概括
基因 64857
象征 plekhg2
同义词 arhgef42 | clg | ldamd
描述 Pleckstrin同源性和含有G2的Rhogef域
参考 MIM:611893|HGNC:HGNC:29515|Ensembl:ENSG0000000090924|HPRD:15148|Vega:Otthumg00000152570
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.2
Pascal P值 0.028
Sherlock P值 0.243
胎儿β 2.496
DMG 1(#研究)
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG25500897 19 39903551 plekhg2 4.19e-8 -0.008 1.17E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Rho GTPases的Reactome信号传导 113 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Nrage通过JNK发出死亡的信号 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞死亡信号通过Nrage NRIF和NADE传导 60 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P75 NTR受体介导的信号传导 81 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha1213信号传导事件 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hendricks Smarca4靶向DN 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild MYC致癌签名 206 117 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kuuselo胰腺癌19Q13扩增 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
winnepenninckx黑色素瘤转移 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kamminga衰老 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kumar自噬网络 71 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因