基因页：SLC6A11
概括？
| 基因 | 6538 |
| 象征 | SLC6A11 |
| 同义词 | GAT-3 | GAT3 | GAT4 |
| 描述 | Solute Carrier家族6成员11 |
| 参考 | MIM：607952|HGNC：HGNC：11044|HPRD：06406| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3P25.3 |
| Pascal P值 | 0.008 |
| 胎儿β | -0.58 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.006 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 杯 | 0.86 | 0.86 |
| ABCF2 | 0.86 | 0.86 |
| CLCN6 | 0.85 | 0.85 |
| ube3b | 0.85 | 0.84 |
| RANBP9 | 0.84 | 0.83 |
| WAC | 0.84 | 0.85 |
| ube4b | 0.84 | 0.87 |
| DEPDC5 | 0.84 | 0.86 |
| COPG | 0.84 | 0.85 |
| pdcd6ip | 0.84 | 0.85 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.72 | -0.76 |
| AF347015.31 | -0.69 | -0.70 |
| MT-CO2 | -0.67 | -0.70 |
| VAMP5 | -0.67 | -0.72 |
| ifi27 | -0.67 | -0.71 |
| Metrn | -0.66 | -0.70 |
| S100A16 | -0.66 | -0.70 |
| C1orf54 | -0.66 | -0.73 |
| higd1b | -0.66 | -0.70 |
| FXYD1 | -0.65 | -0.68 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005332 | γ-氨基丁酸：钠合作蛋白活性 | IEA | GABA，神经递质（GO期限：11） | - |
| 去：0005328 | 神经递质：钠合作蛋白活性 | IEA | 神经递质（GO期限：9） | - |
| GO：0015293 | 分类者活动 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006836 | 神经递质运输 | IEA | 神经元，神经递质（GO期限：5） | - |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经递质释放周期 | 34 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 | 89 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Na Cl依赖性神经递质转运蛋白 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome胺化合物SLC转运蛋白 | 27 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GABA合成释放再摄取和降解 | 17 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| jazag tgfb1发出信号 | 108 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭亮氨酸剥夺 | 142 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hillion HMGA1目标 | 90 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hillion HMGA1B目标 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta EBNA1反相关 | 173 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verhaak胶质母细胞瘤经典 | 162 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |