概括?
基因ID 6502
Symbol SKP2
同义词 fbl1 | fbxl1 | flb1 | p45
描述 S-phase kinase-associated protein 2, E3 ubiquitin protein ligase
参考 MIM:601436|HGNC:HGNC:10901|Ensembl:ENSG00000145604|HPRD:03256|Vega:OTTHUMG00000131106
基因type protein-coding
地图位置 5p13
Pascal P值 0.091
Sherlock P值 0.01
Fetal beta 1.243

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 Info
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
IRX3 0.77 0.28
C5orf38 0.70 0.20
GMPR 0.70 0.15
LFNG 0.70 0.50
EDNRB 0.67 0.37
AC015908.2 0.66 0.25
ENTPD2 0.66 0.38
C10orf105 0.66 0.33
RPE65 0.63 0.25
纤维 0.62 0.50
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
克里姆 -0.24 -0.28
ITPKA -0.23 -0.26
ABCC12 -0.23 -0.19
tagln3 -0.22 -0.30
CHN1 -0.22 -0.14
CA11 -0.22 -0.24
CAP2 -0.22 -0.15
ARPP19 -0.22 -0.20
SLC26A4 -0.21 -0.17
RGS4 -0.21 -0.17

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
CCNA2 CCN1 |CCNA 细胞周期蛋白A2 - HPRD,Biogrid 9858587
CCNE1 CCNE 细胞周期蛋白E1 - HPRD,Biogrid 11237742
CCNT1 CCNT |Cyct1 细胞周期蛋白T1 - HPRD 11689688
CDC34 E2-CDC34 |UBC3 |ube2r1 cell division cycle 34 homolog (S. cerevisiae) - HPRD 9430629
CDK2 p33(CDK2) 细胞周期蛋白依赖性激酶2 Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
BioGRID 10559858|15355997
CDK2 p33(CDK2) 细胞周期蛋白依赖性激酶2 - HPRD 10386600
CDK9 C-2k | CDC2L4 | CTK1 | PITALRE | TAK 细胞周期蛋白依赖性激酶9 - HPRD,Biogrid 11689688
CDK9 C-2k | CDC2L4 | CTK1 | PITALRE | TAK 细胞周期蛋白依赖性激酶9 - HPRD 11689688|12861003
CDKN1B CDKN4 | KIP1 | MEN1B | MEN4 | P27KIP1 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B(P27,KIP1) - HPRD 10559916
CDKN1B CDKN4 | KIP1 | MEN1B | MEN4 | P27KIP1 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B(P27,KIP1) Affinity Capture-Western
Biochemical Activity
Reconstituted Complex
BioGRID 12042314|12140288
|12813041
CDKN1B CDKN4 | KIP1 | MEN1B | MEN4 | P27KIP1 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B(P27,KIP1) CDKN1B(P27KIP1)与SKP2(P45SKP2)相互作用。 BIND 15735731
CDKN1B CDKN4 | KIP1 | MEN1B | MEN4 | P27KIP1 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B(P27,KIP1) Skp2 interacts with p27. BIND 15469821
CDKN1C BWCR | BWS | KIP2 | WBS | p57 cyclin-dependent kinase inhibitor 1C (p57, Kip2) - HPRD,Biogrid 12925736
CDT1 dup |RIS2 chromatin licensing and DNA replication factor 1 - HPRD,Biogrid 12840033
CKS1B CKS1 |PNAS-16 |PNAS-18 |CKSHS1 CDC28蛋白激酶调节亚基1B Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
BioGRID 11231585|12140288
|12813041
CKS1B CKS1 |PNAS-16 |PNAS-18 |CKSHS1 CDC28蛋白激酶调节亚基1B - HPRD 11231585|12813041
CUL1 MGC149834 | MGC149835 卡林1 - HPRD,Biogrid 9430629
CUL1 MGC149834 | MGC149835 卡林1 Skp2-Fbox interacts with Cul1 [15-410] to form part of the Cul1-Rbx1-Skp1-F Boxskp2 Scf Ubiquitin Ligase complex. BIND 11961546
E2F1 E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 E2F转录因子1 - HPRD,Biogrid 10559858
FZR1 CDC20C |CDH1 |fzr |fzr2 |HCDH |HCDH1 |KIAA1242 fizzy/cell division cycle 20 related 1 (Drosophila) Cdh1 interacts with Skp2. BIND 15014503
GPS1 COPS1 | CSN1 | MGC71287 G蛋白途径抑制器1 - HPRD 11337588
mybl2 B-myb |bmyb |MGC15600 v-myb myeloblastosis viral oncogene homolog (avian)-like 2 - HPRD,Biogrid 10871850
ORC1L HSORC1 |ORC1 |PARC1 起源识别综合体,亚基1状(酵母) - HPRD,Biogrid 11931757
RB1 OSRC | RB | p105-Rb | pRb | pp110 视网膜细胞瘤1 SKP2与RB相互作用。 BIND 15469821
SKP1 EMC19 | MGC34403 | OCP-II | OCP2 | SKP1A | TCEB1L | p19A S期激酶相关蛋白1 SKP2-FBOX与SKP1A相互作用,形成CUL1-RBX1-SKP1-F BOXSKP2 SCF泛素连接酶复合物的一部分。 BIND 11961546
SKP1 EMC19 | MGC34403 | OCP-II | OCP2 | SKP1A | TCEB1L | p19A S期激酶相关蛋白1 - HPRD 9430629|9827542 | 11099048
SKP1 EMC19 | MGC34403 | OCP-II | OCP2 | SKP1A | TCEB1L | p19A S期激酶相关蛋白1 Affinity Capture-Western
Co-crystal Structure
Reconstituted Complex
两个杂交
BioGRID 9827542|10531035
|10559858|10918611
|11099048|12609982
TCF3 e2a |itf1 |MGC129647 |MGC129648 |BHLHB21 transcription factor 3 (E2A immunoglobulin enhancer binding factors E12/E47) - HPRD,Biogrid 14592976
TSC2 FLJ43106 |林|TSC4 结节硬化2 Phenotypic Suppression BioGRID 15355997
UXT ART-27 普遍表达的转录本 STAP1 interacts with SKP2. BIND 14615539
wee1 DKFZp686I18166 | FLJ16446 | WEE1A | WEE1hu wee1homolog (S. pombe) WEE1A与SKP2的未指定同工型相互作用。 BIND 15070733


V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
KEGG CELL CYCLE 128 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG泛素介导的蛋白水解 138 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PATHWAYS IN CANCER 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小细胞肺癌 84 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta G1途径 28 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta SKP2E2F途径 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta P27途径 13 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Notch途径 59 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FOXO PATHWAY 49 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MYC PATHWAY 25 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FOXM1途径 40 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P53 REGULATION PATHWAY 59 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RB 1 Pathway 65 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
G1 S转变期间的Reactome Cyclin E相关事件 65 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G1 PHASE 38 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G1 S过渡 112 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MITOTIC G1 G1 S PHASES 137 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
有丝分裂细胞周期的反应组调节 85 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME APC C CDH1 MEDIATED DEGRADATION OF CDC20 AND OTHER APC C CDH1 TARGETED PROTEINS IN LATE MITOSIS EARLY G1 72 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CLASS I MHC MEDIATED ANTIGEN PROCESSING PRESENTATION 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome s阶段 109 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SCFSKP2 MEDIATED DEGRADATION OF P27 P21 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU SOX4 TARGETS DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni pax foxo1手臂签名 59 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
igarashi atf4靶向dn 90 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni Rhabdomyosarcoma PAX FOXO1融合 64 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TURASHVILI BREAST NORMAL DUCTAL VS LOBULAR UP 68 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PRAMOONJAGO SOX4 TARGETS DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Puiffe入侵被腹水抑制 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG LMO4 TARGETS UP 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY UP 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL UP 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS TURQUOISE DN 53 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 TARGETS UP 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC2 TARGETS UP 114 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOZGIT ESR1 TARGETS UP 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KONG E2F3 TARGETS 97 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER BASAL VS LULMINAL 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Honrado乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SNIJDERS AMPLIFIED IN HEAD AND NECK TUMORS 37 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WOOD EBV EBNA1 TARGETS UP 110 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA XPRSS INT NETWORK 168 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA2 PCC NETWORK 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA CENTERED NETWORK 117 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARCIA TARGETS OF FLI1 AND DAX1 DN 176 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEGMEIER PRE-MITOTIC CELL CYCLE REGULATORS 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 1 DN 169 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANSOM APC TARGETS UP 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFMANN CELL LYMPHOMA UP 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vernell视网膜母细胞瘤路径 70 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 UP 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD HRAS ONCOGENIC SIGNATURE 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOUGLAS BMI1 TARGETS DN 314 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY E2F4 UNSTIMULATED 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEIN ESRRA TARGETS RESPONSIVE TO ESTROGEN DN 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS UP 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS UP 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MITSIADES RESPONSE TO APLIDIN DN 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL UP 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEN HOXA5 TARGETS 9HR DN 41 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向DN 68 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布卢姆反应这么ASIB DN 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA C CLUSTER UP 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C 47 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reichert G1S调节器作为PI3K目标 8 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 60HR DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROONQUIST IL6 DEPRIVATION DN 98 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRCA1的Pujana乳腺癌突变 56 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein ESR1目标 85 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA PCA3 DN 69 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITFIELD CELL CYCLE G1 S 147 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STAMBOLSKY BOUND BY MUTATED TP53 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU EZH2 TARGETS DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR UP 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gabriely miR21靶标 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acosta增殖独立MYC靶向 84 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1 TARGETS DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang GATA2靶向DN 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE VIA P38 COMPLETE 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YU BAP1 TARGETS 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因