概括
基因 6491
象征 stil
同义词 MCPH7 | SIL
描述 SCL/TAL1中断基因座
参考 MIM:181590|HGNC:HGNC:10879|ENSEMBL:ENSG00000123473|HPRD:01627|Vega:Otthumg00000007851
基因类型 蛋白质编码
地图位置 132
Pascal P值 0.122
胎儿β 1.961
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02963188 1 47779388 stil 6.35e-9 -0.014 3.33e-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS750788 CHR5 180638894 stil 6491 0.13 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AL031587.2 0.48 0.35
micall2 0.48 0.35
RGL3 0.46 0.39
LCNL1 0.45 0.42
AC100783.1 0.45 0.35
COL5A3 0.45 0.42
C1orf175 0.44 0.43
HSP90AB4P 0.44 0.38
AC010300.1 0.43 0.35
SPATC1 0.42 0.34
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PDCD2 -0.43 -0.46
SNRNP27 -0.42 -0.41
TUFM -0.41 -0.46
FBXO22 -0.41 -0.40
最大限度 -0.41 -0.39
TMEM183A -0.41 -0.43
exosc5 -0.41 -0.42
PSMB5 -0.41 -0.45
DCTN2 -0.40 -0.41
ciapin1 -0.40 -0.42

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID刺猬2 Pathway 22 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Sox4靶向DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sotiriou乳腺癌1级vs 3 151 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗斯蒂宫颈癌增殖簇 140 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Furukawa Dusp6靶向PCI35 DN 74 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori小型BII淋巴细胞DN 76 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
郭十六进制目标 81 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramaswamy转移 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽玛辐射2G后的生存率不佳 171 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sarrio上皮间质转变 180 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist IL6剥夺DN 98 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist NRAS信号传导DN 72 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi EGFR信令24小时DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAE BRCA1靶向DN 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G2 182 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因