基因页：Slamf1
概括？
| 基因 | 6504 |
| 象征 | Slamf1 |
| 同义词 | CD150 | CDW150 | SLAM |
| 描述 | 信号传导淋巴细胞激活分子家族成员1 |
| 参考 | MIM：603492|HGNC：HGNC：10903|ENSEMBL：ENSG00000117090|HPRD：04603|Vega：Otthumg00000024006 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q23.3 |
| 胎儿β | 0.14 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG18881723 | 1 | 160616870 | Slamf1 | -0.032 | 0.31 | DMG：Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| COLEC12 | 0.71 | 0.74 |
| ABCA9 | 0.69 | 0.70 |
| OLFML1 | 0.67 | 0.70 |
| kank2 | 0.65 | 0.67 |
| CFI | 0.65 | 0.58 |
| TBX18 | 0.65 | 0.62 |
| LTBR | 0.65 | 0.71 |
| SLC22A6 | 0.64 | 0.72 |
| ITIH5 | 0.64 | 0.70 |
| Emilin2 | 0.64 | 0.70 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RP9 | -0.44 | -0.54 |
| ZNF821 | -0.43 | -0.49 |
| ZNF133 | -0.42 | -0.46 |
| rpain | -0.42 | -0.51 |
| DUSP12 | -0.42 | -0.54 |
| DPF1 | -0.41 | -0.48 |
| ZNF836 | -0.41 | -0.50 |
| arl9 | -0.41 | -0.50 |
| ZNF250 | -0.41 | -0.46 |
| mpp3 | -0.41 | -0.49 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003823 | 抗原结合 | 塔斯 | 7617038 | |
| 去：0004888 | 跨膜受体活性 | 塔斯 | 7617038 | |
| 去：0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008284 | 细胞增殖的阳性调节 | 塔斯 | 7617038 | |
| GO：0044419 | 生物之间的种间相互作用 | IEA | - | |
| GO：0046649 | 淋巴细胞激活 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0009986 | 细胞表面 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Huttmann B Cll生存不良DN | 60 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mattioli Mgus vs PCL | 116 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU HGF靶向Akt1 DN抑制 | 95 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dirmeier LMP1响应早期 | 66 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 | 94 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Basso CD40信号向上 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Su胸腺 | 20 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindstedt树突状细胞成熟B | 53 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 | 245 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 李双极性胸腺细胞 | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ewsr1 fli1融合top20 up的torchia目标 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Huang GATA2靶向DN | 72 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOSCO TH1细胞毒性模块 | 114 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |