103 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗里德曼衰老DN 13 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shin B细胞淋巴瘤簇2 30 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gottwein的KSHV Mir K12 11 63 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭亮氨酸剥夺 142 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯肝癌 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DORSAM HOXA9靶向DN 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer转移 79 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FAELT B CLL与VH重新排列 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园HSC标记 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando T与MLL融合一起 87 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang由Hoxa9和Meis1 Up永生 31 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦响应集群D3 61 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向DN 314 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克拉斯的加沙表观遗传沉默 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗斯白血病与MLL融合 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN 72 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨髓瘤与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
浆细胞与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 67 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 81 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shaffer IRF4在活化的树突状细胞中的目标 65 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan早期分化基因上升 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利伪虫 43 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足趋化趋化性 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan晚分化基因上升 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集1 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与T 9 11易位 130 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期S 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因