基因页：UPF3A
Summary？
| GeneID | 65110 |
| 象征 | UPF3A |
| 同义词 | hupf3a | rent3a | upf3 |
| 描述 | UPF3胡说转录本的调节器同源物A（酵母） |
| 参考 | MIM：605530|HGNC：HGNC：20332|ENSEMBL：ENSG00000169062|HPRD：09274|Vega：Otthumg0000000017403 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 13q34 |
| Pascal P值 | 0.027 |
| Sherlock P值 | 0.321 |
| 胎儿β | 1.241 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG06756193 | 13 | 115046767 | UPF3A | 2.04e-9 | -0.009 | 1.65E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17392743 | CHR1 | 54764240 | UPF3A | 65110 | 0.05 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | UPF3A | 65110 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0003723 | RNA结合 | IEA | - | |
| 去：0005487 | 核质转运蛋白活性 | nas | 11163187 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15231747 | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000184 | 核转录的mRNA分解代谢过程，废话介导的衰减 | nas | 11163187 | |
| 去：0006810 | 反式port | IEA | - | |
| GO：0051028 | mRNA运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | nas | 11163187 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | nas | 11163187 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| DCP2 | FLJ33245 |nudt20 | DCP2开瓶酶同系物(酵母) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14527413 |
| Exosc10 | PM-SCL |PM/SCL-100 |PMSCL |PMSCL2 |RRP6 |RRP6P |P2 |P3 |P4 | 外泌体组件10 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14527413 |
| exosc2 | RRP4 |RRP4P |HRRP4P |P7 | 外泌体组件2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14527413 |
| exosc4 | FLJ20591 |RRP41 |RRP41A |RRP41P |Ski6 |Ski6p |HRRP41P |P12A | 外泌体组件4 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14527413 |
| GSK3B | - | 糖原合酶激酶3β | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
| HBB | CD113T-C | 血红蛋白，β | 蛋白-RNA | Biogrid | 11163187 |
| HNRNPA1 | HNRPA1 |MGC102835 | 异质核核糖核蛋白A1 | - | HPRD | 11546873 |
| ifitm2 | 1-8D | 干扰素诱导的跨膜蛋白2（1-8D） | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
| NXF1 | DKFZP667O0311 |MEX67 |轻敲 | 核RNA输出因子1 | - | HPRD | 11546873 |
| 帕恩 | 担 | 聚（A）特异性核糖核酸酶（denenyylation核酸酶） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14527413 |
| RBM8A | bov-1a |bov-1b |bov-1c |MDS014 |RBM8 |RBM8B |Y14 |Znrp |ZRNP1 | RNA结合基序蛋白8a | - | HPRD，Biogrid | 11546873 |
| SMG1 | 61e3.4 |atx |KIAA0421 |唇 | PI-3-激酶相关激酶SMG-1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11544179 |
| thoc4 | Aly |bef | 综合体4 | - | HPRD | 11546873 |
| UPF1 | FLJ43809 |FLJ46894 |hupf1 |KIAA0221 |Norf1 |出租1 |PNORF1 | UPF1胡说笔录同源物（酵母）的调节剂 | - | HPRD，Biogrid | 11163187 |
| UPF2 | DKFZP434D222 |hupf2 |KIAA1408 |MGC138834 |MGC138835 |出租2 |SMG-3 | UPF2胡说转录本同源物（酵母）的调节剂 | - | HPRD，Biogrid | 11163187 |
| UPF3B | hupf3b |MRXS14 |rent3b |UPF3X | UPF3胡说转录本同源B（酵母）的调节剂 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14527413 |
| XRN1 | DKFZP434P0721 |DKFZP686B22225 |DKFZP686F19113 |FLJ41903 |Sep1 | 5'-3'Exoribonclelease 1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14527413 |