基因页：NCF1
概括？
| 基因 | 653361 |
| 象征 | NCF1 |
| 同义词 | ncf1a | noxo2 | sh3pxd1a | p47phox |
| 描述 | 中性粒细胞胞质因子1 |
| 参考 | MIM：608512|HGNC：HGNC：7660|ENSEMBL：ENSG00000158517|Vega：Otthumg00000149965 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7q11.23 |
| Pascal P值 | 0.009 |
| Sherlock P值 | 0.585 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17013080 | CHR1 | 208862652 | NCF1 | 653361 | 0.14 | 反式 | ||
| RS4844714 | CHR1 | 208874118 | NCF1 | 653361 | 0.06 | 反式 | ||
| RS16827560 | CHR2 | 148370349 | NCF1 | 653361 | 0.11 | 反式 | ||
| RS13076961 | CHR3 | 145745812 | NCF1 | 653361 | 0.14 | 反式 | ||
| SNP_A-1878583 | 0 | NCF1 | 653361 | 0.03 | 反式 | |||
| RS16999761 | CHR4 | 107454800 | NCF1 | 653361 | 0.06 | 反式 | ||
| RS10517578 | CHR4 | 154648151 | NCF1 | 653361 | 0.17 | 反式 | ||
| RS17030417 | CHR4 | 154670812 | NCF1 | 653361 | 0.07 | 反式 | ||
| RS11732581 | CHR4 | 154720237 | NCF1 | 653361 | 0.11 | 反式 | ||
| RS10038062 | CHR5 | 35220518 | NCF1 | 653361 | 0.04 | 反式 | ||
| RS7731153 | CHR5 | 35220864 | NCF1 | 653361 | 0.04 | 反式 | ||
| RS10940060 | CHR5 | 65712524 | NCF1 | 653361 | 0.13 | 反式 | ||
| RS6862998 | CHR5 | 124365920 | NCF1 | 653361 | 0.19 | 反式 | ||
| RS6862844 | CHR5 | 124365966 | NCF1 | 653361 | 0.19 | 反式 | ||
| RS17116175 | CHR5 | 153844992 | NCF1 | 653361 | 0.18 | 反式 | ||
| RS7754123 | CHR6 | 132667231 | NCF1 | 653361 | 0.04 | 反式 | ||
| RS1830326 | CHR7 | 56266838 | NCF1 | 653361 | 0.13 | 反式 | ||
| RS6959168 | CHR7 | 56288292 | NCF1 | 653361 | 0.03 | 反式 | ||
| RS1357741 | CHR7 | 56291169 | NCF1 | 653361 | 0.03 | 反式 | ||
| RS11489759 | CHR7 | 56393851 | NCF1 | 653361 | 0.06 | 反式 | ||
| RS7807249 | CHR7 | 131615735 | NCF1 | 653361 | 0 | 反式 | ||
| RS10828685 | Chr10 | 24975616 | NCF1 | 653361 | 0.02 | 反式 | ||
| RS17111391 | Chr10 | 97950485 | NCF1 | 653361 | 0.01 | 反式 | ||
| RS231348 | Chr11 | 2673680 | NCF1 | 653361 | 0.14 | 反式 | ||
| RS767957 | CHR12 | 119038434 | NCF1 | 653361 | 0.01 | 反式 | ||
| RS17076272 | CHR13 | 22726361 | NCF1 | 653361 | 0.04 | 反式 | ||
| RS17076274 | CHR13 | 22726381 | NCF1 | 653361 | 0.04 | 反式 | ||
| RS4814967 | CHR20 | 20209446 | NCF1 | 653361 | 0.03 | 反式 | ||
| RS16981724 | CHR20 | 20210644 | NCF1 | 653361 | 0.03 | 反式 | ||
| RS6114613 | CHR20 | 24277074 | NCF1 | 653361 | 0.19 | 反式 | ||
| RS6106843 | CHR20 | 24288460 | NCF1 | 653361 | 0.19 | 反式 | ||
| RS16993265 | CHR22 | 45396341 | NCF1 | 653361 | 0.11 | 反式 | ||
| RS16979494 | Chrx | 14301660 | NCF1 | 653361 | 0.13 | 反式 | ||
| RS5955544 | Chrx | 19246404 | NCF1 | 653361 | 0.12 | 反式 | ||
| RS6527909 | Chrx | 19265358 | NCF1 | 653361 | 0.02 | 反式 | ||
| RS16982879 | Chrx | 92924110 | NCF1 | 653361 | 0.04 | 反式 | ||
| RS5908820 | Chrx | 142941845 | NCF1 | 653361 | 0.04 | 反式 | ||
| RS7879274 | Chrx | 145592957 | NCF1 | 653361 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 来源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 动作 | PS1TP5BP1 | Actin，Beta | 远西方 | Biogrid | 11027608 |
| CSNK2B | CK2B |CK2N |CSK2B |g5a |MGC138222 |MGC138224 | 酪蛋白激酶2，β多肽 | 两个杂交 | Biogrid | 11485312 |
| Cyba | p22-phox | 细胞色素B-245，α多肽 | 重构的复合物 | Biogrid | 7938008 |
| IL4R | CD124 |IL4RA | 白介素4受体 | 体内 | Biogrid | 10369419 |
| KHDRBS1 | FLJ34027 |SAM68 |p62 | KH结构域含有RNA结合，信号转导相关1 | 重构的复合物 | Biogrid | 8766817 |
| MSN | - | Moesin | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 11716484 |
| NCF1 | FLJ79451 |NCF1A |noxo2 |SH3PXD1A |p47phox | 中性粒细胞胞质因子1 | 重构的复合物 | Biogrid | 7938008 |
| NCF2 | FLJ93058 |NCF-2 |noxa2 |p67-phox |p67phox | 中性粒细胞胞质因子2 | 共晶结构 远西方 蛋白质肽 重构的复合物 |
Biogrid | 7938008|10486263 |11733522|11796733 |12169629 |
| NCF4 | MGC3810 |NCF |p40phox |SH3PXD4 | 中性粒细胞胞质因子4，40KDA | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 9083043|11258927 |11796733 |
| Prkcb | MGC41878 |pkc-beta |PKCB |prkcb1 |PRKCB2 | 蛋白激酶C，β | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11120743 |
| prkdc | DNA-PKCS |dnapk |DNPK1 |hyrc |hyrc1 |XRCC7 |P350 | 蛋白激酶，DNA激活，催化多肽 | 生化活动 | Biogrid | 9914162 |
| Rela | MGC131774 |NFKB3 |P65 | V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A（Avian） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 12618429 |
| SYN1 | Syn1a |SYN1B |Syni | 突触i | 体内 | Biogrid | 10899172 |
| SYTL1 | FLJ14996 |JFC1 |SLP1 | 突触类似1 | 重构的复合物 | Biogrid | 11278853 |
| traf4 | CART1 |MLN62 |RNF83 | TNF受体相关因子4 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12023963 |
| trim9 | KIAA0282 |RNF91 |春天 | 三方基序9 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG趋化因子信号传导途径 | 190 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg fc伽马r介导的吞噬作用 | 97 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg白细胞跨内皮迁移 | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg Leishmania感染 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Rac1途径 | 54 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 威尔伦斯基对达拉普迪的回应 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Croonquist基质刺激DN | 13 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| croonquist nras发出信号 | 41 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Croonquist NRAS与基质刺激 | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |