基因页：SLC6A2
概括？
| 基因 | 6530 |
| 象征 | SLC6A2 |
| 同义词 | nat1 | net | net1 | slc6a5 |
| 描述 | Solute Carrier家族6成员2 |
| 参考 | MIM：163970|HGNC：HGNC：11048|ENSEMBL：ENSG00000103546|HPRD：01232|Vega：Otthumg00000133208 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16Q12.2 |
| Pascal P值 | 0.439 |
| 胎儿β | 0.359 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
| 支持 | 神经递质代谢 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ADT：SUN_2012 | 系统研究抗精神病药及其靶标 | 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：4 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16869851 | CHR4 | 20690056 | SLC6A2 | 6530 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CMTM6 | 0.74 | 0.70 |
| TMBIM6 | 0.73 | 0.58 |
| CYP2U1 | 0.71 | 0.65 |
| pttg1ip | 0.70 | 0.53 |
| AP000872.1 | 0.70 | 0.62 |
| NXT2 | 0.70 | 0.46 |
| TRAM1 | 0.69 | 0.63 |
| ano6 | 0.68 | 0.70 |
| 9月2日 | 0.68 | 0.55 |
| SLC35F5 | 0.67 | 0.64 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC098691.2 | -0.39 | -0.46 |
| AL022328.1 | -0.35 | -0.35 |
| AF347015.21 | -0.33 | -0.40 |
| FXYD1 | -0.32 | -0.37 |
| AC104794.1 | -0.32 | -0.30 |
| AC018755.7 | -0.32 | -0.34 |
| apoc1 | -0.30 | -0.29 |
| S100A13 | -0.29 | -0.34 |
| myl3 | -0.29 | -0.34 |
| AF347015.18 | -0.29 | -0.37 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005334 | 去甲肾上腺素：钠对孢子活性 | 塔斯 | 神经递质（GO期限：10） | 2008212 |
| 去：0005328 | 神经递质：钠合作蛋白活性 | IEA | 神经递质（GO期限：9） | - |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 11343649 | |
| 去：0008504 | 单胺跨膜转运蛋白活性 | 艾达 | 16024787 | |
| GO：0015293 | 分类者活动 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） | 2008212 |
| 去：0006836 | 神经递质运输 | IEA | 神经元，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO：0015844 | 单胺运输 | 艾达 | 16024787 | |
| GO：0048265 | 对疼痛的反应 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005624 | 膜分数 | 塔斯 | 2008212 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005739 | 线粒体 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 2008212 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 | 89 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Na Cl依赖性神经递质转运蛋白 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome胺化合物SLC转运蛋白 | 27 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 环氧素DN的浓凋亡 | 172 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Roylance乳腺癌16Q副本编号DN | 26 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ropero HDAC2目标 | 114 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lian Lipa目标6m | 74 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bandres对Carmustin Mgmt的反应48小时 | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamashita在前列腺癌中甲基化 | 57 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 | 159 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindstedt树突状细胞成熟D | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G6 UP | 65 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌亚类S2 | 115 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |