基因页面:SLC8A3
总结吗?
GeneID | 6547年 |
象征 | SLC8A3 |
同义词 | NCX3 |
描述 | 溶质载体家庭8成员A3 |
参考 | MIM: 607991|HGNC: HGNC: 11070|运用:ENSG00000100678|HPRD: 09723|织女:OTTHUMG00000152342 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 14 q24.1 |
帕斯卡假定值 | 0.006 |
夏洛克假定值 | 0.275 |
胎儿β | -0.087 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | 离子平衡 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg05203877 | 14 | 70655686 | SLC8A3 | -0.029 | 0.27 | DMG: Nishioka_2013 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC8A3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ACAD10 | 0.80 | 0.81 |
PAN2 | 0.79 | 0.78 |
WDR59 | 0.78 | 0.76 |
MTHFSD | 0.78 | 0.76 |
WDR91 | 0.78 | 0.78 |
ATP8B2 | 0.77 | 0.78 |
NDST2 | 0.77 | 0.77 |
CRTC3 | 0.77 | 0.79 |
NPHP4 | 0.77 | 0.74 |
ZNF687 | 0.77 | 0.78 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.58 | -0.64 |
AF347015.31 | -0.54 | -0.54 |
GNG11 | -0.51 | -0.56 |
MT-CO2 | -0.51 | -0.53 |
AF347015.27 | -0.50 | -0.51 |
C5orf53 | -0.49 | -0.48 |
C1orf54 | -0.49 | -0.55 |
IL32 | -0.49 | -0.51 |
AF347015.8 | -0.48 | -0.50 |
SYCP3 | -0.48 | -0.53 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG钙信号通路 | 178年 | 134年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME小分子的跨膜运输 | 413年 | 270年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME SLC介导的跨膜运输 | 241年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME运输无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽 | 94年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME血小板体内平衡 | 78年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME血小板钙稳态 | 18 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME止血 | 466年 | 331年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
西普DLBCL治愈和致命的DN | 45 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LEIN中脑标记 | 82年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
近藤H3K27ME3前列腺癌 | 196年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
麦凯布受HOXC6 | 469年 | 239年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳人大HCP H3K4ME2 | 491年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群1 | 125年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群3 | 170年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群4 | 112年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群7 | 118年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王MLL目标 | 289年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |