基因页：SLC6A13

概括？
基因 6540
象征 SLC6A13
同义词 GAT-2 | GAT2 | GAT3
描述 Solute Carrier家族6成员13
参考 MIM：615097|HGNC：HGNC：11046|Ensembl：ENSG00000010379|HPRD：10239|Vega：Otthumg00000168053
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12p13.3
Pascal P值 0.811
Sherlock P值 0.936
胎儿β -0.22
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4654497 CHR1 4224557 SLC6A13 6540 0.12 反式
RS2976809 CHR3 125451738 SLC6A13 6540 0.13 反式
RS3110902 CHR7 65375101 SLC6A13 6540 0.14 反式
RS4725560 CHR7 139640566 SLC6A13 6540 0.15 反式
RS680372 CHR8 36999626 SLC6A13 6540 0.16 反式
RS7041951 Chr9 20275353 SLC6A13 6540 0.07 反式
RS10733768 Chr10 52667246 SLC6A13 6540 0.17 反式
RS11016704 Chr10 128989145 SLC6A13 6540 0.03 反式
RS481843 Chr11 116525866 SLC6A13 6540 0.06 反式
RS6589566 Chr11 116652422 SLC6A13 6540 0.01 反式
RS9529974 CHR13 72821935 SLC6A13 6540 0.1 反式
RS17540750 CHR17 75205144 SLC6A13 6540 0.05 反式
RS6095741 CHR20 48666589 SLC6A13 6540 0.03 反式
RS17255719 Chrx 12144766 SLC6A13 6540 0.13 反式
RS5991662 Chrx 43335796 SLC6A13 6540 0.1 反式
RS12556892 Chrx 93417735 SLC6A13 6540 0.17 反式
RS808754 Chrx 93438033 SLC6A13 6540 0.17 反式
RS6529399 Chrx 128763582 SLC6A13 6540 0.03 反式
RS3761581 Chrx 128789720 SLC6A13 6540 0.01 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PTOV1 0.93 0.86
TSEN34 0.93 0.89
WDR34 0.93 0.89
PPP4C 0.92 0.85
拉利 0.92 0.85
pycr1 0.92 0.87
Wrap53 0.92 0.82
NT5DC2 0.92 0.88
DDAH2 0.91 0.88
marcksl1 0.91 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.69 -0.71
AF347015.27 -0.66 -0.74
AF347015.31 -0.64 -0.73
CA4 -0.64 -0.68
MT-CO2 -0.63 -0.73
HLA-F -0.63 -0.61
AF347015.33 -0.63 -0.72
mt-cyb -0.62 -0.72
CCNI2 -0.62 -0.63
PLA2G4A -0.61 -0.68

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005328 神经递质：钠合作蛋白活性 IEA 神经递质（GO期限：9） -
GO：0015293 分类者活动 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006836 神经递质运输 IEA 神经元，神经递质（GO期限：5） -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0016020 膜 IEA -
去：0005887 质膜的积分 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
St Wnt Ca2环状GMP途径 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌与LMP1 DN 175 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 157 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 194 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
苏肾 15 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zamora NOS2靶向DN 96 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 LCP带有H3K27ME3 29 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLI1融合TOP20 DN的TORCHIA目标 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向 266 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因