基因页:SLC4A3
概括?
基因 | 6508 |
象征 | SLC4A3 |
同义词 | AE3 | SLC2C |
描述 | Solute Carrier家族4成员3 |
参考 | MIM:106195|HGNC:HGNC:11029|ENSEMBL:ENSG00000114923|HPRD:00109|Vega:Otthumg0000000059238 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2Q36 |
Pascal P值 | 0.187 |
Sherlock P值 | 0.99 |
胎儿β | -0.35 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.01016 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00916 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG27310720 | 2 | 220506611 | SLC4A3 | 4.938E-4 | 0.421 | 0.047 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC4A3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005452 | 无机阴离子交换器活动 | IEA | - | |
去:0005452 | 无机阴离子交换器活动 | 塔斯 | 7923606 | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
去:0008509 | 阴离子跨膜转运蛋白活性 | IEA | - | |
GO:0015297 | 抗植物活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006820 | 阴离子运输 | IEA | - | |
去:0006810 | 运输 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005624 | 膜分数 | 塔斯 | 7923606 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 7923606 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 | 94 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN | 169 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chiaradonna肿瘤转化Kras DN | 142 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巴索B淋巴细胞网络 | 143 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
nguyen Notch1靶向 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JI对FSH的响应 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-122 | 227 | 233 | M8 | HSA-MIR-122A | uggagugugacaaugguuuugu |
mir-330 | 207 | 213 | 1a | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |