基因页:TTC23
概括?
基因 | 64927 |
象征 | TTC23 |
同义词 | HCC-8 |
描述 | 四肽重复域23 |
参考 | HGNC:HGNC:25730|ENSEMBL:ENSG00000103852|HPRD:07777|Vega:Otthumg00000147344 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q26.3 |
Pascal P值 | 0.244 |
胎儿beta | 0.36 |
耶和华 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 海马 下丘脑 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS34567778 | 15 | 99642518 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 8.327E-7 | 0.03 | 148910 | gtex_brain_ba24 |
RS34878632 | 15 | 99645262 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 8.136E-7 | 0.03 | 146166 | gtex_brain_ba24 |
RS8037159 | 15 | 99660862 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 9.943E-7 | 0.03 | 130566 | gtex_brain_ba24 |
RS7178124 | 15 | 99773270 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 8.389E-7 | 0.03 | 18158 | gtex_brain_ba24 |
RS2084900 | 15 | 99774542 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 8.38e-7 | 0.03 | 16886 | gtex_brain_ba24 |
RS55909409 | 15 | 99781204 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 1.369E-6 | 0.03 | 10224 | gtex_brain_ba24 |
RS12591132 | 15 | 99784210 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 8.145e-7 | 0.03 | 7218 | gtex_brain_ba24 |
RS8043311 | 15 | 99789742 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 8.132E-7 | 0.03 | 1686年 | gtex_brain_ba24 |
RS8025136 | 15 | 99789951 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 8.132E-7 | 0.03 | 1477 | gtex_brain_ba24 |
RS62023767 | 15 | 99791392 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 8.111E-7 | 0.03 | 36 | gtex_brain_ba24 |
RS8028374 | 15 | 99794174 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 5.645e-7 | 0.03 | -2746 | gtex_brain_ba24 |
RS1567417 | 15 | 99794611 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 5.639E-7 | 0.03 | -3183 | gtex_brain_ba24 |
RS5814930 | 15 | 99794742 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 5.634E-7 | 0.03 | -3314 | gtex_brain_ba24 |
RS10152794 | 15 | 99800698 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 5.64e-7 | 0.03 | -9270 | gtex_brain_ba24 |
RS7175165 | 15 | 99806661 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 1.213E-6 | 0.03 | -15233 | gtex_brain_ba24 |
RS10152456 | 15 | 99810848 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 5.673E-7 | 0.03 | -19420 | gtex_brain_ba24 |
RS8042439 | 15 | 99817442 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 7.594e-7 | 0.03 | -26014 | gtex_brain_ba24 |
RS2902154 | 15 | 99818978 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 5.682E-7 | 0.03 | -27550 | gtex_brain_ba24 |
RS1567418 | 15 | 99829531 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 5.669E-7 | 0.03 | -38103 | gtex_brain_ba24 |
RS56341787 | 15 | 99830069 | TTC23 | ENSG00000103852.8 | 5.803E-7 | 0.03 | -38641 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TTC23_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌15Q26 AMPLICON | 22 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江是缺氧癌 | 83 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP,带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins UVC响应中间 | 98 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合的毛chia靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |