基因页：SIM1
概括？
| 基因 | 6492 |
| 象征 | SIM1 |
| 同义词 | BHLHE14 |
| 描述 | 一心一意的家庭BHLH转录因子1 |
| 参考 | MIM：603128|HGNC：HGNC：10882|ENSEMBL：ENSG00000112246|HPRD：07049|Vega：Otthumg0000000015275 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6Q16.3 |
| Pascal P值 | 0.816 |
| 胎儿β | -0.449 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG26966124 | 6 | 100912168 | SIM1 | 8.73e-8 | -0.02 | 2.01E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLC13A4 | 0.97 | 0.74 |
| F5 | 0.94 | 0.38 |
| KCNJ13 | 0.94 | 0.30 |
| clic6 | 0.93 | 0.60 |
| ABCA4 | 0.92 | 0.55 |
| prlr | 0.92 | 0.22 |
| CP | 0.91 | 0.32 |
| TRPV4 | 0.89 | 0.39 |
| RBM47 | 0.88 | 0.23 |
| FOLR1 | 0.85 | 0.24 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| LRRC37A | -0.13 | -0.32 |
| AC132872.1 | -0.13 | -0.35 |
| RP11-435I10.1 | -0.12 | -0.35 |
| 拉贝克 | -0.12 | -0.30 |
| RPL23A | -0.12 | -0.44 |
| Znf32 | -0.12 | -0.30 |
| bend5 | -0.12 | -0.25 |
| RPL17P20 | -0.12 | -0.36 |
| RP9 | -0.12 | -0.39 |
| RP9P | -0.12 | -0.30 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004871 | 信号传感器活性 | IEA | - | |
| 去：0003700 | 转录因子活性 | 塔斯 | 8812055|9199934 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| GO：0046982 | 蛋白质异二聚化活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突（GO期限：5） | 9199934 |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| 去：0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005794 | 高尔基体 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Affar YY1目标 | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nakayama软组织肿瘤PCA1 DN | 74 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zembutsu对Nimustine的敏感性 | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-378 | 636 | 642 | 1a | HSA-MIR-378 | cuccugacuccaggucugugu |