基因页：SLC1A3
概括？
| 基因 | 6507 |
| 象征 | SLC1A3 |
| 同义词 | ea6 | eaat1 | glast | glast1 |
| 描述 | Solute Carrier家族1成员3 |
| 参考 | MIM：600111|HGNC：HGNC：10941|Ensembl：ENSG00000079215|HPRD：02523|Vega：Otthumg0000000090793 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5p13 |
| Pascal P值 | 0.643 |
| 胎儿β | -0.875 |
| 支持 | 神经递质代谢 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：6 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PITPNM2 | 0.92 | 0.87 |
| MEF2D | 0.92 | 0.93 |
| iqsec2 | 0.92 | 0.87 |
| KIAA1045 | 0.91 | 0.90 |
| clstn1 | 0.91 | 0.90 |
| PIP5K1C | 0.91 | 0.89 |
| cry2 | 0.90 | 0.91 |
| TLN2 | 0.90 | 0.89 |
| grin1 | 0.89 | 0.88 |
| ptprn | 0.88 | 0.83 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| peci | -0.46 | -0.50 |
| Rab13 | -0.46 | -0.57 |
| AP002478.3 | -0.44 | -0.54 |
| myl12a | -0.43 | -0.55 |
| GNG11 | -0.43 | -0.52 |
| AL139819.3 | -0.43 | -0.50 |
| DBI | -0.43 | -0.52 |
| ACAA2 | -0.41 | -0.43 |
| C1orf54 | -0.40 | -0.49 |
| NSBP1 | -0.40 | -0.49 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005313 | L-谷氨酸跨膜转运蛋白活性 | 塔斯 | 谷氨酸（GO期限：9） | 7521911 |
| GO：0015293 | 分类者活动 | IEA | - | |
| GO：0017153 | 钠：二羧酸酯分类蛋白活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） | 7521911 |
| GO：0015813 | L-谷氨酸运输 | 塔斯 | 谷氨酸（GO期限：9） | 7521911 |
| 去：0001504 | 神经递质摄取 | 塔斯 | 神经元，胆碱能，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：8） | 8647279 |
| 去：0006835 | 二羧酸转运 | IEA | - | |
| 去：0006810 | 运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0043025 | 细胞体 | IEA | Axon，Dendrite（GO期限：4） | - |
| GO：0042995 | 细胞投影 | IEA | Axon（GO术语级别：4） | - |
| 去：0005624 | 膜分数 | 塔斯 | 7521911 | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 | 94 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 | 205 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Corre多发性骨髓瘤DN | 62 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨型性白血病DN | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌先进与早期 | 175 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 | 157 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向F | 185 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王食道癌与正常DN | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房6 7WK DN | 79 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ingram SHH靶向DN | 64 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时 | 176 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lenaour树突状细胞成熟DN | 128 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔老化的肾脏没有血液 | 222 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krasnoselskaya ILF3靶向DN | 46 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WELCSH BRCA1靶向DN | 141 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 | 88 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McCabe Hoxc6靶向 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Acevedo肝癌，H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西部肾上腺皮质肿瘤 | 294 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yauch刺猬信号传导旁分泌 | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stambolsky对维生素D3的反应 | 84 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lim乳腺腔内成熟DN | 99 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-22 | 1532年 | 1538年 | M8 | HSA-MIR-22脑 | Aagcugccaguugaagaacugu |
| mir-361 | 116 | 123 | 1A，M8 | HSA-MIR-361脑 | uuaucagaaucuccagggguac |
| mir-490 | 1540年 | 1546年 | M8 | HSA-MIR-490 | caaccuggaggacuaugcugcug |