基因页：SLC7A1

概括？
基因 6541
象征 SLC7A1
同义词 atrc1 | cat-1 | err | hcat1 | rec1l
描述 Solute Carrier家族7成员1
参考 MIM：104615|HGNC：HGNC：11057|ENSEMBL：ENSG00000139514|HPRD：00091|Vega：Otthumg0000000016658
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q12.3
Pascal P值 0.005
胎儿β 0.167
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
表达 基因表达的荟萃分析 p价值：1.48

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG02756849 13 30169825 SLC7A1 9.62e-5 -0.315 0.027 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Col4a1 0.73 0.58
COL4A2 0.72 0.57
FN1 0.69 0.62
MAPK1IP1L 0.69 0.69
PIAS3 0.69 0.71
NID1 0.69 0.60
Stra6 0.67 0.54
NID2 0.67 0.70
HSPG2 0.67 0.62
TM9SF4 0.66 0.75
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.50 -0.59
FXYD1 -0.48 -0.53
AF347015.33 -0.47 -0.52
AF347015.31 -0.47 -0.56
AF347015.27 -0.47 -0.54
AF347015.21 -0.46 -0.61
mt-cyb -0.46 -0.53
AF347015.8 -0.46 -0.55
S100B -0.45 -0.51
AF347015.26 -0.45 -0.53

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0004872 受体活性 IEA -
GO：0015171 氨基酸跨膜转运蛋白活性 IEA -
GO：0015181 精氨酸跨膜转运蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0015809 精氨酸运输 IEA -
去：0006810 运输 IEA -
去：0006810 运输 nas 1348489
去：0006865 氨基酸转运 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
去：0005887 质膜的积分 塔斯 1718082

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Biocarta No1途径 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组氨基酸跨质膜的转运 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌 206 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2的反应 146 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应黄色 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌24小时DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向 214 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向8小时 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹fungoides CD4 DN 116 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冷吉非替尼抵抗 85 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧化物素的浓凋亡 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dirmeier LMP1响应迟到 57 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA XPRSS INT网络 168 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA中心网络 117 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ozen mir125b1靶标 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘鼻咽癌 70 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与B淋巴细胞向上 78 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭亮氨酸剥夺 142 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移DN 121 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML Fab标记 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向 175 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindvall因TERT DN永生 80 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
POS组胺反应网络 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruiz TNC靶向DN 142 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存 73 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delpuech FOXO3靶向DN 41 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过KDM3A的Krieg缺氧 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-122 1091 1098 1A，M8 HSA-MIR-122A uggagugugacaaugguuuugu
mir-124/506 4576 4582 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-125/351 4388 4394 M8 HSA-MIR-125B脑 ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A脑 ucccugagacccuuaaccugug
mir-129-5p 4156 4163 1A，M8 HSA-MIR-129脑 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
mir-145 823 830 1A，M8 HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
mir-23 4921 4928 1A，M8 HSA-MIR-23A脑 aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B脑 aucacauugccagggauuacc
mir-323 4921 4927 1a HSA-MIR-323脑 gcacauuacggucgaccucu
mir-375 262 268 1a HSA-MIR-375 uuuguucguucggcucgcguga
mir-378 4418 4425 1A，M8 HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
mir-450 4156 4162 1a HSA-MIR-450 uuuuugcgauguuccuaaua