基因页面:滑雪
总结吗?
| GeneID | 6497年 |
| 象征 | 滑雪 |
| 同义词 | SGS | SKV |
| 描述 | 滑雪原癌基因 |
| 参考 | MIM: 164780|HGNC: HGNC: 10896|运用:ENSG00000157933|HPRD: 01271|织女:OTTHUMG00000001407 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 p36.33 |
| 帕斯卡假定值 | 0.025 |
| 胎儿β | 0.36 |
| DMG | 2(#研究) |
| 支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Montano_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括172复制与精神分裂症之间的联系论文认定。 | 4 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 4 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg10397932 | 1 | 2166155 | 滑雪 | 2.33 e-5 | -0.005 | 0.066 | DMG: Montano_2016 |
| cg21404476 | 1 | 2218549 | 滑雪 | 2.133的军医 | 0.578 | 0.036 | DMG: Wockner_2014 |
| cg01938025 | 1 | 2228319 | 滑雪 | 2.293的军医 | 0.456 | 0.036 | DMG: Wockner_2014 |
| cg19404444 | 1 | 2164602 | 滑雪 | 3.227的军医 | 0.659 | 0.04 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 地铁 | 0.85 | 0.85 |
| TSC1 | 0.82 | 0.83 |
| HERC2 | 0.81 | 0.82 |
| MACF1 | 0.81 | 0.82 |
| GOLGA3 | 0.81 | 0.81 |
| LRP1恰巧 | 0.81 | 0.80 |
| ZZEF1 | 0.80 | 0.81 |
| MLL2 | 0.80 | 0.79 |
| C14orf43 | 0.80 | 0.83 |
| MTF1 | 0.80 | 0.81 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DBI | -0.59 | -0.65 |
| UQCRB | -0.59 | -0.61 |
| rp11 - 884 k10.1 | -0.58 | -0.63 |
| C1orf54 | -0.58 | -0.67 |
| GMFG | -0.57 | -0.65 |
| MTCP1NB | -0.57 | -0.60 |
| GNG11 | -0.56 | -0.64 |
| VAMP5 | -0.56 | -0.59 |
| AF347015.21 | -0.56 | -0.62 |
| RHOC | -0.55 | -0.58 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| HIPK2 | DKFZp686K02111 | FLJ23711 | PRO0593 | homeodomain相互作用蛋白激酶2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12874272 |
| 小君 | AP-1 | AP1 | c-Jun | 小君致癌基因 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12034730 |
| MECP2 | AUTSX3 | DKFZp686A24160 | MRX16 | MRX79 | MRXS13 | MRXSL | PPMX | RTS | RTT | 甲基CpG结合蛋白2 (Rett综合症) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11441023 |
| NCOR1 | KIAA1047 | MGC104216 | N-CoR | TRAC1 | hCIT529I10 | hN-CoR | 核受体若1 | 重新组成复杂 | BioGRID | 11430826 |
| NFIX | NF1A | 核因子I / X (CCAAT-binding转录因子) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9380514 |
| PML | 万立升| PP8675 | RNF71 | TRIM19 | 早幼粒细胞白血病 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11430826 |
| SIN3A | DKFZp434K2235 | FLJ90319 | KIAA0700 | SIN3同族体,转录监管机构(酵母) | 重新组成复杂 | BioGRID | 11430826 |
| 滑雪 | SKV | v-ski肉瘤病毒致癌基因相同器官(禽流感) | 重新组成复杂 | BioGRID | 9927733 |
| 滑雪 | SKV | v-ski肉瘤病毒致癌基因相同器官(禽流感) | c-Ski结伴本身。 | 绑定 | 10575014 |
| 斯基尔 | SNO | SnoA |平 | SKI-like致癌基因 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9927733 |
| SMAD1 | BSP1 | JV4-1 | JV41 | MADH1 | MADR1 | SMAD家庭成员1 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 12874272 |
| SMAD2 | JV18 | JV18-1 | MADH2 | MADR2 | MGC22139 | MGC34440 | hMAD-2 | hSMAD2 | SMAD家庭成员2 | c-Ski与Smad2交互。这种交互建模在证明之间的相互作用和人类c-Ski Smad2从一个未指明的来源。 | 绑定 | 10575014 |
| SMAD2 | JV18 | JV18-1 | MADH2 | MADR2 | MGC22139 | MGC34440 | hMAD-2 | hSMAD2 | SMAD家庭成员2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10485843 |
| SMAD3 | DKFZp586N0721 | DKFZp686J10186 | HSPC193 | HsT17436 | JV15-2 | MADH3 | MGC60396 | SMAD家庭成员3 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12857746 |
| SMAD3 | DKFZp586N0721 | DKFZp686J10186 | HSPC193 | HsT17436 | JV15-2 | MADH3 | MGC60396 | SMAD家庭成员3 | c-Ski与Smad3交互。这种交互建模在证明之间的相互作用和人类c-Ski Smad3从一个未指明的来源。 | 绑定 | 10575014 |
| SMAD4 | DPC4似|吉格| MADH4 | SMAD家庭成员4 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12419246|12857746 |
| SMAD4 | DPC4似|吉格| MADH4 | SMAD家庭成员4 | Smad4与滑雪。这种交互是仿照人类Smad4证明之间的交互和滑雪从一个未指明的物种。 | 绑定 | 15761153 |
| SMAD4 | DPC4似|吉格| MADH4 | SMAD家庭成员4 | 和Smad4 c-Ski交互。之间的交互是仿照了交互Smad4从源和人类c-Ski不详。 | 绑定 | 10575014 |
| SNW1 | Bx42 | MGC119379 | ncoa - 62 | PRPF45 | Prp45 | SKIIP |跳过 | SNW域包含1 | 亲和力Capture-Western 表型抑制 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 9569025|11278756 |11522815 |
| SNW1 | Bx42 | MGC119379 | ncoa - 62 | PRPF45 | Prp45 | SKIIP |跳过 | SNW域包含1 | - - - - - - | HPRD | 9569025|11522815 |
| TUBA1B | K-ALPHA-1 | 微管蛋白、α1 b | 滑雪与alpha-tubulin交互。 | 绑定 | 15806149 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID SMAD2 3核通路 | 82年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID BMP通路 | 42 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID CMYB通路 | 84年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME BMP信号的 | 23 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME转录活性SMAD2 SMAD3 SMAD4 HETEROTRIMER | 38 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SMAD2 3 SMAD4差别REACTOME对这些基因的转录活性 | 20. | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME通用转录途径 | 352年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME转化生长因子β受体信号的复杂 | 63年 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 奥斯曼膀胱癌DN | 406年 | 230年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOHANKUMAR TLX1目标了 | 414年 | 287年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ELK3严重缺氧 | 209年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 鲜明的前额叶皮层22 q11删除 | 195年 | 138年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 谢泼德粉碎和燃烧突变DN | 185年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃长期造血干细胞 | 302年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 张增殖与静 | 51 | 41 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伯顿脂肪生成8 | 86年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王肿瘤侵袭性了 | 374年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 黄成人组织干细胞模块 | 721年 | 492年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARTENS受PML RARA融合 | 456年 | 287年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LIM乳腺干细胞 | 489年 | 314年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |