概括
基因 6494
象征 SIPA1
同义词 SPA1
描述 信号诱导的增殖相关1
参考 MIM:602180|HGNC:HGNC:10885|ENSEMBL:ENSG00000213445|HPRD:03713|Vega:Otthumg00000166541
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q13
Pascal P值 0.002
胎儿β 0.049
DMG 2(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 3
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG15425427 11 65406154 SIPA1 2.915E-4 -0.53 0.039 DMG:Wockner_2014
CG26668713 11 65405903 SIPA1 5.579E-4 -0.463 0.049 DMG:Wockner_2014
CG18818531 11 65668277 SIPA1 7.464e-4 6.171 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg白细胞跨内皮迁移 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PDGFRB途径 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Rap1信号传导 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射4的响应4 61 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSAI对电离辐射的响应 149 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
仅通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori大型BII淋巴细胞DN 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEART HDAC增殖集群DN 76 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yu Myc针对DN 55 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成5 126 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27ME1的近代结肠癌HCP 26 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng IL22信号传导DN 42 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼(Hoffmann 75 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoffmann小型前BII至未成熟的B淋巴细胞向上 70 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时DN的响应 114 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因