Summary
基因ID 6482
象征 ST3GAL1
同义词 gal-nac6s | siat4a | siatfl | st3gala | st3gala.1 | st3galia | st3galia,1 | st3o
描述 ST3β-半乳糖苷Alpha-2,3-溶解酶1
参考 MIM:607187|HGNC:HGNC:10862|ENSEMBL:ENSG00000008513|HPRD:06219|Vega:Otthumg00000164534
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8q24.22
Pascal P值 0.035
Sherlock P值 0.73
胎儿β 1.092
DMG 1(#研究)
主持人 皮质

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 This data set includes 560 SNPs associated with schizophrenia. A total of 486 genes were mapped to these SNPs within 50kb.
CV:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG04188397 8 134582582 ST3GAL1 9.44e-9 -0.014 4.21E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1QB 0.80 0.75
RNASE6 0.79 0.71
C1QA 0.79 0.73
C1QC 0.78 0.69
HCLS1 0.77 0.77
tbxas1 0.76 0.73
APOC2 0.76 0.78
C3AR1 0.75 0.66
CXCL16 0.74 0.82
adora3 0.74 0.68
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RTF1 -0.49 -0.54
AC004017.1 -0.48 -0.50
ZNF551 -0.48 -0.49
KIAA1949 -0.47 -0.41
ZNF124 -0.47 -0.49
mpp3 -0.47 -0.46
mycn -0.47 -0.46
MLLT3 -0.46 -0.43
TMEM57 -0.46 -0.45
ZNF300 -0.46 -0.42

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003836 β-半乳糖苷α-2,3-溶解酶活性 塔斯 10504389
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006486 蛋白氨基酸糖基化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0005576 细胞外区域 IEA -
GO:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0030173 高尔基膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG O GLYCAN BIOSYNTHESIS 30 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG糖胺聚糖生物合成硫酸盐 15 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG GLYCOSPHINGOLIPID BIOSYNTHESIS GLOBO SERIES 14 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kegg糖果果脂生物合成系列系列 15 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME O LINKED GLYCOSYLATION OF MUCINS 59 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
o糖生物合成的反应组终止 24 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Keratan硫酸盐生物合成 26 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Keratan硫酸角质角蛋白代谢 30 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome糖胺聚糖代谢 111 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
蛋白质的反应组代谢 518 242 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome术后翻译蛋白修饰 188 116 All SZGR 2.0 genes in this pathway
碳水化合物的反应组代谢 247 154 All SZGR 2.0 genes in this pathway
周的炎症反应生活 485 293 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王攀登目标DN 186 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VECCHI GASTRIC CANCER ADVANCED VS EARLY UP 175 120 All SZGR 2.0 genes in this pathway
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim WT1靶向 214 155 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim WT1靶向8小时 164 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌变性DN 537 339 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 All SZGR 2.0 genes in this pathway
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP63目标 355 243 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlosser血清反应 134 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ropero HDAC2目标 114 71 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Suz12目标 1038 678 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON 157 87 All SZGR 2.0 genes in this pathway
UEDA PERIFERAL CHICK 169 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿比·lif信号1向上 46 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
康(Kang)由tert dn永生 102 67 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kaab失败的心房DN 141 99 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成2 72 52 All SZGR 2.0 genes in this pathway
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 3 720 440 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 5 482 296 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kondo EZH2目标 245 148 All SZGR 2.0 genes in this pathway
法拉利对fenretinide的反应 22 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
公园维甲酸响应和RARA PLZF融合 22 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ruiz TNC目标 153 107 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对HGF的反应 418 282 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 All SZGR 2.0 genes in this pathway
活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 81 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhan多发性骨髓瘤HP DN 47 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1靶向衰老 572 352 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR DN 505 328 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向 504 321 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3 430 288 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Altemeier对LPS具有机械通气的反应 128 81 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Durand Stroma S向上 297 194 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 All SZGR 2.0 genes in this pathway