SZGR2 - Beplay体育中心

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基因	6510
象征	SLC1A5
Synonyms	aaat \| asct2 \| atbo \| m7v1 \| m7vs1 \| r16 \| rdrc
Description	solute carrier family 1 member 5
Reference	MIM:109190\|HGNC:HGNC:10943\|Ensembl：ENSG00000105281\|HPRD：00173\|Vega：Otthumg00000183434
基因类型	蛋白质编码
Map location	19q13.3
Pascal p-value	0.256
Sherlock p-value	0.558
胎儿beta	0.312
DMG	1(# studies)
耶和华	Myers' cis & trans

Gene in Data Sources

基因集名称	Method of gene set	Description	信息
CV:PGCnp	全基因组关联研究	GWAS
DMG：Wockner_2014	全基因组DNA甲基化分析	该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。	1
PMID：COOCCUR	High-throughput literature-search	PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature	High-throughput literature-search	Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias	点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation

差异甲基化基因

Probe	染色体	位置	最近的基因	p（dis）	Beta (dis)	fdr（dis）	学习
cg03359362	19	47289611	SLC1A5	5.706E-4	-0.539	0.049	DMG：Wockner_2014

EQTL注释

SNP ID	染色体	位置	耶和华	Gene Entrez ID	QVALUE	EQTL类型
RS17013080	CHR1	208862652	SLC1A5	6510	0.18	反式
RS4844714	CHR1	208874118	SLC1A5	6510	0.04	反式
RS12097986	CHR1	208883360	SLC1A5	6510	0.12	反式
RS10014722	CHR4	54588016	SLC1A5	6510	0.02	反式
RS11723162	CHR4	54635757	SLC1A5	6510	0.16	反式
RS17775722	CHR9	26199256	SLC1A5	6510	0.14	反式
RS8072151	CHR17	50228268	SLC1A5	6510	0.01	反式
RS1344430	CHR20	60099390	SLC1A5	6510	0.08	反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共同表达的基因
Gene	Pearson's Correlation	斯皮尔曼的相关性
HLCS	0.82	0.85
SLC23A2	0.80	0.84
KIAA1109	0.80	0.85
KIAA0232	0.80	0.85
PALM2-AKAP2	0.80	0.85
kif21a	0.78	0.81
ACSL3	0.78	0.82
OSBPL2	0.78	0.79
jak1	0.78	0.83
cdc42bpa	0.78	0.83

Top 10 negatively co-expressed genes
Gene	Pearson's Correlation	斯皮尔曼的相关性
AF347015.21	-0.56	-0.57
HIGD1B	-0.54	-0.58
AF347015.31	-0.54	-0.57
CSAG1	-0.53	-0.53
FXYD1	-0.52	-0.52
C1orf54	-0.52	-0.60
C1orf61	-0.52	-0.62
ENHO	-0.52	-0.58
MT-CO2	-0.52	-0.55
SAT1	-0.51	-0.57

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键词	PubMed ID
GO:0004872	受体活性	TAS		10051606
去：0005515	蛋白质结合	IPI		17353931
去：0015293	symporter activity	IEA		-
去：0015175	neutral amino acid transmembrane transporter activity	IEA		-
去：0015175	neutral amino acid transmembrane transporter activity	TAS		10051606
去：0017153	钠：二羧酸酯分类蛋白活性	IEA		-
生物过程	去学期	证据	神经关键词	PubMed ID
GO:0015804	中性氨基酸转运	TAS		10051606
去：0006835	二羧酸转运	IEA		-
GO:0006810	运输	IEA		-
Cellular component	去学期	证据	神经关键词	PubMed ID
去：0005624	膜分数	TAS		8702519
去：0016020	membrane	IEA		-
去：0005887	integral to plasma membrane	TAS		8702519
去:0042470	melanosome	IEA		-

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	# SZGR 2.0 genes in pathway	信息
REACTOME AMINO ACID TRANSPORT ACROSS THE PLASMA MEMBRANE	31	21	All SZGR 2.0 genes in this pathway
小分子的反应组跨膜转运	413	270	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome SLC介导的跨膜转运	241	157	All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME TRANSPORT OF INORGANIC CATIONS ANIONS AND AMINO ACIDS OLIGOPEPTIDES	94	65	All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白	49	36	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DAVICIONI MOLECULAR ARMS VS ERMS DN	182	111	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gary CD5目标	473	314	All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨型性白血病	1382	904	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Basaki YBX1靶向	290	177	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Tien肠益生菌24小时DN	214	133	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION UP	1278	748	All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的甲状腺癌间变性	722	443	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应表皮上升	293	179	All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌加大	443	294	All SZGR 2.0 genes in this pathway
chiaradonna肿瘤转化Kras DN	142	95	All SZGR 2.0 genes in this pathway
chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN	153	100	All SZGR 2.0 genes in this pathway
markey RB1慢性洛夫	115	78	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Berenjeno由Rhoa DN转变	394	258	All SZGR 2.0 genes in this pathway
HAMAI通过TRAIL DN的凋亡	186	107	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lang MyB家庭目标	29	16	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlosser MYC靶标和血清反应	47	32	All SZGR 2.0 genes in this pathway
埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 2 Up	64	45	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP	309	199	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dairkee Tert目标	380	213	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络	1652	1023	All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 48HR UP	487	286	All SZGR 2.0 genes in this pathway
gotzmann上皮到间充质过渡dn	206	136	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Amit EGF响应480 HELA	164	118	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori小型Bii淋巴细胞向上	86	57	All SZGR 2.0 genes in this pathway
LE EGR2目标DN	108	84	All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭叶丁剥夺	142	93	All SZGR 2.0 genes in this pathway
史密斯·泰特（Smith Tert）的目标	145	91	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MANALO HYPOXIA DN	289	166	All SZGR 2.0 genes in this pathway
LIN APC目标	77	55	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL QTL TRANS	882	572	All SZGR 2.0 genes in this pathway
SHIPP DLBCL VS FOLLICULAR LYMPHOMA UP	45	30	All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭雷帕霉素反应dn	245	154	All SZGR 2.0 genes in this pathway
棕色髓样细胞发育DN	129	86	All SZGR 2.0 genes in this pathway
FERRANDO T ALL WITH MLL ENL FUSION DN	87	57	All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血成熟细胞	293	160	All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成5	126	78	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee Calorie限制肌肉	43	33	All SZGR 2.0 genes in this pathway
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡DN	287	208	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sesto对UV C7的响应	68	44	All SZGR 2.0 genes in this pathway
WELCSH BRCA1靶向DN	141	92	All SZGR 2.0 genes in this pathway
马尔基尼trabectedin抗性dn	49	34	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sansom Wnt途径需要MYC	58	43	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1靶向DN	543	317	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MARTINEZ TP53 TARGETS DN	593	372	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向	601	369	All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌易于反应E2	28	21	All SZGR 2.0 genes in this pathway
对Salirasib的反应	245	159	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CXCR6和PTCH1的SASAI目标	13	9	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindstedt树突状细胞成熟D	68	44	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Aguirre胰腺癌复制号	298	174	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHEN METABOLIC SYNDROM NETWORK	1210	725	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4Me3和H3K27Me3	1069	729	All SZGR 2.0 genes in this pathway
清肝癌亚类增殖	178	108	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌亚类S1	237	159	All SZGR 2.0 genes in this pathway
马顿人维甲酸反应dn	841	431	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dutertre雌二醇反应6小时	229	149	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PILON KLF1 TARGETS DN	1972	1213	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Maekawa ATF2目标	24	19	All SZGR 2.0 genes in this pathway
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 8D	882	506	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA与H4K20me1标记结合	145	82	All SZGR 2.0 genes in this pathway
林乳腺干细胞向上	489	314	All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节microRNA注释

mirna家族	Target position			miRNA ID	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	miRNA ID	mirna seq
miR-122	577	583	1a	HSA-MIR-122A	uggagugugacaaugguuuugu
miR-137	599	605	1a	HSA-MIR-137	uauugcuuaagaauacgcguag

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击hereto see the list of SZ related miRNAs.
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击here查看与大脑相关的miRNA列表。

Gene Page:SLC1A5