基因页：BMP1

Summary？
基因 649
象征 BMP1
同义词 OI13|PCOLC|PCP|PCP2|TLD
描述 骨形态发生蛋白1
Reference MIM：112264|HGNC：HGNC：1067|Ensembl:ENSG00000168487|HPRD：00209|Vega：Otthumg0000000097761
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p21.3
Pascal P值 0.387
Sherlock p-value 0.038
胎儿β 0.579
主持人 Myers' cis & trans
元

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I Genome scan meta-analysis Psr: 0.031
gsma_iie Genome scan meta-analysis (European-ancestry samples) PSR：0.00057
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.03086

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 BMP1 649 1.498E-4 反式
RS7584986 CHR2 184111432 BMP1 649 0.02 反式
RS2322831 CHR3 4799093 BMP1 649 0.08 反式
RS4575988 CHR4 19984925 BMP1 649 0.18 反式
rs17037963 CHR4 160061326 BMP1 649 0.03 反式
RS16955618 CHR15 29937543 BMP1 649 2.925e-10 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
LUM 0.86 0.59
COL3A1 0.86 0.57
serpind1 0.80 0.53
egflam 0.79 0.44
OGN 0.78 0.58
OLFML3 0.78 0.52
C7 0.77 0.52
ASPN 0.76 0.53
Col1a2 0.76 0.57
PCOLCE 0.75 0.55
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC018755.7 -0.24 -0.19
AF347015.33 -0.24 -0.22
HEPN1 -0.24 -0.19
S100A1 -0.24 -0.23
rom1 -0.24 -0.24
AF347015.2 -0.24 -0.27
HLA-F -0.24 -0.16
FBXW4 -0.23 -0.17
FXYD1 -0.23 -0.21
AC004241.1 -0.23 -0.20

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005125 细胞因子活性 IEA -
去：0005509 calcium ion binding IEA -
去：0004222 金属肽酶活性 IEA -
去：0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0008083 生长因子活性 IEA -
去：0008233 肽酶活性 艾达 16824737
去：0008233 肽酶活性 IEA -
GO：0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0001502 cartilage condensation TAS 3201241
去：0001503 骨化 IEA -
去：0006508 蛋白水解 艾达 16824737
去：0006508 蛋白水解 IEA -
去：0007275 多细胞生物发育 TAS 7798260
去：0030154 细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005615 细胞外空间 IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR2.0 genes in pathway 信息
Reactome细胞外基质组织 87 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome胶原蛋白形成 58 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME HDL MEDIATED LIPID TRANSPORT 15 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME METABOLISM OF LIPIDS AND LIPOPROTEINS 478 302 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome脂质消化和运输 46 37 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组脂蛋白代谢 28 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DAVICIONI MOLECULAR ARMS VS ERMS DN 182 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与基础DN 455 304 All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗伊伤口血管向上 50 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN UP 612 367 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal乳房3 4WK 214 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN 196 131 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAX3 FOXO1融合DN的Begum目标 45 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
悍马皮肤癌进度DN 100 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
AMUNDSON GENOTOXIC SIGNATURE 105 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹MBD目标 957 597 All SZGR 2.0 genes in this pathway
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 382 224 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿米特血清反应60 mcf10a 57 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shen Smarca2靶向DN 357 212 All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭亮氨酸剥夺 142 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜蜜的克拉斯靶向 84 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭葡萄糖剥夺DN 169 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭雷帕霉素反应dn 245 154 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Cromer转移DN 81 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REN ALVEOLAR RHABDOMYOSARCOMA DN 408 274 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee Calorie限制性新皮层 83 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ramalho茎DN 74 55 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HNE和TBH的Weigel氧化应激 60 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伽玛辐射8G后的生存率不佳 95 62 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee转移和替代剪接 74 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁内斯RB1靶向 673 430 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53靶向 602 364 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 All SZGR 2.0 genes in this pathway
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Labbe TGFB1靶向 102 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 111 70 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Qi Plasmacytoma dn 100 63 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Cromer肿瘤发生 63 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
60张及目标的人力资源 293 203 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MILI假足趋化性DN 457 302 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MILI PSEUDOPODIA HAPTOTAXIS DN 668 419 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Karlsson TGFB1靶向 127 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
康AR目标 17 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 All SZGR 2.0 genes in this pathway
pasini suz12靶向DN 315 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BMI1和PCGF2的Wiederschain目标 57 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2目标 745 475 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kohoutek CCNT1目标 50 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 All SZGR 2.0 genes in this pathway
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kumar自噬网络 71 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
林乳腺干细胞向上 489 314 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA ECM监管机构 238 125 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA女性相关 753 411 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA矩阵 1028 559 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-141/200a 585 591 1a HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
hsa-miR-200a uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-194 587 593 1a HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga