概括
基因 6528
象征 SLC5A5
同义词 NIS | TDH1
描述 Solute Carrier家族5成员5
参考 MIM:601843|HGNC:HGNC:11040|ENSEMBL:ENSG00000105641|HPRD:03504|Vega:Otthumg00000183447
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p13.11
Pascal P值 0.064
胎儿β -1.249
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 6

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG20557202 19 17982930 SLC5A5 8.51E-5 -0.487 0.026 DMG:Wockner_2014
CG06697339 19 17982759 SLC5A5 1.342E-4 -0.617 0.031 DMG:Wockner_2014
CG21477717 19 17982682 SLC5A5 1.631E-4 -0.36 0.033 DMG:Wockner_2014
CG26230674 19 17982925 SLC5A5 1.7E-4 -0.628 0.033 DMG:Wockner_2014
CG01655355 19 17982748 SLC5A5 2.46E-4 -0.512 0.037 DMG:Wockner_2014
CG24065770 19 17982700 SLC5A5 4.854e-4 -0.485 0.046 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7370564 0 SLC5A5 6528 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
氨基酸和衍生物的反应组代谢 200 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胺衍生的激素 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU HGF靶向Akt1 DN抑制 95 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因