概括
基因 6521
象征 SLC4A1
同义词 ae1 | bnd3 | cd233 | chc | di | empb3 | epb3 | fr | rta1a | sao | sph4 | sw | wd | wd | wd1 | wr
描述 Solute Carrier家族4成员1(Diego Blood Group)
参考 MIM:109270|HGNC:HGNC:11027|Ensembl:ENSG00000004939|HPRD:00175|Vega:Otthumg00000156843
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q21.31
Pascal P值 0.033
主持人 小脑半球
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 离子平衡

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.061

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS443832 CHR16 83779643 SLC4A1 6521 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
tyw3 0.78 0.54
necab1 0.78 0.66
SLC3A1 0.75 0.72
GLIPR1 0.74 0.67
EIF5A2 0.73 0.67
Napepld 0.72 0.63
FGFR1OP2 0.72 0.68
ENPP4 0.72 0.67
KRT222P 0.72 0.73
NCOA7 0.72 0.70
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TBC1D10A -0.39 -0.35
OLFM2 -0.39 -0.34
Bcl7c -0.34 -0.43
WDR86 -0.34 -0.40
NME4 -0.34 -0.48
sigirr -0.34 -0.45
emid1 -0.34 -0.38
FADS2 -0.34 -0.31
SEMA4B -0.33 -0.33
EFEMP2 -0.33 -0.40

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003674 Molecular_Function nd -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 16669616
去:0005452 无机阴离子交换器活动 IEA -
去:0005215 转运蛋白活性 IEA -
去:0008509 阴离子跨膜转运蛋白活性 IEA -
去:0008509 阴离子跨膜转运蛋白活性 塔斯 4027230
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008150 生物_Process nd -
去:0006820 阴离子运输 IEA -
去:0006820 阴离子运输 塔斯 4027230
去:0006810 运输 IEA -
去:0006873 细胞离子稳态 塔斯 8841202
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 nas 1527044
去:0005887 质膜的积分 塔斯 4027230
去:0030863 皮质细胞骨架 艾达 16669616

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斋丁嫩造血干细胞DN 226 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TP53和MYC DN的CEBALLOS目标 38 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang造血细胞数大与微小的DN 45 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Welch GATA1目标 22 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
郭十六进制靶向DN 65 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化小脑DN 86 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老肌肉DN 123 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏DN 145 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF LCP带有H3K27ME3 70 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常衰老 93 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇2的时间反应2 86 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦纳红细胞膜基因 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因