基因页:SLC5A5
概括?
基因 | 6528 |
象征 | SLC5A5 |
同义词 | NIS | TDH1 |
描述 | Solute Carrier家族5成员5 |
参考 | MIM:601843|HGNC:HGNC:11040|ENSEMBL:ENSG00000105641|HPRD:03504|Vega:Otthumg00000183447 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19p13.11 |
Pascal P值 | 0.064 |
胎儿β | -1.249 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 6 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG20557202 | 19 | 17982930 | SLC5A5 | 8.51E-5 | -0.487 | 0.026 | DMG:Wockner_2014 |
CG06697339 | 19 | 17982759 | SLC5A5 | 1.342E-4 | -0.617 | 0.031 | DMG:Wockner_2014 |
CG21477717 | 19 | 17982682 | SLC5A5 | 1.631E-4 | -0.36 | 0.033 | DMG:Wockner_2014 |
CG26230674 | 19 | 17982925 | SLC5A5 | 1.7E-4 | -0.628 | 0.033 | DMG:Wockner_2014 |
CG01655355 | 19 | 17982748 | SLC5A5 | 2.46E-4 | -0.512 | 0.037 | DMG:Wockner_2014 |
CG24065770 | 19 | 17982700 | SLC5A5 | 4.854e-4 | -0.485 | 0.046 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7370564 | 0 | SLC5A5 | 6528 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC5A5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胺衍生的激素 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 | 94 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU HGF靶向Akt1 DN抑制 | 95 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |