基因页：SLC1A1

Summary？
基因 6505
象征 SLC1A1
Synonyms dcbxa | eaac1 | eaat3 | sczd18
Description solute carrier family 1 member 1
Reference MIM：133550|HGNC:HGNC:10939|ENSEMBL：ENSG00000106688|HPRD：00597|Vega：Otthumg0000000019468
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9p24
Pascal P值 0.412
Sherlock p-value 0.125
主持人 小脑半球
Myers' cis & trans
支持 METABOTROPIC GLUTAMATE RECEPTOR
神经递质代谢
潜在的突触基因

基因in Data Sources
基因集名称 基因的方法设置 Description 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature High-throughput literature-search 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：3

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7084863 Chr10 6753797 SLC1A1 6505 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Atrn 0.91 0.93
LARP4B 0.89 0.90
ABHD2 0.89 0.90
MGAT5 0.89 0.90
CEP68 0.88 0.89
atp9a 0.88 0.90
KIAA1432 0.88 0.90
mtor 0.88 0.90
HDAC4 0.87 0.89
SRGAP3 0.87 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1orf54 -0.63 -0.71
AF347015.21 -0.62 -0.68
FXYD1 -0.62 -0.61
MT-CO2 -0.60 -0.64
AF347015.31 -0.60 -0.63
HIGD1B -0.59 -0.62
SAT1 -0.59 -0.63
S100A13 -0.59 -0.63
AC021016.1 -0.57 -0.58
VAMP5 -0.57 -0.55

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0015501 谷氨酸：钠合作蛋白活性 IEA glutamate (GO term level: 11) -
GO：0015293 symporter activity IEA -
GO：0017153 钠：二羧酸酯分类蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007268 synaptic transmission TAS 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） 7521911
GO:0015813 L-glutamate transport TAS 谷氨酸（GO期限：9） 7521911
去：0006835 二羧酸转运 IEA -
GO:0006810 运输 IEA -
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005624 膜分数 TAS 7521911
去：0016020 membrane IEA -
去：0005887 integral to plasma membrane TAS 7521911

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
反应组谷氨酸神经递质释放周期 15 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
跨化学突触的反应组传播 186 155 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome神经元系统 279 221 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome神经递质释放周期 34 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
小分子的反应组跨膜转运 413 270 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME TRANSPORT OF INORGANIC CATIONS ANIONS AND AMINO ACIDS OLIGOPEPTIDES 94 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白 49 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 All SZGR 2.0 genes in this pathway
deurig t细胞促进性白血病 368 234 All SZGR 2.0 genes in this pathway
纽曼ERCC6靶向DN 39 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DN BASAKI YBX1目标 384 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 24HR UP 557 331 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 All SZGR 2.0 genes in this pathway
冷吉非替尼抵抗DN 230 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DELYS THYROID CANCER DN 232 154 All SZGR 2.0 genes in this pathway
环氧素DN的浓凋亡 172 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mahadevan伊马替尼抵抗 23 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUYTTEN NIPP1 TARGETS DN 848 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BENPORATH NANOG TARGETS 988 594 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CERVERA SDHB靶向1个 118 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Petrova内皮淋巴与血液DN 162 102 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LU AGING BRAIN DN 153 120 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KAYO AGING MUSCLE UP 244 165 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ehrlich ICF综合症DN 15 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KAYO CALORIE RESTRICTION MUSCLE UP 95 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
RIGGINS TAMOXIFEN RESISTANCE DN 220 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
骨骼中的Smid乳腺癌复发 97 61 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID BREAST CANCER RELAPSE IN LUNG DN 37 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID乳腺癌腔内B 172 109 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础DN 701 446 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MOOTHA HUMAN MITODB 6 2002 429 260 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mootha线粒体 447 277 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Han Satb1靶向DN 442 275 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MEISSNER NPC HCP WITH H3 UNMETHYLATED 536 296 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CAIRO HEPATOBLASTOMA DN 267 160 All SZGR 2.0 genes in this pathway
黄成人组织茎模块 721 492 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇9的时间反应9 76 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VERHAAK GLIOBLASTOMA PRONEURAL 177 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向 682 433 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 米尔NA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-101 606 613 1A，M8 hsa-miR-101 uacaguacugauaacugaag
mir-141/200a 638 644 M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
hsa-miR-200a uaacacugucuguguguguaaacgaugu
米尔-144 607 613 1a HSA-MIR-144 UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG
米尔-182 1525 1531 1a HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-23 729 736 1A，M8 HSA-MIR-23Abrain AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
HSA-MIR-23Bbrain aucacauugccagggauuacc
mir-26 754 761 1A，M8 HSA-MIR-26Abrain UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC
HSA-MIR-26BSZ UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
mir-323 729 735 1a hsa-miR-323brain gcacauuacggucgaccucu
米尔-374 441 447 1a HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-539 322 328 1a hsa-miR-539 GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU
mir-9 1527 1533 1a HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga
mir-96 1524 1531 1A，M8 HSA-MIR-96brain uuuggcacuagcacauuuuugc
HSA-MIR-96brain uuuggcacuagcacauuuuugc