基因页：skiv2l
概括？
| 基因 | 6499 |
| 象征 | skiv2l |
| 同义词 | 170a | ddx13 | hlp | ski2 | ski2w | skiv2 | skiv2l1 | thes2 |
| 描述 | SKI2像RNA解旋酶 |
| 参考 | MIM：600478|HGNC：HGNC：10898|Ensembl：ENSG00000204351|HPRD：02724|Vega：Otthumg00000031146 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21 |
| Pascal P值 | 6.607E-7 |
| Sherlock P值 | 0.141 |
| 胎儿β | -0.65 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 下丘脑 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 2 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG24271566 | 6 | 31936481 | skiv2l | 7.03e-5 | 0.472 | 0.025 | DMG：Wockner_2014 |
| CG13035743 | 6 | 32119685 | skiv2l | 3.47E-5 | 4.88 | DMG：Vaneijk_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TMEM184B | 0.86 | 0.87 |
| ACO2 | 0.85 | 0.85 |
| GM2A | 0.84 | 0.82 |
| IPO13 | 0.84 | 0.85 |
| KLHL21 | 0.83 | 0.83 |
| 阿拉德 | 0.83 | 0.84 |
| TMEM189 | 0.82 | 0.81 |
| aatk | 0.82 | 0.79 |
| PDK2 | 0.82 | 0.80 |
| pycr2 | 0.82 | 0.81 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C9orf46 | -0.51 | -0.55 |
| RPS3AP47 | -0.48 | -0.50 |
| RPL31 | -0.47 | -0.51 |
| RPL13AP22 | -0.47 | -0.67 |
| FAM36A | -0.47 | -0.46 |
| RPL24 | -0.45 | -0.49 |
| RBMX2 | -0.45 | -0.48 |
| FAM159B | -0.45 | -0.69 |
| exosc8 | -0.45 | -0.46 |
| RP11-1134I14.1 | -0.45 | -0.51 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0003676 | 核酸结合 | IEA | - | |
| 去：0003723 | RNA结合 | IEA | - | |
| 去：0004004 | 依赖ATP的RNA解旋酶活性 | 塔斯 | 7610041 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15231747 | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| GO：0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016818 | 水解酶活性，作用在酸酐上，含磷酸酐 | IEA | - | |
| 去：0008026 | ATP依赖性解旋酶活性 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KeGG RNA降解 | 59 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王攀登目标 | 269 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nouzova维甲酸和H4乙酰化 | 143 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WELCSH BRCA1靶向DN | 141 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SPI1和FLI1的Juban目标 | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |