概括
基因 6546
象征 SLC8A1
同义词 NCX1
描述 Solute Carrier家族8成员A1
参考 MIM:182305|HGNC:HGNC:11068|HPRD:01659|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P22.1
Pascal P值 0.003
胎儿β -1.044
支持 离子平衡
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
IQCK 0.62 0.55
TSNAXIP1 0.60 0.51
AC112484.1 0.58 0.54
IL13RA2 0.58 0.50
TXNDC6 0.57 0.45
意大利面8 0.57 0.50
KIF9 0.57 0.48
CCDC74A 0.57 0.44
GLB1L 0.57 0.50
WDR66 0.57 0.54
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.18 -0.31 -0.22
AF347015.21 -0.30 -0.19
AC098691.2 -0.29 -0.30
MT-ATP8 -0.28 -0.19
AF347015.2 -0.28 -0.18
AF347015.8 -0.27 -0.17
MT-CO2 -0.27 -0.17
anp32c -0.26 -0.28
AC100783.1 -0.26 -0.25
IL32 -0.25 -0.21

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg钙信号通路 178 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg心肌收缩 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肥厚性心肌病HCM 85 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG心律失常右心肌病ARVC 76 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG扩张心肌病 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板稳态 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板钙稳态 18 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 194 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga e2f1靶标由血清诱导 31 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PTCH1和SUFU DN的Lee目标 83 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP 89 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD2 45 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成9 92 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向 163 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌后期复发 62 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因