基因页：SLC1A4

概括？
基因 6509
象征 SLC1A4
同义词 asct1 | satt | spatccm
描述 Solute Carrier家族1成员4
参考 MIM：600229|HGNC：HGNC：10942|ENSEMBL：ENSG00000115902|HPRD：02576|Vega：Otthumg00000129537
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P14
Pascal P值 0.686
Sherlock P值 0.548
胎儿β -0.039
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
元
支持 代谢性谷氨酸受体
神经递质代谢

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG00877964 2 65215638 SLC1A4 5.39e-11 -0.014 4.23E-7 DMG：JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4763076 CHR12 63677933 SLC1A4 6509 0.06 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLC22A17 0.88 0.90
leng4 0.87 0.88
PLD3 0.86 0.88
AP001107.1 0.85 0.90
TMEM130 0.84 0.90
TMEM59L 0.84 0.91
RHBDD2 0.83 0.87
RP11-401M16.2 0.83 0.86
pink1 0.83 0.88
BSCL2 0.82 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RBMX2 -0.44 -0.46
EIF5B -0.43 -0.47
GTF3C6 -0.39 -0.37
FAM36A -0.38 -0.32
AC005921.3 -0.38 -0.55
C21orf57 -0.37 -0.35
Anp32b -0.37 -0.44
baz1a -0.37 -0.52
anp32c -0.36 -0.41
CWF19L2 -0.36 -0.38

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005254 氯化物通道活性 艾达 8910405
GO：0015293 分类者活动 IEA -
去：0015195 L-苏氨酸跨膜转运蛋白活性 艾达 8340364
GO：0015194 L链透明膜转运蛋白活性 艾达 8101838|8340364|8910405
GO：0015193 L-丙烯跨膜转运蛋白活性 艾达 14502423
GO：0015184 L-晶章跨膜转运蛋白活性 艾达 8101838|8910405
GO：0015184 L-晶章跨膜转运蛋白活性 艾达 8340364
GO：0015180 L-丙氨酸跨膜转运蛋白活性 艾达 8101838|8340364|8910405
GO：0034590 L-羟基普罗林跨膜转运蛋白活性 艾达 14502423
GO：0017153 钠：二羧酸酯分类蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0035249 突触传输，谷氨酸能 nas 神经元，谷氨酸，突触，神经递质（GO期限：8） 16897601
GO：0015811 L-Cystine运输 艾达 8101838|8910405
GO：0015811 L-Cystine运输 艾达 8340364
GO：0015824 脯氨酸运输 艾达 14502423
GO：0015826 苏氨酸运输 艾达 8340364
GO：0015825 L塞林运输 艾达 8101838|8340364|8910405
GO：0015808 L-丙氨酸运输 艾达 8101838|8340364|8910405
去：0006835 二羧酸转运 IEA -
去：0006810 运输 IEA -
GO：0034589 羟基运输 艾达 14502423
GO：0050890 认识 小鬼 16897601
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005882 中间细丝 ISS -
去：0016020 膜 IEA -
去：0005887 质膜的积分 我知道了 8910405
GO：0042470 黑色素体 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
反应组氨基酸跨质膜的转运 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuetz乳腺癌导管侵入性DN 84 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
igarashi atf4靶向dn 90 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KHSV miRNAS DN的Samols目标 62 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘vmyb的目标 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌24小时DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mayburd对L663536的回应 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IGF1和IGF2的Pacher靶标 35 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 234 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson对砷的回应 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌DN 203 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 153 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过HIF1A的总缺氧 77 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML与PML RARA FUSION 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭亮氨酸剥夺 142 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc Up 54 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc TGFA UP 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc E2F1 UP 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheok对高清MTX的反应 23 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLI1融合的Zhang目标 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU遗传毒性损伤24小时 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成8 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染18小时 178 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙齿龋齿DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海勒被甲基化DN沉默 105 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee转移和替代剪接 74 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh他莫昔芬抵抗DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh对雌二醇的反应 61 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buckanovich T淋巴细胞在肿瘤DN上 24 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chung水泡细胞毒性 134 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chauhan对甲氧基雌二醇DN的反应 102 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee早期T淋巴细胞向上 107 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇10的时间反应10 69 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转换签名 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标增长 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 259 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delpuech FOXO3靶向DN 41 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang GATA2靶向DN 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 2667 2674 1A，M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 2667 2673 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC