基因页:SKP2
概括?
基因ID | 6502 |
Symbol | SKP2 |
同义词 | fbl1 | fbxl1 | flb1 | p45 |
描述 | S-phase kinase-associated protein 2, E3 ubiquitin protein ligase |
参考 | MIM:601436|HGNC:HGNC:10901|Ensembl:ENSG00000145604|HPRD:03256|Vega:OTTHUMG00000131106 |
基因type | protein-coding |
地图位置 | 5p13 |
Pascal P值 | 0.091 |
Sherlock P值 | 0.01 |
Fetal beta | 1.243 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | Info |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
IRX3 | 0.77 | 0.28 |
C5orf38 | 0.70 | 0.20 |
GMPR | 0.70 | 0.15 |
LFNG | 0.70 | 0.50 |
EDNRB | 0.67 | 0.37 |
AC015908.2 | 0.66 | 0.25 |
ENTPD2 | 0.66 | 0.38 |
C10orf105 | 0.66 | 0.33 |
RPE65 | 0.63 | 0.25 |
纤维 | 0.62 | 0.50 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
克里姆 | -0.24 | -0.28 |
ITPKA | -0.23 | -0.26 |
ABCC12 | -0.23 | -0.19 |
tagln3 | -0.22 | -0.30 |
CHN1 | -0.22 | -0.14 |
CA11 | -0.22 | -0.24 |
CAP2 | -0.22 | -0.15 |
ARPP19 | -0.22 | -0.20 |
SLC26A4 | -0.21 | -0.17 |
RGS4 | -0.21 | -0.17 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CCNA2 | CCN1 |CCNA | 细胞周期蛋白A2 | - | HPRD,Biogrid | 9858587 |
CCNE1 | CCNE | 细胞周期蛋白E1 | - | HPRD,Biogrid | 11237742 |
CCNT1 | CCNT |Cyct1 | 细胞周期蛋白T1 | - | HPRD | 11689688 |
CDC34 | E2-CDC34 |UBC3 |ube2r1 | cell division cycle 34 homolog (S. cerevisiae) | - | HPRD | 9430629 |
CDK2 | p33(CDK2) | 细胞周期蛋白依赖性激酶2 | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 10559858|15355997 |
CDK2 | p33(CDK2) | 细胞周期蛋白依赖性激酶2 | - | HPRD | 10386600 |
CDK9 | C-2k | CDC2L4 | CTK1 | PITALRE | TAK | 细胞周期蛋白依赖性激酶9 | - | HPRD,Biogrid | 11689688 |
CDK9 | C-2k | CDC2L4 | CTK1 | PITALRE | TAK | 细胞周期蛋白依赖性激酶9 | - | HPRD | 11689688|12861003 |
CDKN1B | CDKN4 | KIP1 | MEN1B | MEN4 | P27KIP1 | 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B(P27,KIP1) | - | HPRD | 10559916 |
CDKN1B | CDKN4 | KIP1 | MEN1B | MEN4 | P27KIP1 | 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B(P27,KIP1) | Affinity Capture-Western Biochemical Activity Reconstituted Complex |
BioGRID | 12042314|12140288 |12813041 |
CDKN1B | CDKN4 | KIP1 | MEN1B | MEN4 | P27KIP1 | 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B(P27,KIP1) | CDKN1B(P27KIP1)与SKP2(P45SKP2)相互作用。 | BIND | 15735731 |
CDKN1B | CDKN4 | KIP1 | MEN1B | MEN4 | P27KIP1 | 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B(P27,KIP1) | Skp2 interacts with p27. | BIND | 15469821 |
CDKN1C | BWCR | BWS | KIP2 | WBS | p57 | cyclin-dependent kinase inhibitor 1C (p57, Kip2) | - | HPRD,Biogrid | 12925736 |
CDT1 | dup |RIS2 | chromatin licensing and DNA replication factor 1 | - | HPRD,Biogrid | 12840033 |
CKS1B | CKS1 |PNAS-16 |PNAS-18 |CKSHS1 | CDC28蛋白激酶调节亚基1B | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 11231585|12140288 |12813041 |
CKS1B | CKS1 |PNAS-16 |PNAS-18 |CKSHS1 | CDC28蛋白激酶调节亚基1B | - | HPRD | 11231585|12813041 |
CUL1 | MGC149834 | MGC149835 | 卡林1 | - | HPRD,Biogrid | 9430629 |
CUL1 | MGC149834 | MGC149835 | 卡林1 | Skp2-Fbox interacts with Cul1 [15-410] to form part of the Cul1-Rbx1-Skp1-F Boxskp2 Scf Ubiquitin Ligase complex. | BIND | 11961546 |
E2F1 | E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 | E2F转录因子1 | - | HPRD,Biogrid | 10559858 |
FZR1 | CDC20C |CDH1 |fzr |fzr2 |HCDH |HCDH1 |KIAA1242 | fizzy/cell division cycle 20 related 1 (Drosophila) | Cdh1 interacts with Skp2. | BIND | 15014503 |
GPS1 | COPS1 | CSN1 | MGC71287 | G蛋白途径抑制器1 | - | HPRD | 11337588 |
mybl2 | B-myb |bmyb |MGC15600 | v-myb myeloblastosis viral oncogene homolog (avian)-like 2 | - | HPRD,Biogrid | 10871850 |
ORC1L | HSORC1 |ORC1 |PARC1 | 起源识别综合体,亚基1状(酵母) | - | HPRD,Biogrid | 11931757 |
RB1 | OSRC | RB | p105-Rb | pRb | pp110 | 视网膜细胞瘤1 | SKP2与RB相互作用。 | BIND | 15469821 |
SKP1 | EMC19 | MGC34403 | OCP-II | OCP2 | SKP1A | TCEB1L | p19A | S期激酶相关蛋白1 | SKP2-FBOX与SKP1A相互作用,形成CUL1-RBX1-SKP1-F BOXSKP2 SCF泛素连接酶复合物的一部分。 | BIND | 11961546 |
SKP1 | EMC19 | MGC34403 | OCP-II | OCP2 | SKP1A | TCEB1L | p19A | S期激酶相关蛋白1 | - | HPRD | 9430629|9827542 | 11099048 |
SKP1 | EMC19 | MGC34403 | OCP-II | OCP2 | SKP1A | TCEB1L | p19A | S期激酶相关蛋白1 | Affinity Capture-Western Co-crystal Structure Reconstituted Complex 两个杂交 |
BioGRID | 9827542|10531035 |10559858|10918611 |11099048|12609982 |
TCF3 | e2a |itf1 |MGC129647 |MGC129648 |BHLHB21 | transcription factor 3 (E2A immunoglobulin enhancer binding factors E12/E47) | - | HPRD,Biogrid | 14592976 |
TSC2 | FLJ43106 |林|TSC4 | 结节硬化2 | Phenotypic Suppression | BioGRID | 15355997 |
UXT | ART-27 | 普遍表达的转录本 | STAP1 interacts with SKP2. | BIND | 14615539 |
wee1 | DKFZp686I18166 | FLJ16446 | WEE1A | WEE1hu | wee1homolog (S. pombe) | WEE1A与SKP2的未指定同工型相互作用。 | BIND | 15070733 |
V.途径注释
Pathway name | Pathway size | #szgr 2.0基因 | Info |
---|---|---|---|
KEGG CELL CYCLE | 128 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG泛素介导的蛋白水解 | 138 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG PATHWAYS IN CANCER | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小细胞肺癌 | 84 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta G1途径 | 28 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta SKP2E2F途径 | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta P27途径 | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Notch途径 | 59 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FOXO PATHWAY | 49 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID MYC PATHWAY | 25 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FOXM1途径 | 40 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P53 REGULATION PATHWAY | 59 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID RB 1 Pathway | 65 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CELL CYCLE | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
G1 S转变期间的Reactome Cyclin E相关事件 | 65 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME G1 PHASE | 38 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G1 S过渡 | 112 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME MITOTIC G1 G1 S PHASES | 137 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
有丝分裂细胞周期的反应组调节 | 85 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME APC C CDH1 MEDIATED DEGRADATION OF CDC20 AND OTHER APC C CDH1 TARGETED PROTEINS IN LATE MITOSIS EARLY G1 | 72 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CLASS I MHC MEDIATED ANTIGEN PROCESSING PRESENTATION | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome s阶段 | 109 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SCFSKP2 MEDIATED DEGRADATION OF P27 P21 | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIU SOX4 TARGETS DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni pax foxo1手臂签名 | 59 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
igarashi atf4靶向dn | 90 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni Rhabdomyosarcoma PAX FOXO1融合 | 64 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TURASHVILI BREAST NORMAL DUCTAL VS LOBULAR UP | 68 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PRAMOONJAGO SOX4 TARGETS DN | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Puiffe入侵被腹水抑制 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WANG LMO4 TARGETS UP | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY UP | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL UP | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS TURQUOISE DN | 53 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SENESE HDAC1 TARGETS UP | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SENESE HDAC2 TARGETS UP | 114 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM WT1 TARGETS DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GOZGIT ESR1 TARGETS UP | 149 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KONG E2F3 TARGETS | 97 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FARMER BREAST CANCER BASAL VS LULMINAL | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Honrado乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SNIJDERS AMPLIFIED IN HEAD AND NECK TUMORS | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WOOD EBV EBNA1 TARGETS UP | 110 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA XPRSS INT NETWORK | 168 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA2 PCC NETWORK | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA ATM PCC NETWORK | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA CENTERED NETWORK | 117 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LOPEZ MBD TARGETS | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GARCIA TARGETS OF FLI1 AND DAX1 DN | 176 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
STEGMEIER PRE-MITOTIC CELL CYCLE REGULATORS | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ONDER CDH1 TARGETS 1 DN | 169 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MANALO缺氧DN | 289 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SANSOM APC TARGETS UP | 126 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOFMANN CELL LYMPHOMA UP | 50 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vernell视网膜母细胞瘤路径 | 70 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21 TARGETS 2 UP | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BILD HRAS ONCOGENIC SIGNATURE | 261 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DOUGLAS BMI1 TARGETS DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARSON BOUND BY E2F4 UNSTIMULATED | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
STEIN ESRRA TARGETS RESPONSIVE TO ESTROGEN DN | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTINEZ RB1 TARGETS UP | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTINEZ TP53 TARGETS UP | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fujii YBX1靶向DN | 202 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MITSIADES RESPONSE TO APLIDIN DN | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID BREAST CANCER BASAL UP | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质肿瘤 | 294 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHEN HOXA5 TARGETS 9HR DN | 41 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN NPAS4靶向DN | 68 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
布卢姆反应这么ASIB DN | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA C CLUSTER UP | 38 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C | 47 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reichert G1S调节器作为PI3K目标 | 8 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHANG TLX TARGETS 60HR DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CROONQUIST IL6 DEPRIVATION DN | 98 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BRCA1的Pujana乳腺癌突变 | 56 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein ESR1目标 | 85 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA PCA3 DN | 69 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WHITFIELD CELL CYCLE G1 S | 147 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
STAMBOLSKY BOUND BY MUTATED TP53 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LU EZH2 TARGETS DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR UP | 324 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acosta增殖独立MYC靶向 | 84 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE BMP2 TARGETS DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1 TARGETS DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huang GATA2靶向DN | 72 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PHONG TNF RESPONSE VIA P38 COMPLETE | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YU BAP1 TARGETS | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |