基因页：SLC6A6
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| 基因 | 6533 |
| 象征 | SLC6A6 |
| 同义词 | 拉紧 |
| Description | Solute Carrier家族6成员6 |
| Reference | MIM:186854|HGNC：HGNC：11052|ENSEMBL：ENSG00000131389|HPRD:01734|Vega:OTTHUMG00000155525 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3P25.1 |
| Pascal P值 | 0.007 |
| DMG | 1(# studies) |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 皮质 |
| 支持 | 细胞代谢 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
| GSMA_I | Genome scan meta-analysis | Psr: 0.006 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：3 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | Beta (dis) | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG21291896 | 3 | 14444133 | SLC6A6 | -0.025 | 0.71 | DMG：Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
No co-expressed genes in brain regions
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005369 | 牛磺酸：钠合作蛋白活性 | IEA | 神经递质（GO期限：10） | - |
| 去：0005369 | 牛磺酸：钠合作蛋白活性 | TAS | 神经递质（GO期限：10） | 8010975 |
| 去：0001761 | β-丙氨酸跨膜转运蛋白活性 | IEA | - | |
| GO：0015293 | symporter activity | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006836 | 神经递质运输 | IEA | 神经元，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO:0001762 | β-丙氨酸运输 | IEA | - | |
| 去：0006520 | 氨基酸代谢过程 | TAS | 8010975 | |
| GO:0015734 | 牛磺酸运输 | IEA | - | |
| 蜂窝组件 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0016020 | membrane | IEA | - | |
| 去：0005887 | integral to plasma membrane | IEA | - |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-128 | 3944 | 3950 | 1a | hsa-miR-128a | ucacagugaaccggucuuuu |
| hsa-miR-128b | ucacagugaaccggucuuc | ||||
| miR-133 | 1114 | 1120 | 1a | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
| HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||
| miR-137 | 408 | 414 | M8 | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
| mir-182 | 634 | 640 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
| mir-183 | 1617年 | 1623年 | M8 | HSA-MIR-183 | uauggcacugguagaauucacug |
| miR-200bc/429 | 2168 | 2174 | M8 | hsa-miR-200b | uaauacugccugguaaugaugac |
| hsa-miR-200c | UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG | ||||
| hsa-miR-429 | UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU | ||||
| mir-203.1 | 4321 | 4327 | M8 | hsa-miR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
| mir-217 | 4156 | 4162 | 1a | hsa-miR-217 | uacugcaucagaacugauuggau |
| mir-218 | 3961 | 3967 | 1a | hsa-miR-218brain | UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU |
| mir-26 | 366 | 372 | 1a | HSA-MIR-26Abrain | UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC |
| HSA-MIR-26BSZ | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
| mir-27 | 3944 | 3950 | M8 | HSA-MIR-27Abrain | uucacaguggcuaaguuccgc |
| HSA-MIR-27Bbrain | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
| mir-30-5p | 69 | 75 | 1a | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
| hsa-miR-30cbrain | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
| hsa-miR-30dSZ | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
| hsa-miR-30bSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||
| mir-31 | 380 | 387 | 1A，M8 | HSA-MIR-31 | Aggcaagaugcuggcauagcug |
| miR-384 | 3076 | 3082 | M8 | HSA-MIR-384 | auuccuagaaauuguucaua |
| miR-490 | 65 | 71 | M8 | HSA-MIR-490 | caaccuggaggacuaugcugcug |
| miR-493-5p | 210 | 216 | 1a | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
| miR-542-3p | 116 | 122 | 1a | HSA-MIR-542-3P | UGUGACAGAUUGAUAACUGAAA |
| mir-9 | 2257 | 2264 | 1A，M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |
| mir-96 | 634 | 640 | 1a | HSA-MIR-96brain | uuuggcacuagcacauuuuugc |