基因页:SLC8A1
概括?
基因 | 6546 |
象征 | SLC8A1 |
同义词 | NCX1 |
描述 | Solute Carrier家族8成员A1 |
参考 | MIM:182305|HGNC:HGNC:11068|HPRD:01659| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2P22.1 |
Pascal P值 | 0.003 |
胎儿β | -1.044 |
支持 | 离子平衡 COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC8A1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
IQCK | 0.62 | 0.55 |
TSNAXIP1 | 0.60 | 0.51 |
AC112484.1 | 0.58 | 0.54 |
IL13RA2 | 0.58 | 0.50 |
TXNDC6 | 0.57 | 0.45 |
意大利面8 | 0.57 | 0.50 |
KIF9 | 0.57 | 0.48 |
CCDC74A | 0.57 | 0.44 |
GLB1L | 0.57 | 0.50 |
WDR66 | 0.57 | 0.54 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.18 | -0.31 | -0.22 |
AF347015.21 | -0.30 | -0.19 |
AC098691.2 | -0.29 | -0.30 |
MT-ATP8 | -0.28 | -0.19 |
AF347015.2 | -0.28 | -0.18 |
AF347015.8 | -0.27 | -0.17 |
MT-CO2 | -0.27 | -0.17 |
anp32c | -0.26 | -0.28 |
AC100783.1 | -0.26 | -0.25 |
IL32 | -0.25 | -0.21 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg心肌收缩 | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG肥厚性心肌病HCM | 85 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG心律失常右心肌病ARVC | 76 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG扩张心肌病 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 | 94 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板稳态 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板钙稳态 | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 | 194 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga e2f1靶标由血清诱导 | 31 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PTCH1和SUFU DN的Lee目标 | 83 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP | 89 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD2 | 45 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成9 | 92 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN NPAS4靶向 | 163 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌后期复发 | 62 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karlsson TGFB1靶向 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |