基因页:SLC2A5
概括?
基因 | 6518 |
象征 | SLC2A5 |
同义词 | Glut-5 | Glut5 |
描述 | Solute Carrier家族2成员5 |
参考 | MIM:138230|HGNC:HGNC:11010|HPRD:00690| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p36.2 |
Pascal P值 | 0.804 |
Sherlock P值 | 0.466 |
胎儿β | -1.622 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23737366 | 1 | 9149026 | SLC2A5 | 2.57E-7 | 0.481 | 0.005 | DMG:Wockner_2014 |
CG21689824 | 1 | 9134618 | SLC2A5 | 1.137E-4 | 0.293 | 0.029 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17013080 | CHR1 | 208862652 | SLC2A5 | 6518 | 0.04 | 反式 | ||
RS4844714 | CHR1 | 208874118 | SLC2A5 | 6518 | 0.02 | 反式 | ||
RS10494904 | CHR1 | 208883320 | SLC2A5 | 6518 | 0.1 | 反式 | ||
RS12097986 | CHR1 | 208883360 | SLC2A5 | 6518 | 0.1 | 反式 | ||
RS6742742 | CHR2 | 46385970 | SLC2A5 | 6518 | 0.15 | 反式 | ||
RS281471 | CHR2 | 46403888 | SLC2A5 | 6518 | 0.12 | 反式 | ||
RS1448219 | CHR2 | 46407927 | SLC2A5 | 6518 | 0.09 | 反式 | ||
RS10014722 | CHR4 | 54588016 | SLC2A5 | 6518 | 0.03 | 反式 | ||
RS2590764 | CHR4 | 54614953 | SLC2A5 | 6518 | 0.18 | 反式 | ||
RS2059867 | CHR5 | 31765789 | SLC2A5 | 6518 | 0.05 | 反式 | ||
RS2072161 | CHR7 | 105662460 | SLC2A5 | 6518 | 0.15 | 反式 | ||
RS1638755 | CHR7 | 157552811 | SLC2A5 | 6518 | 0.12 | 反式 | ||
RS17111364 | Chr10 | 97901813 | SLC2A5 | 6518 | 0.09 | 反式 | ||
RS10743139 | Chr11 | 10425326 | SLC2A5 | 6518 | 0.07 | 反式 | ||
RS16913876 | Chr11 | 88102738 | SLC2A5 | 6518 | 0.13 | 反式 | ||
RS11216730 | Chr11 | 117918701 | SLC2A5 | 6518 | 0.06 | 反式 | ||
RS17076272 | CHR13 | 22726361 | SLC2A5 | 6518 | 0 | 反式 | ||
RS17076274 | CHR13 | 22726381 | SLC2A5 | 6518 | 0 | 反式 | ||
RS16979494 | Chrx | 14301660 | SLC2A5 | 6518 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 | 89 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组促进NA独立的葡萄糖转运蛋白 | 12 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoebeke淋巴干细胞向上 | 95 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 | 157 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWS FLI1融合DN的Siligan目标 | 18 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房3 4WK | 214 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房5 6WK DN | 137 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP | 197 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MYC增强的Schlosser血清反应 | 108 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TP53和MYC DN的CEBALLOS目标 | 38 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲2FC DN | 21 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shipp DLBCL治愈与致命DN | 45 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard BMYB Morpholino DN | 200 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巴索CD40信号传导DN | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan V2晚分化基因 | 45 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HADDAD T淋巴细胞和NK祖细胞DN | 63 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WU HBX目标3 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
公园维甲酸的反应 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
公园维甲酸的反应和PML RARA FUSION | 30 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
公园维甲酸响应和RARA PLZF融合 | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌ESR1 DN | 240 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 | 228 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
角色glis3目标 | 37 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |