基因页：SLC4A2
概括？
| 基因 | 6522 |
| 象征 | SLC4A2 |
| 同义词 | ae2 | bnd3l | epb3l1 | hkb3 | nbnd3 |
| 描述 | Solute Carrier家族4成员2 |
| 参考 | MIM：109280|HGNC：HGNC：11028|ENSEMBL：ENSG00000164889|HPRD：02728|Vega：Otthumg00000158443 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7q36.1 |
| Pascal P值 | 6.424e-4 |
| Sherlock P值 | 0.509 |
| 胎儿β | -0.067 |
| DMG | 2（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG10336600 | 7 | 150756561 | SLC4A2 | 2.404E-4 | -0.234 | 0.037 | DMG：Wockner_2014 |
| CG21804273 | 7 | 150756518 | SLC4A2 | 4.84e-8 | -0.016 | 1.3e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PLD1 | 0.95 | 0.82 |
| ABCA8 | 0.94 | 0.74 |
| ERMP1 | 0.94 | 0.86 |
| UGT8 | 0.94 | 0.72 |
| endod1 | 0.93 | 0.85 |
| Gldn | 0.92 | 0.74 |
| 安尔 | 0.92 | 0.79 |
| myo1d | 0.92 | 0.83 |
| synj2 | 0.92 | 0.82 |
| PIP5K2A | 0.92 | 0.85 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC006276.2 | -0.50 | -0.56 |
| RPL35 | -0.49 | -0.68 |
| TBC1D10A | -0.49 | -0.44 |
| RPL36 | -0.48 | -0.67 |
| Bcl7c | -0.47 | -0.56 |
| SCNM1 | -0.47 | -0.53 |
| RPL12 | -0.47 | -0.58 |
| RPL27 | -0.46 | -0.64 |
| FAM128A | -0.45 | -0.52 |
| RPLP1 | -0.45 | -0.59 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 | 94 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9 Fusion 6hr DN的Takeda目标 | 41 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ouellet培养的卵巢癌侵入性与LMP UP | 69 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牛津拉拉或拉尔布靶向DN | 24 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛克伍德在肺癌中放大 | 214 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿斯顿主要抑郁症DN | 160 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard BMYB Morpholino DN | 200 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 费尔南德斯（Fernandez）由迈克（Myc）约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein Midbrain标记 | 82 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Matzuk精子分化 | 37 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标2 UP | 140 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |