基因页：SLC7A2

概括？
基因 6542
象征 SLC7A2
同义词 atrc2 | cat2 | hcat2
描述 Solute Carrier家族7成员2
参考 MIM：601872|HGNC：HGNC：11060|Ensembl：ENSG00000003989|HPRD：03524|Vega：Otthumg00000130819
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p22
Pascal P值 0.213
胎儿β -0.792
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.031
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） PSR：0.00057
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.03086

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG26199576 8 17354335 SLC7A2 3.9e-8 -0.014 1.11E-5 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ermn 0.90 0.90
TMEM144 0.90 0.89
阿斯帕 0.88 0.90
UGT8 0.88 0.86
folh1 0.88 0.80
ABCA8 0.87 0.77
PLP1 0.87 0.89
CTNNA3 0.86 0.75
CDH19 0.86 0.85
ENPP2 0.86 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
nkiras2 -0.65 -0.73
KIAA1949 -0.64 -0.78
ZNF821 -0.64 -0.74
tubb2b -0.63 -0.80
C17orf70 -0.63 -0.74
Gmip -0.63 -0.75
PODXL2 -0.63 -0.72
CRMP1 -0.62 -0.72
DBN1 -0.62 -0.74
HN1 -0.62 -0.72

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0015174 碱性氨基酸跨膜转运蛋白活性 塔斯 8954799
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006520 氨基酸代谢过程 塔斯 8954799
去：0006810 运输 塔斯 8954799
去：0006865 氨基酸转运 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005624 膜分数 塔斯 8954799
去：0005737 细胞质 艾达 18029348
去：0016020 膜 IEA -
去：0005887 质膜的积分 塔斯 8954799

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
反应组氨基酸跨质膜的转运 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向F 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI mir34a目标 148 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对IKK抑制剂和TNF的反应 223 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sana tnf发出信号 83 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞 156 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向角质形成细胞 91 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 DN 170 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen Schwannoma DN 18 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn 88 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IRS1和IRS2的GUO目标 98 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang MLL目标 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔内成熟 116 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 1926年 1933年 1A，M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-15/16/195/424/497 5351 5357 M8 HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-27 2353 2359 1a HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc