基因页:BMI1
概括?
基因 | 648 |
象征 | BMI1 |
同义词 | FLVI2/BMI1 | PCGF4 | RNF51 | FLVI-2/BMI-1 |
描述 | BMI1原始癌基因,Polycomb环手指 |
参考 | MIM:164831|HGNC:HGNC:1066|ENSEMBL:ENSG00000168283|HPRD:01277|Vega:Otthumg0000000017807 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10p11.23 |
Pascal P值 | 0.941 |
Sherlock P值 | 0.042 |
胎儿β | 1.311 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | 染色质重塑基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7972594 | CHR12 | 11724913 | BMI1 | 648 | 0.19 | 反式 | ||
RS10491979 | CHR12 | 11727969 | BMI1 | 648 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/BMI1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PLA2R1 | 0.59 | 0.58 |
SLC22A6 | 0.57 | 0.48 |
FOXC2 | 0.56 | 0.54 |
islr | 0.55 | 0.60 |
GJB2 | 0.55 | 0.57 |
C7 | 0.54 | 0.61 |
OGN | 0.53 | 0.58 |
TMEM132C | 0.53 | 0.66 |
BMP5 | 0.53 | 0.40 |
F13A1 | 0.53 | 0.64 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SNHG12 | -0.26 | -0.31 |
C6orf124 | -0.24 | -0.28 |
Neurod2 | -0.23 | -0.24 |
foxg1b | -0.23 | -0.22 |
RPL37 | -0.23 | -0.36 |
C14orf23 | -0.23 | -0.30 |
AC005921.3 | -0.22 | -0.32 |
AC132872.1 | -0.22 | -0.28 |
AC073657.2 | -0.22 | -0.25 |
CLK1 | -0.22 | -0.23 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
BMI1 | MGC12685 |PCGF4 |RNF51 | BMI1 Polycomb环形指癌基因 | 重构的复合物 | Biogrid | 9858531 |
BMI1 | MGC12685 |PCGF4 |RNF51 | BMI1 Polycomb环形指癌基因 | BMI1形成同二聚体。 | 绑定 | 9858531 |
C1orf103 | FLJ11269 |RIF1 |RP11-96K19.1 | 染色体1开放阅读框103 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
CBX4 | NBP16 |PC2 |HPC2 | Chromobox同源物4(PC类同源物,果蝇) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 9199346|12829790 |
CBX8 | HPC3 |PC3 |RC1 | Chromobox同源物8(PC类同源物,果蝇) | - | HPRD | 10825164 |
E2F6 | E2F-6 |MGC111545 | E2F转录因子6 | - | HPRD,Biogrid | 11171983 |
immt | DKFZP779P1653 |HMP |MGC111146 |P87 |P87/89 |P89 |Pig4 |PIG52 | 内膜蛋白,线粒体(线粒体) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
Kat5 | esa1 |htatip |htatip1 |plip |提示|TIP60 |CPLA2 | K(赖氨酸)乙酰转移酶5 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
KIAA1377 | - | KIAA1377 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
MAPKAPK3 | 3pk |MAPKAP3 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激活的蛋白激酶3 | 3PK与BMI1相互作用并磷酸化。 | 绑定 | 15563468 |
mll | all-1 |CXXC7 |FLJ11783 |HRX |htrx1 |KMT2A |MLL/GAS7 |mll1a |tet1-mll |TRX1 | 髓样/淋巴样或混合乳突白血病(Trithorax同源性,果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 12829790 |
PHC1 | EDR1 |HPH1 |RAE28 | 多性瘤同源物1(果蝇) | HPH1与BMI1相互作用。 | 绑定 | 15563468 |
PHC1 | EDR1 |HPH1 |RAE28 | 多性瘤同源物1(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 9121482 |
PHC1 | EDR1 |HPH1 |RAE28 | 多性瘤同源物1(果蝇) | - | HPRD | 9009205 |
PHC2 | EDR2 |HPH2 |MGC163502 |PH2 | 多瘤同源物2(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 9121482 |
PTN | 竖琴|HBGF8 |hbnf |negf1 | pleiotiotirophin | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
ring1 | ring1a |RNF1 | 环手指蛋白1 | RING1与BMI1相互作用。 | 绑定 | 9858531 |
ring1 | ring1a |RNF1 | 环手指蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 9199346|9858531 |
RNF2 | BAP-1 |BAP1 |丁|HIPI3 |ring1b |ring2 | 环手指蛋白2 | RNF2与BMI1相互作用。 | 绑定 | 15563468 |
ZBTB16 | PLZF |ZNF145 | 锌指和包含16的BTB结构域 | - | HPRD,Biogrid | 12408802 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID MYC活动途径 | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riz红细胞分化 | 77 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RIZ红细胞分化CCNE1 | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM MYCN扩增靶向DN | 103 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗里德曼衰老DN | 13 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shin B细胞淋巴瘤簇2 | 30 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gottwein的KSHV Mir K12 11 | 63 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭亮氨酸剥夺 | 142 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯肝癌 | 45 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DORSAM HOXA9靶向DN | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer转移 | 79 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FAELT B CLL与VH重新排列 | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
公园HSC标记 | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferrando T与MLL融合一起 | 87 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang由Hoxa9和Meis1 Up永生 | 31 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦响应集群D3 | 61 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克拉斯的加沙表观遗传沉默 | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 | 126 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗斯白血病与MLL融合 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN | 72 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨髓瘤与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
浆细胞与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 67 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 81 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shaffer IRF4在活化的树突状细胞中的目标 | 65 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan早期分化基因上升 | 7 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利伪虫 | 43 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足趋化趋化性 | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan晚分化基因上升 | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集1 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与T 9 11易位 | 130 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期S | 162 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |