概括
基因 64927
象征 TTC23
同义词 HCC-8
描述 四肽重复域23
参考 HGNC:HGNC:25730|ENSEMBL:ENSG00000103852|HPRD:07777|Vega:Otthumg00000147344
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q26.3
Pascal P值 0.244
胎儿beta 0.36
耶和华 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
海马
下丘脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组关联研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 耶和华 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS34567778 15 99642518 TTC23 ENSG00000103852.8 8.327E-7 0.03 148910 gtex_brain_ba24
RS34878632 15 99645262 TTC23 ENSG00000103852.8 8.136E-7 0.03 146166 gtex_brain_ba24
RS8037159 15 99660862 TTC23 ENSG00000103852.8 9.943E-7 0.03 130566 gtex_brain_ba24
RS7178124 15 99773270 TTC23 ENSG00000103852.8 8.389E-7 0.03 18158 gtex_brain_ba24
RS2084900 15 99774542 TTC23 ENSG00000103852.8 8.38e-7 0.03 16886 gtex_brain_ba24
RS55909409 15 99781204 TTC23 ENSG00000103852.8 1.369E-6 0.03 10224 gtex_brain_ba24
RS12591132 15 99784210 TTC23 ENSG00000103852.8 8.145e-7 0.03 7218 gtex_brain_ba24
RS8043311 15 99789742 TTC23 ENSG00000103852.8 8.132E-7 0.03 1686年 gtex_brain_ba24
RS8025136 15 99789951 TTC23 ENSG00000103852.8 8.132E-7 0.03 1477 gtex_brain_ba24
RS62023767 15 99791392 TTC23 ENSG00000103852.8 8.111E-7 0.03 36 gtex_brain_ba24
RS8028374 15 99794174 TTC23 ENSG00000103852.8 5.645e-7 0.03 -2746 gtex_brain_ba24
RS1567417 15 99794611 TTC23 ENSG00000103852.8 5.639E-7 0.03 -3183 gtex_brain_ba24
RS5814930 15 99794742 TTC23 ENSG00000103852.8 5.634E-7 0.03 -3314 gtex_brain_ba24
RS10152794 15 99800698 TTC23 ENSG00000103852.8 5.64e-7 0.03 -9270 gtex_brain_ba24
RS7175165 15 99806661 TTC23 ENSG00000103852.8 1.213E-6 0.03 -15233 gtex_brain_ba24
RS10152456 15 99810848 TTC23 ENSG00000103852.8 5.673E-7 0.03 -19420 gtex_brain_ba24
RS8042439 15 99817442 TTC23 ENSG00000103852.8 7.594e-7 0.03 -26014 gtex_brain_ba24
RS2902154 15 99818978 TTC23 ENSG00000103852.8 5.682E-7 0.03 -27550 gtex_brain_ba24
RS1567418 15 99829531 TTC23 ENSG00000103852.8 5.669E-7 0.03 -38103 gtex_brain_ba24
RS56341787 15 99830069 TTC23 ENSG00000103852.8 5.803E-7 0.03 -38641 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #SZGR 2.0途径中的基因 信息
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌15Q26 AMPLICON 22 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江是缺氧癌 83 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP,带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins UVC响应中间 98 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的毛chia靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因