概括
基因 6518
象征 SLC2A5
同义词 Glut-5 | Glut5
描述 Solute Carrier家族2成员5
参考 MIM:138230|HGNC:HGNC:11010|HPRD:00690|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p36.2
Pascal P值 0.804
Sherlock P值 0.466
胎儿β -1.622
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23737366 1 9149026 SLC2A5 2.57E-7 0.481 0.005 DMG:Wockner_2014
CG21689824 1 9134618 SLC2A5 1.137E-4 0.293 0.029 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17013080 CHR1 208862652 SLC2A5 6518 0.04 反式
RS4844714 CHR1 208874118 SLC2A5 6518 0.02 反式
RS10494904 CHR1 208883320 SLC2A5 6518 0.1 反式
RS12097986 CHR1 208883360 SLC2A5 6518 0.1 反式
RS6742742 CHR2 46385970 SLC2A5 6518 0.15 反式
RS281471 CHR2 46403888 SLC2A5 6518 0.12 反式
RS1448219 CHR2 46407927 SLC2A5 6518 0.09 反式
RS10014722 CHR4 54588016 SLC2A5 6518 0.03 反式
RS2590764 CHR4 54614953 SLC2A5 6518 0.18 反式
RS2059867 CHR5 31765789 SLC2A5 6518 0.05 反式
RS2072161 CHR7 105662460 SLC2A5 6518 0.15 反式
RS1638755 CHR7 157552811 SLC2A5 6518 0.12 反式
RS17111364 Chr10 97901813 SLC2A5 6518 0.09 反式
RS10743139 Chr11 10425326 SLC2A5 6518 0.07 反式
RS16913876 Chr11 88102738 SLC2A5 6518 0.13 反式
RS11216730 Chr11 117918701 SLC2A5 6518 0.06 反式
RS17076272 CHR13 22726361 SLC2A5 6518 0 反式
RS17076274 CHR13 22726381 SLC2A5 6518 0 反式
RS16979494 Chrx 14301660 SLC2A5 6518 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 89 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组促进NA独立的葡萄糖转运蛋白 12 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoebeke淋巴干细胞向上 95 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 157 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWS FLI1融合DN的Siligan目标 18 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房3 4WK 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房5 6WK DN 137 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP 197 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MYC增强的Schlosser血清反应 108 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TP53和MYC DN的CEBALLOS目标 38 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲2FC DN 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shipp DLBCL治愈与致命DN 45 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索CD40信号传导DN 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan V2晚分化基因 45 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD T淋巴细胞和NK祖细胞DN 63 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU HBX目标3 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园维甲酸的反应 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园维甲酸的反应和PML RARA FUSION 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园维甲酸响应和RARA PLZF融合 22 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 228 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
角色glis3目标 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因