基因页:SLC4A1
概括?
基因 | 6521 |
象征 | SLC4A1 |
同义词 | ae1 | bnd3 | cd233 | chc | di | empb3 | epb3 | fr | rta1a | sao | sph4 | sw | wd | wd | wd1 | wr |
描述 | Solute Carrier家族4成员1(Diego Blood Group) |
参考 | MIM:109270|HGNC:HGNC:11027|Ensembl:ENSG00000004939|HPRD:00175|Vega:Otthumg00000156843 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q21.31 |
Pascal P值 | 0.033 |
主持人 | 小脑半球 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | 离子平衡 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.061 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS443832 | CHR16 | 83779643 | SLC4A1 | 6521 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC4A1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
tyw3 | 0.78 | 0.54 |
necab1 | 0.78 | 0.66 |
SLC3A1 | 0.75 | 0.72 |
GLIPR1 | 0.74 | 0.67 |
EIF5A2 | 0.73 | 0.67 |
Napepld | 0.72 | 0.63 |
FGFR1OP2 | 0.72 | 0.68 |
ENPP4 | 0.72 | 0.67 |
KRT222P | 0.72 | 0.73 |
NCOA7 | 0.72 | 0.70 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TBC1D10A | -0.39 | -0.35 |
OLFM2 | -0.39 | -0.34 |
Bcl7c | -0.34 | -0.43 |
WDR86 | -0.34 | -0.40 |
NME4 | -0.34 | -0.48 |
sigirr | -0.34 | -0.45 |
emid1 | -0.34 | -0.38 |
FADS2 | -0.34 | -0.31 |
SEMA4B | -0.33 | -0.33 |
EFEMP2 | -0.33 | -0.40 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16669616 | |
去:0005452 | 无机阴离子交换器活动 | IEA | - | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
去:0008509 | 阴离子跨膜转运蛋白活性 | IEA | - | |
去:0008509 | 阴离子跨膜转运蛋白活性 | 塔斯 | 4027230 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008150 | 生物_Process | nd | - | |
去:0006820 | 阴离子运输 | IEA | - | |
去:0006820 | 阴离子运输 | 塔斯 | 4027230 | |
去:0006810 | 运输 | IEA | - | |
去:0006873 | 细胞离子稳态 | 塔斯 | 8841202 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | nas | 1527044 | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 4027230 | |
去:0030863 | 皮质细胞骨架 | 艾达 | 16669616 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 | 94 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斋丁嫩造血干细胞DN | 226 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TP53和MYC DN的CEBALLOS目标 | 38 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
liang造血细胞数大与微小的DN | 45 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Welch GATA1目标 | 22 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
郭十六进制靶向DN | 65 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血成熟细胞 | 293 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee老化小脑DN | 86 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo衰老肌肉DN | 123 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏DN | 145 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Goldrath抗原反应 | 346 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF LCP带有H3K27ME3 | 70 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng Werner综合征和正常衰老 | 93 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇2的时间反应2 | 86 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦纳红细胞膜基因 | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |