概括
基因 6508
象征 SLC4A3
同义词 AE3 | SLC2C
描述 Solute Carrier家族4成员3
参考 MIM:106195|HGNC:HGNC:11029|ENSEMBL:ENSG00000114923|HPRD:00109|Vega:Otthumg0000000059238
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2Q36
Pascal P值 0.187
Sherlock P值 0.99
胎儿β -0.35
DMG 1(#研究)
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01016
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00916

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG27310720 2 220506611 SLC4A3 4.938E-4 0.421 0.047 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005452 无机阴离子交换器活动 IEA -
去:0005452 无机阴离子交换器活动 塔斯 7923606
去:0005215 转运蛋白活性 IEA -
去:0008509 阴离子跨膜转运蛋白活性 IEA -
GO:0015297 抗植物活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006820 阴离子运输 IEA -
去:0006810 运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005624 膜分数 塔斯 7923606
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 7923606

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN 169 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化Kras DN 142 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索B淋巴细胞网络 143 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
nguyen Notch1靶向 29 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JI对FSH的响应 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-122 227 233 M8 HSA-MIR-122A uggagugugacaaugguuuugu
mir-330 207 213 1a HSA-MIR-330 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA